表達譜分析
產品名稱: 表達譜分析
英文名稱: Expression profiling
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更新時間: 2023-09-21T16:14:31
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?表達譜分析:通過芯片雜交信號的熒光強弱來得到mrna,mirna的表達量或者CpG位點的甲基化程度,利用統計學方法來篩選差異位點,最后借助功能分析來尋找可能的生物學解釋。
A: 基本分析流程

B:部分結果展示?

Box plot圖:是利用數據中的五個統計量:最小值、第一四分位數(25%)、中位數(50%)、第三四分位數(75%)和最大值來描述數據的一種方法,它也可以粗略地看出數據是否具有有對稱性,分布的分散程度等信息。

Pca圖:通過降維度的方式來看樣本間的相似程度,不同的顏色表示不同分組的樣本。樣本間距離越近表示樣本基因的表達趨勢約接近。

火山圖:兩條綠色直線對應fold change 2倍差異,綠色橫線對應P=0.05,紅色是差異基因區域

非監督聚類圖:縱列表示樣本橫列表示基因,信號值的強度用色階表示,進化樹表示基因或者樣本的相似程度。

自組織映射聚類SOM?分析:將變化趨勢一致的基因聚類,橫坐標是不同階段,每條線表示一個基因的表達趨勢。

Go關系圖

Pathway圖

網絡關系圖
