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在表觀遺傳學快速發展的背景下，組蛋白翻譯后修飾逐漸成為生命科學研究的核心熱點。其中，組蛋白丙酰化（Histone Propionylation, Kpr）作為一種新興的賴氨酸酰化修飾，因其在代謝調控與基因表達中的潛在作用而備受關注。組蛋白丙酰化是一種發生在賴氨酸殘基上的酰基化修飾，其化學結構與乙酰化類似，但多了一個碳原子（C3）。這種微小的結構差異卻可能顯著影響染色質構象及轉錄調控。隨著研究的深入，如何高效、準確地鑒定和定量組蛋白丙酰化位點，成為蛋白組學與表觀遺傳學領域的重要技術挑戰。

一、組蛋白丙酰化分析的常用方法

1、質譜技術（Mass Spectrometry, MS）

（1）高分辨率LC-MS/MS分析

液相色譜-串聯質譜（LC-MS/MS）是目前鑒定組蛋白丙酰化位點的“金標準”。

技術特點：

• 高靈敏度與高分辨率（Orbitrap / TOF）
• 可同時鑒定多種PTMs
• 支持無偏倚篩選

關鍵流程：

• 組蛋白提取與純化
• 酶切（如Trypsin或Arg-C）
• 富集（可選）
• LC-MS/MS檢測
• 數據庫搜索與位點鑒定

在實際應用中，通過精確質量差（+56.026 Da）識別Kpr修飾，是區分其與其他酰化修飾的關鍵。

（2）定量蛋白組學

為了研究Kpr的動態變化，定量分析尤為重要：

• TMT/iTRAQ標記定量：適用于多樣本比較
• Label-free定量：無需標記，適合大規模篩選

這些方法可用于分析不同處理條件下丙酰化水平變化，如代謝干預、藥物處理等。

2、修飾肽富集技術

由于Kpr修飾豐度較低，直接上機檢測往往信號不足，因此需要富集步驟。

（1）抗體富集法

• 使用抗丙酰化賴氨酸（anti-Kpr）抗體
• 富集含Kpr修飾的肽段

優點：

• 提高檢測靈敏度
• 降低背景干擾

局限：

• 抗體特異性依賴性強
• 可能存在交叉識別（如乙酰化）

通過化學標記增強Kpr修飾的檢測能力，例如：酰化修飾特異性化學探針，Click chemistry標記。這種方法在提高特異性方面具有潛力，但技術復雜度較高。

3、Western Blot與免疫檢測

雖然不如質譜精確，但Western blot仍是驗證Kpr修飾的重要手段。

應用場景：

• 初步檢測是否存在丙酰化
• 驗證特定處理對Kpr水平的影響

關鍵點：

• 使用高特異性抗Kpr抗體
• 配合組蛋白H3/H4等內參

4、染色質免疫共沉淀測序（ChIP-seq）

ChIP-seq可用于研究Kpr在基因組上的分布情況，分析Kpr富集區域（啟動子、增強子等），結合RNA-seq解析功能。

挑戰：

• 抗體特異性仍是瓶頸
• 數據解釋復雜

5、多組學整合分析

近年來，單一技術已難以全面解析Kpr的功能，研究趨勢逐漸轉向多組學整合：

• 蛋白組學 + 代謝組學：關聯propionyl-CoA水平
• ChIP-seq + RNA-seq：解析調控網絡
• 空間組學：探索組織特異性分布

這種整合策略能夠更系統地揭示組蛋白丙酰化在細胞調控中的作用機制。

二、實驗設計建議與優化策略

為了獲得高質量的組蛋白丙酰化數據，建議注意以下幾點：

1、樣本處理

使用去乙酰化酶抑制劑（如HDAC inhibitors），避免蛋白降解與修飾丟失。

2、酶切優化

組蛋白富含賴氨酸，建議采用Arg-C或化學衍生策略，提高肽段覆蓋度。

3、數據分析

使用支持多種PTMs識別的軟件（如MaxQuant），設置合理的FDR閾值。

組蛋白丙酰化作為連接代謝與表觀遺傳的重要橋梁，其研究正處于快速發展階段。從高分辨率質譜到多組學整合分析，各類技術手段正在不斷提升我們對這一修飾的認知深度。在實際研究中，選擇合適的分析策略尤為關鍵。百泰派克生物科技依托先進的質譜平臺與成熟的蛋白組學解決方案，能夠為科研人員提供從樣本制備、修飾富集到數據分析的一站式組蛋白丙酰化分析服務，助力高水平科研成果的產出。如果您正在開展相關研究或面臨技術瓶頸，歡迎與我們交流，共同推進表觀遺傳學研究的前沿探索。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對蛋白質的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質，提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種蛋白質標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.專業生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，最后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術先進，填補技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從最小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等專業服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，專業提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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