在生物學研究中，幾乎一切都與結構有關，甚至可以說，功能也是結構的產物。因此，以亞細胞分辨率在空間原位進行多組學分析，對于生物學科學研究而言重要性不言而喻。Xenium 原位技術平臺可幫助用戶實現亞細胞分辨率的靶向基因和蛋白表達原位分析。該平臺可以將單分子 RNA 和蛋白檢測的功能與強大的光學元件、數據采集和精確解碼技術相結合，能夠以亞細胞分辨率在整張切片上快速檢測大量靶點的組織原位表達水平?？梢约嫒荻喾N樣品類型，包括新鮮冷凍（FF）組織和福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）組織。

1.  新鮮樣本：需要 OCT 包埋，干冰法或者異戊烷法皆可。

2.  石蠟樣本：需要送石蠟塊。（與空轉 V2 版本不同，Xenium 樣本只能貼在正式芯片上實驗，而非貼在白片上進行轉片，所以不能直送切片。）

3.  可貼片區域：10mm*22mm（大框區域 12*24mm，邊上“+”定位點不能被切片覆蓋）。

4.  可多樣本拼片（但同一芯片選擇的 panel 必須相同）。

Xenium 原位技術  Panel 列表

1. 人乳腺癌 panel：280 genes，可再定制 100 genes；

2. 小鼠腦 panel：248 genes，可再定制 100 genes；

3. 目前人和小鼠都有泛組織的 panel；

4. 后續我司也會預定制 panel：腫瘤、免疫、神經方向等。

1. Xenium 的實驗流程主要分四部分：組織切片、探針雜交與擴增、上機測試、數據分析；

2.  從組織切片到數據下機所需時間為：6- 8 天（依樣本貼片大小而增減上機時間，樣本覆蓋面越大，上機時間越長）。

Xenium 原位技術 - 下機數據

1.  網頁質控：基礎信息、提示警告或者錯誤信息；

2.  擬合的 DAPI 圖像：OME-TIFF（格式）；

3.  細胞切割和邊界信息：細胞核和細胞邊界坐標；

4.  亞細胞分辨率轉錄本定位（基因表達）信息：轉錄本定位和細胞分配信息；

5.  細胞 - 分析物表達矩陣：HDF5  和  MTX（后續可以直接進行分析）；

6.  后續分析：包含表達水平，細胞定位、分型，聚類，降維分析和差異表達。

1.  疾病組織異質性的量化評價；

2.  組織微環境免疫細胞組學深度分析；

3.  伴隨診斷組織空間標志物的篩選；

4.  藥物創新靶點的發現和藥物輔助開發。

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