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組蛋白泛素化（Histone ubiquitination）是表觀遺傳學調控中的關鍵修飾，它通過調節染色質結構影響基因表達、DNA損傷修復及腫瘤發生發展。在癌癥研究中，組蛋白泛素化的異常常與腫瘤進展、耐藥和免疫微環境相關，因此精準分析其狀態對靶點發現和臨床轉化具有重要意義。

一、組蛋白泛素化的基本原理

泛素化是通過泛素（Ub）共價連接到目標蛋白賴氨酸（K）殘基上的過程。對于組蛋白而言，常見的泛素化修飾位點包括：

• H2A-K119ub1：通常與基因沉默相關。
• H2B-K120ub1：與轉錄激活和DNA修復相關。

泛素化修飾復雜，包括單泛素化（monoubiquitination）和多聚泛素鏈（polyubiquitination），且其動態變化受泛素連接酶（E3 ligase）、去泛素化酶（DUBs）調控。在癌癥細胞中，這種修飾的異常往往反映基因調控網絡的紊亂。

二、癌癥樣本組蛋白泛素化的實驗策略

分析癌癥樣本中的組蛋白泛素化通常有兩條路線：免疫學方法和質譜組學方法。

1、免疫學檢測

（1）Western blot：使用針對特定泛素化位點的抗體，可定量不同樣本組蛋白泛素化水平。

• 優點：簡單、低成本。
• 缺點：只能檢測已知修飾位點，難以覆蓋全組蛋白泛素化譜。

（2）免疫沉淀（IP）：通過泛素抗體或組蛋白特異抗體富集修飾蛋白，再用WB或質譜分析。

• 優點：提高信噪比，能捕獲低豐度修飾。
• 注意：抗體特異性至關重要，避免交叉反應。

2、質譜組學（MS）分析

質譜是高通量、精準的組蛋白修飾分析工具，尤其適合癌癥樣本中復雜的泛素化譜研究。常用策略包括：

（1）樣本準備

組蛋白提取

• 常用酸提取法（0.4 N H2SO4）從核中富集組蛋白。
• 可保留各種修飾，同時去除非組蛋白污染。

蛋白酶解

• 通常使用胰蛋白酶（Trypsin）或Lys-C。
• 注意泛素化殘基會留下特征性的GlyGly（GG）殘基，MS可通過這個標記識別泛素化位點。

（2）富集策略

• 免疫親和富集：使用抗-GlyGly抗體富集泛素化肽段。
• 化學方法：利用泛素特異化學標簽（如TUBE）捕獲泛素化蛋白。
• 富集后的肽段能顯著提高低豐度組蛋白泛素化的檢測靈敏度。

（3）質譜分析

• LC-MS/MS（液相色譜-串聯質譜）是核心。
• 推薦高分辨率儀器（如Orbitrap系列）以確保肽段鑒定的準確性。
• 數據分析需使用GlyGly修飾搜索參數，軟件如MaxQuant或Proteome Discoverer。

3、數據分析與可視化

（1）定量分析

可采用Label-free或TMT標記法，比較癌癥組織與正常組織的組蛋白泛素化水平。

（2）位點特異性分析

識別關鍵泛素化位點（如H2A-K119ub1上調）。

（3）生物信息學整合

與轉錄組、甲基化、蛋白質互作網絡結合，解析泛素化在腫瘤中的功能意義。

三、組蛋白泛素化研究的應用前景

組蛋白泛素化研究不僅揭示了染色質調控的基本機制，還為理解腫瘤發生、基因表達異常和DNA修復提供了重要線索。通過定量分析不同組織或細胞狀態下的泛素化譜，可以識別關鍵調控位點，解析泛素化修飾與表觀遺傳網絡、轉錄調控及信號通路的關系。此外，泛素化的動態變化也為篩選潛在藥物靶點和評價治療干預效果提供了新的策略。現代質譜技術與高特異性抗體富集方法相結合，使低豐度組蛋白泛素化的檢測成為可能，為科研和臨床轉化奠定了堅實基礎。

癌癥樣本中組蛋白泛素化的分析結合免疫學檢測和質譜組學，不僅可以精準定位修飾位點、定量低豐度修飾，還能揭示其在染色質調控、基因表達和信號通路中的功能意義。通過高靈敏度質譜平臺、特異化抗體富集策略和生物信息學整合分析，科研人員能夠全面解析組蛋白泛素化譜，為癌癥機制研究、潛在藥物靶點發現以及臨床轉化提供可靠數據和科學依據。這一技術路線正是百泰派克生物科技在表觀遺傳組學研究領域提供的專業解決方案，助力科研人員從基礎發現到應用轉化的全流程創新。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對蛋白質的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質，提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種蛋白質標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.專業生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，最后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術先進，填補技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從最小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等專業服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，專業提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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