ChIP-seq測序/circRNA測序/轉(zhuǎn)錄組測序
產(chǎn)品名稱： ChIP-seq測序/circRNA測序/轉(zhuǎn)錄組測序
英文名稱： Western Biotechnology Inc
產(chǎn)品編號：
產(chǎn)品價格： 詢價 023-6316556/65316016
產(chǎn)品產(chǎn)地： null
品牌商標(biāo)： null
更新時間： 2023-11-16T15:05:21
使用范圍： null
ChIP-seq測序/circRNA測序/轉(zhuǎn)錄組測序
ChIP-seq測序
ChIP-seq采用特異性抗體對目的蛋白進行免疫沉淀后，分離與其結(jié)合的基因組DNA片段，并通過高通量測序，在全基因組范圍內(nèi)尋找目的蛋白特異結(jié)合的DNA位點，且可基于多個樣品進行差異比較分析及特異蛋白結(jié)合位點的序列偏好性分析。
ChIP-seq優(yōu)勢：
用于在全基因組范圍中研究蛋白特異結(jié)合的DNA片段，組蛋白修飾和表觀遺傳修飾的技術(shù)，研究這三個主題有助于洞悉蛋白對基因表達的調(diào)控以及染色體的功能結(jié)構(gòu)。具有“覆蓋全，周期快，分析科學(xué)”的優(yōu)勢，已廣泛應(yīng)用于人、小鼠、酵母、水稻、擬南芥等物種的研究。
ChIP-seq操作步驟：
1、研究對象的選取；
2、提取DNA樣本，DNA量≥20ng;
3、ChIP-seq文庫構(gòu)建；
4、PE150測序（10-20Mb）;
5、信息分析，通過對IP下來的合格DNA樣本，建庫測序，獲得高質(zhì)量reads，根據(jù)SCC曲線判斷IP效果，通過motif分析判斷IP的特異性以及分析的可信性，高效預(yù)測相關(guān)基因，進行功能富集分析、預(yù)測特異蛋白的功能，組蛋白染色體結(jié)合圖譜以及DNA的表觀修飾。
服務(wù)周期：
50天
案例分析
案例：雌激素受體結(jié)合異常與乳腺癌臨床試驗的相關(guān)性研究
雌激素受體（ER）可與相關(guān)基因結(jié)合形成復(fù)合體并移位到細(xì)胞核結(jié)合下游基因激活它們轉(zhuǎn)錄，為腫瘤生長助力。在許多乳腺患者體內(nèi)，就是因為該受體影響了基因的功能，從而引發(fā)致癌連鎖反應(yīng)。現(xiàn)在常用的他莫昔芬等乳腺癌治療藥物，就是通過阻斷雌激素受體對基因的作用而發(fā)揮效果。但在不少患者身上，這種藥物的效果并不理想。本研究基于高通量平臺的染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ChIP-seq全基因組范圍內(nèi)尋找ER結(jié)合位點，從而鑒定雌激素結(jié)合模式是否在患者腫瘤中存在差異。?
circRNA測序
環(huán)狀 RNA（circRNA）是一類特殊的 RNA 分子，也是 RNA 領(lǐng)域的研究熱點。與傳統(tǒng)的線性 RNA（linear RNA，含 5’和 3’末端）不同，circRNA 分子呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)，不受 RNA 外切酶影響，表達更穩(wěn)定，不易降解。近幾年的研究表明，circRNA 在生物的生長發(fā)育、疾病的發(fā)生發(fā)展、對外界環(huán)境的抵御等方面具有重要的調(diào)控作用。由于 circRNA 的閉合環(huán)狀特性，通過去除 total RNA 中的 rRNA 和線性 RNA 分子，可以特異地富集 circRNA 分子后測序，更有針對性地分析受檢樣本中特定的 circRNA 譜、circRNA 剪接模式、組間差異和分子功能等。
服務(wù)特色
推薦測序模式
轉(zhuǎn)錄組測序
轉(zhuǎn)錄組測序是基于HiSeq平臺，對待特定組織或者細(xì)胞在某個時期轉(zhuǎn)錄出來的所有mRNA進行測序，即可研究已知基因，亦能發(fā)掘新基因，全面快速地獲得mRNA序列和風(fēng)度信息。
案例分析
案?例?通過RNAseq技術(shù)全面解析乳腺癌組織中的可變剪切形式
乳腺癌組織由特定形式的轉(zhuǎn)錄本發(fā)揮特殊功能，本研究應(yīng)用RNAseq技術(shù)獲得了三種典型乳腺癌組織TNBC、non-TNBC和HER2陽性乳腺癌的轉(zhuǎn)錄本信息。該研究發(fā)現(xiàn)了新可變剪切形式和可變剪切后的新轉(zhuǎn)錄本，進一步研究發(fā)現(xiàn)，乳腺癌組織與正常乳腺組織在轉(zhuǎn)錄本表達水平和啟動子轉(zhuǎn)移水平存在顯著差異，并RT-PCR驗證CDK4，LARP1 , ADD3和PHLPP2等轉(zhuǎn)錄本形式。該研究第一次系統(tǒng)研究了不同亞型乳腺癌組織轉(zhuǎn)錄本利用可變剪切形式和轉(zhuǎn)錄本特異表達的情況。
威斯騰實驗服務(wù)流程
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威斯騰生物服務(wù)項目
