與AccelaTM高速液相色譜系統聯用，LTQ XL質譜是高通量分析的最佳工具。結合多種解離技術，包括PQD(脈沖碰撞解離）和ETD(電子轉移解離），LTQ XL提供最豐富的結構信息。廣泛應用于蛋白質組學、代謝物鑒定、藥物研發定量分析、法醫和臨床分析等領域。
LTQ新功能包括：1.可升級的電子轉移裂解（ETD)模塊可以提供傳統裂解方法無法得到的蛋白質翻譯后修飾信息；2.脈沖碰撞能量誘導解離（PQD)功能可以提供低質量端碎片離子信息。3.高選擇MS/MS分析給譜圖在數據庫和譜庫檢索更好的匹配，提高了結構確證的可靠性。另外快速極性切換，母離子相關MS3數據關聯掃描，可以對翻譯后修飾和代謝物組成的鑒定進行智能、快速分析，還可以和高端的回旋共振質譜組合成最先進的多級高分辨雜交質譜儀。4.自動數據依賴性多級質譜采集技術不僅為用戶提供預測代謝物（母離子列表）結構信息，也能提供未預測到的代謝物結構信息。此外使用自動固定中性丟失數據依賴性(CNL)掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物。使用MetworksTM和Mass FrontierTM分析軟件增強復雜基質中代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更簡便。

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