人snp芯片,人snp基因組芯片,Human omni-1 quad芯片
產品名稱： 人snp芯片,人snp基因組芯片,Human omni-1 quad芯片
英文名稱： Human omni-1 quad芯片
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上海儀方生物技術有限公司
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芯片信息: Human omni-1 quad芯片數據來自于人類千人基因組計劃測序結果。其中包含了超過114萬個探針信息，可以在一張芯片上平行進行4個樣本的檢測。該款芯片包含針對基因SNPs，標簽SNPs，拷貝數變化（CNV）, 及其他高價值的基因組區基因組區域域設計探針。
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| 標簽Tag SNPs：根據HapMap挑選標簽SNP，在r2 > 0.8 前提下，Caucasian(CEU)，Han Chinese/Japanese (CHB/JPT)和Yoruba (YRI)人種中基因組覆蓋率分別為95%，94%和85%。提供了最高限度的基因組覆蓋率，在基因組中平均間隔為2.4kb。 |
| CNV區域：探針覆蓋了CNV高發區域如片段復制區 域，megasatellites，SNP沙漠，MHC區；覆蓋Database of Genomic Variants(DGV)數據庫中已報導的CNV區域;特有探針覆蓋DGV數據庫中尚未報導的CNV區域。在超過6,000個常見及5,000個罕見的 CNV區域內，平均每個CNV區域分布10-15個位點，平均1.2 kb。 |
| 在該芯片所覆蓋的SNP位點中有18,000個SNP覆蓋了通過GWAS研究得到的與人類疾病相關的主要區域，50,000個非同意SNPs，有62,000個SNPs覆蓋100個插入缺失周邊區域。 |
| ADME(Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion)基因：包含ADME基因中的22,429 SNP。 |
| MHC區域：包含19,081個SNP標記和495個indel 標記。 |
| 性染色體：27,493個 X 染色體位點, 2,322個Y染色體位點, 1,157偽常染色體區(PAR)SNP位點。 |
| 線粒體 SNP：27 mtSNP。 |
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| 產品名稱： Human omni-express beadchip |
| 芯片信息：Human omni-express 芯片覆蓋人類基因組計劃HapMap三個階段研究的數據，針對基因SNPs，標簽SNPs，拷貝數變化（CNV），及其他高價值的基因組區域設計探針. |
| 共700,000多個位點，每張芯片可同時檢測12個樣本。在r2 > 0.8 前提下，在CEU，JPT+CHB，YRI等人種中基因組覆蓋率分別為：0.91，0.91，0.68。CNV區域平均間隔4.0kb。 |