Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pA-Tn5)-文庫及構建-試劑-生物在線
南京諾唯贊生物科技股份有限公司
Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pA-Tn5)

Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pA-Tn5)

商家詢價

產品名稱: Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pA-Tn5)

英文名稱: Hyperactive In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina(pA-Tn5)

產品編號: TD902

產品價格: 0

產品產地: 南京

品牌商標: Vazyme

更新時間: 2023-09-20T18:40:31

使用范圍: null

南京諾唯贊生物科技股份有限公司
  • 聯系人 :
  • 地址 : 南京市經濟技術開發區紅楓科技園C2棟
  • 郵編 : 210000
  • 所在區域 : 江蘇
  • 電話 : 173****2095 點擊查看
  • 傳真 : 點擊查看
  • 郵箱 : wangminwen@vazyme.com

操作簡單:可一步實現DNA的片段化和接頭連接,僅需9 h即可實現從細胞到二代測序文庫的轉化

超高活性:兼具Protein A&Tn5活性,DN**段化活性極高

細胞起始量低:可兼容低至60個細胞,甚至單細胞

純度高:蛋白純度高、核酸殘留低

1. CUT&Tag技術原理及應用

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是替換傳統的ChIP-Seq用以研究蛋白質-基因組互作的新技術,與后者相比,它具有顯著優勢,如:信噪比高,可重復性好,實驗周期短(1天實現從細胞到文庫構建),細胞投入量低等,尤其適用于早期胚胎發育、干細胞、腫瘤以及表觀遺傳學等研究領域。

CUT&Tag技術的實驗流程簡單,主要包括:①收集細胞;②分別孵育一抗和二抗;③孵育pA/pG-Tn5轉座子(Hyperactive??pA/pG-Tn5 Transposon);④激活轉座子,進行DN**段化;⑤DNA提?。虎尬膸鞌U增與純化。

2. 轉座子活性高

A:基因組DNA打斷效果

如圖所示,分別使用Vazyme #TD902中提供的pA-Tn5轉座子與市售轉座子(來自N公司)進行活性檢測;投入50 ng人基因組DNA,各取1 μl轉座子進行DN**段化(10 min),可以看出,Vazyme #TD902中的pA-Tn5融合酶切割DNA活性很高,文庫產量顯著高于N公司。

B:活細胞CUT&Tag實驗?

10,000 cells-Vazyme pA-Tn5

?10,000 cells-N

如圖B所示,投入10,000個HEK293細胞,分別使用Vazyme #TD902中提供的pA-Tn5轉座子與市售轉座子(來自N公司),按照各自說明書推薦的反應體系進行CUT&Tag實驗;其中,pA-Tn5轉座子使用的終濃度為0.04 μM,N公司轉座子按照1:100進行稀釋,一抗為H3K27me3(CST,#9733),二抗為Goat anti Rabbit(Bioworld,#BS13271)。通過使用Agilent 2100 Bioanalyzer進行文庫分布檢測,結果顯示,Vazyme的pA-Tn5轉座子切割活性明顯高于N公司,可構建出與文獻報道類似Ladder狀CUT&Tag文庫。

C: Peak 富集

如圖C所示:將圖B中的CUT&Tag文庫進行二代測序分析,可以看出,使用Vazyme #TD902獲得的文庫信噪比顯著高于N公司的文庫。

3. 實驗重復性好

如上圖所示,投入不同起始量(1,000、10,000或100,000)的HEK293細胞,每種起始量做2個重復,按照Vazyme #TD902說明書推薦的反應體系進行CUT&Tag實驗;其中,pA-Tn5轉座子使用的終濃度為0.04 μM,一抗為H3K27me3(CST,#9733),二抗為Goat anti Rabbit(Bioworld,#BS13271),陰性對照為與一抗同源的IgG(CST,#2729)。對上述文庫樣本進行二代測序,針對富集的reads進行pearson相關性分析,可以看出,平行樣本之間的重復性較好。

Hyperactive??In-Situ ChIP Library Prep Kit for Illumina是針對CUT&Tag技術定向開發的專用試劑盒。CUT&Tag技術是一種研究蛋白質-DNA互作的新方法,通過將Protein G或Protein A與經過工程學改造的超高活性Tn5轉座酶融合,形成兼具雙重活性的新型融合酶(Hyperactive??pG-Tn5/pA-Tn5 Transposase),在抗體引導下精準靶向切割目的蛋白附近的DNA序列。與傳統的ChIP-Seq相比,該技術具有細胞投入量低、實驗周期短、信噪比高、可重復性好等優勢,尤其適用于早期胚胎發育、干細胞、腫瘤以及表觀遺傳學等研究領域。試劑盒中所有試劑都經過嚴格的質量控制和功能驗證,最大程度上保證了文庫構建的穩定性和重復性。

BOX 1:ConA beads 2 ~ 8℃保存,其余組分室溫儲存。

BOX 2:5% Digitonin -30 ~ -15℃保存,室溫下可保存1周;

10 × Binding Buffer -30 ~ -15℃保存,2 ~ 8℃下可保存6個月;

其余組分-30 ~ -15℃儲存。