(單細胞轉錄組測序文庫構建最佳搭檔)Discover-sc WTA Kit V2-文庫及構建-試劑-生物在線
南京諾唯贊生物科技股份有限公司
(單細胞轉錄組測序文庫構建最佳搭檔)Discover-sc WTA Kit V2

(單細胞轉錄組測序文庫構建最佳搭檔)Discover-sc WTA Kit V2

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產品名稱: (單細胞轉錄組測序文庫構建最佳搭檔)Discover-sc WTA Kit V2

英文名稱: Discover-sc WTA Kit V2

產品編號: N711

產品價格: 0

產品產地: 江蘇南京

品牌商標: Vazyme

更新時間: null

使用范圍: null

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Discover-sc??WTA Kit V2

單細胞轉錄組測序文庫構建最佳搭檔

模板起始量低:單個細胞或10pg Total RNA即可作為起始模板,進行高效擴增

擴增靈敏度使用LNA技術及精心優化的反應體系,大幅度增加了低表達基因的檢出量

產物完整性好:通過雙端引物擴增全長cDNA,獲得全轉錄組信息,避免了5和3偏好性

操作成功率大:大大減少了RNA樣品的處理,從而最大限度避免了樣品損失的風險,提高了操作成功率

體積兼容性廣:樣品兼容體積可高達5 μl,兼容不同濃度的模板進行擴增?

1.模板起始量低,擴增產物cDNA完整性好

10 pg 293T細胞Total RNA用Discover-sc??WTA Kit V2進行擴增,取1 μl cDNA擴增產物用Agilent 2100 Bioanalyzer進行分析。試劑盒以Oligo dT Primer為逆轉錄引物,并利用Discover-sc??Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接頭序列,通過該接頭序列進行后續的PCR擴增,獲得全長cDNA擴增產物,同時避免了rRNA的污染。

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2.文庫質量分析—數據基本指標

Vazyme-1和Vazyme-2是單個293T細胞經過Discover-sc??WTA Kit V2 進行擴增,C-1和C-2是單個293T細胞經過用C公司單細胞轉錄組試劑盒進行擴增,取1 ng cDNA擴增產物經TruePrep??DNA Library Prep Kit V2 for Illumina構建文庫。以下均為此文庫數據分析。

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3.基因表達總體情況分析

Discover-sc??WTA Kit V2試劑盒擴增產物檢測靈敏度高,單個293T細胞檢測到基因數高達15000個。

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4.數據分布均一,無偏好性

左圖為Vazyme-1測序片段在基因上的分布結果,右圖為C-1測序片段在基因上的分布結果,數據顯示Discover-sc??WTA Kit V2擴增很好的保證了基因5’和3’的覆蓋。

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5.表達重復相關性高

左圖為Vazyme-1和Vazyme-2表達重復相關性分析,右圖為C-1和C-2表達重復性相關性分析。數據結果表明表達重復相關性高于C公司。

?Discover-sc??WTA Kit V2能以1-1000個細胞或10 pg-10 ng總RNA為模板,通過第一鏈cDNA合成及擴增,獲取足夠的用于序列分析的樣本,從而解決了諸如單細胞等微量樣本因RNA含量過低導致的無法使用常規mRNA-seq進行測序分析的技術難題。試劑盒以Oligo dT Primer為逆轉錄引物進行cDNA合成,并利用Discover-sc??Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接頭序列,通過該接頭序列進行后續的PCR擴增,獲得全長cDNA擴增產物,有效避免了cDNA合成過程中的3’偏好性和rRNA的污染。

? ? ? Discover-sc??WTA Kit V2是在Discover-sc??WTA Kit基礎上開發的升級版本,其檢測靈敏度、體積兼容性均得到了大幅度提升,更加適合低豐度基因及低濃度模板的檢測。

Box 1,-70°C儲存; Box 2,-20°C儲存。