| 分子生物學(xué)檢測 | 蛋白質(zhì)與免疫學(xué) | 動物實驗 |
| 實時熒光定量PCR | 單克隆抗體制備 | 帕金森疾病模型 |
| 免疫共沉淀（Co-IP） | 多克隆抗體制備 | 抑郁癥動物模型 |
| ELISA（酶聯(lián)免疫吸附法）技術(shù) | Western-blot?實驗服務(wù) | 脊髓損傷模型 |
| 生化指標(biāo)檢測 | 蛋白雙向電泳實驗服務(wù) | 腦外損傷模型 |
| 雙熒光素酶報告基因檢測 | 原核蛋白表達純化 | 骨神經(jīng)損傷模型 |
| 染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP） | 真核蛋白表達純化 | 心肌缺血模型 |
| GST?pull?Down | ITRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué) | 心力衰竭模型 |
| SLAC蛋白組學(xué) | 肺動脈高血壓動物模型 | |
| 高血壓模型 | ||
| 病毒包裝 | 實驗課題整體外包 | 粥樣動脈硬化模型 |
| 過表達/干擾慢病毒包裝純化 | 整體課題外包 | 大腦中動脈阻塞模型 |
| 過表達/干擾腺病毒包裝純化 | 細(xì)胞整體實驗外包 | 慢性之氣管炎模型 |
| 逆轉(zhuǎn)錄病毒包裝純化 | 動物整體實驗外包 | 過敏性哮喘模型 |
| 腺相關(guān)病毒包裝純化 | 肺炎大鼠模型 | |
| 肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
| 蛋白芯片 | 原代細(xì)胞培養(yǎng) | 肝纖維化模型 |
| 細(xì)胞因子芯片 | 骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng) | 膽結(jié)石模型 |
| BioPlex懸浮芯片 | 脂肪干細(xì)胞培養(yǎng) | 急性胰腺炎模型 |
| 生長因子芯片 | 心肌成纖維細(xì)胞培養(yǎng) | 急性腎衰竭模型 |
| 炎癥因子芯片 | 軟骨細(xì)胞培養(yǎng) | 體內(nèi)血栓模型 |
| 血管生成因子芯片 | 血管內(nèi)皮細(xì)胞培養(yǎng) | 關(guān)節(jié)炎模型 |
| 凋亡因子芯片 | 神經(jīng)元細(xì)胞培養(yǎng) | I型和II型糖尿病模型 |
| 趨化因子芯片 | 內(nèi)皮組細(xì)胞原代培養(yǎng) | 裸鼠成瘤 |
| HuProt?TM?20K人類蛋白組芯片 | 基因編輯動物 | |
| 電生理相關(guān)服務(wù) | 動物整體實驗服務(wù) | |
| 膜片鉗實驗 | ||
| 細(xì)胞生物學(xué)檢測 | 高通量測序 | 代謝組學(xué) |
| 細(xì)胞原代培養(yǎng) | mRNA測序 | 氣相色譜GC/MS |
| MTT檢測 | LncRNA測序 | 液相色譜LC/MS |
| 細(xì)胞凋亡檢測 | 全基因組測序 | 核磁共震NMR |
| 細(xì)胞周期檢測 | RNA-Seq測序 | |
| 細(xì)胞克隆形成實驗 | 外顯子測序 | 影像學(xué)相關(guān)實驗 |
| Transwell細(xì)胞遷移/侵襲 | 16s擴增子測序 | Micro-CT |
| 流式分選 | Small?RNA測序 | 小動物活體成像 |
| CCK8/XTT檢測 | 宏基因組測序 | 核磁共振 |
| 臺盼藍(lán)檢測細(xì)胞活性 | 單細(xì)胞測序 | PET-CT |
| 藥物篩選細(xì)胞學(xué)實驗 | circleRNA測序 | |
| 細(xì)胞粘附性檢測 | 甲基化測序 | 基因編輯動物 |
| 細(xì)胞劃痕實驗 | 條件性敲除小鼠/大鼠 | |
| 細(xì)胞生物學(xué)整體實驗 | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
| 細(xì)胞成管實驗 | ||
| 病理檢測 | CRISPR/Cas9細(xì)胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
| 掃描電鏡 | 基因定點突變細(xì)胞系 | LncRNA芯片 |
| 透射電鏡 | 單基因敲除細(xì)胞系 | miRNA芯片 |
| HE染色 | 多基因敲除細(xì)胞系 | mRNA芯片 |
| 免疫組化 | 目的基因敲入細(xì)胞系 | 甲基化芯片（限人和小鼠來源樣本） |
| Tunel（原位末端凋亡法）檢測 | 報告基因敲入細(xì)胞系 | SNP芯片（限人和小鼠來源樣本） |
| 激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除細(xì)胞系 | |
| 免疫熒光 | ||
| Masson染色 | CRISPR/Cas9TUNEology 波長可調(diào)檢測卡盒-->
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