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人類表達譜芯片?
??????人類表達譜芯片 v6 延續(xù) "One Gene-One Probe" 的設(shè)計原理， 以 IMPORT 專利技術(shù)針對蛋白質(zhì)編碼基因設(shè)計高專一性探針， 并以自主的高速布放技術(shù)進行芯片生產(chǎn)。v6 版芯片于 2012 年 9 月正式上市， 根據(jù) RefSeq 51 及 Ensembl 65 數(shù)據(jù)庫進行探針的更新， 以提供更高基因覆蓋率的表達譜芯片。?
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探針信息
| 探針種類 |
探針數(shù) |
基因探針設(shè)計數(shù)據(jù)庫：
???????? - RefSeq release 51
?????????-Ensembl release 65 |
31,741 |
| 控制探針數(shù) |
938 |
| 總探針數(shù) |
32,679 |
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基因探針?
?????? 人類表達譜芯片 v6 版本的更新是參考國際公認之 RefSeq 及 Ensembl 序列數(shù)據(jù)庫， 設(shè)計長鏈 60 個堿基寡核酸 (sense-strand) 的人類表達譜基因探針， 內(nèi)容以 protein-coding gene 為主，相較于 v5 版本， 除了提高整體的基因覆蓋率外，更完整的覆蓋與生理途徑反應(yīng)相關(guān)的基因， 并且每一個探針對其源數(shù)據(jù)庫的目標基因皆具高度專一性，避免非目標基因的雜交影響。
此外，華聯(lián)專業(yè)團隊建構(gòu) ”華聯(lián)探針批注搜索引擎” (PASS) 網(wǎng)站，方便使用者查詢各探針相對應(yīng)于 NCBI 及 Ensembl 數(shù)據(jù)庫的詳細批注。?
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控制探針?
??????為確保芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量，華聯(lián)技術(shù)團隊經(jīng)過一連串的測試及驗證，設(shè)計一系列的質(zhì)量控制探針， 以監(jiān)控完整的芯片實驗步驟，包含樣本 RNA 完整性、樣本 RNA 放大流程、熒光標記效率、芯片雜交、芯片掃描等。
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小鼠表達譜芯片
?????小鼠表達譜芯片 v2 保留 v1 中專一性佳的 MEEBO 探針， 并依據(jù) RefSeq 42 及 Ensembl 59 數(shù)據(jù)庫進行探針的更新， 提供更高基因覆蓋率的表達譜芯片。探針設(shè)計采用 “一個基因，一個探針” 的設(shè)計原理， 以 IMPORT 專利技術(shù)針對蛋白質(zhì)編碼基因設(shè)計高專一性探針， 并以自主的高速布放技術(shù)進行芯片生產(chǎn)。?
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探針信息
| 探針種類 |
探針數(shù) |
基因探針設(shè)計數(shù)據(jù)庫：
???????? - RefSeq release?42
?????????-Ensembl release 59 |
26,423 |
| 控制探針數(shù) |
872 |
| 總探針數(shù) |
27,295 |
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基因探針?
?????? 小鼠表達譜芯片 v2 版次除了保留 v1 中專一性佳的 MEEBO 探針外， 更參考國際公認之 RefSeq 42 及 Ensembl 59 序列數(shù)據(jù)庫， 設(shè)計長鏈 60 個堿基寡核酸 (sense-strand) 的基因探針， 內(nèi)容以蛋白質(zhì)編碼基因 (protein-coding gene) 為主， 提高整體的基因覆蓋率外與提供完整的生理途徑反應(yīng)相關(guān)的基因， 并且每一個探針對其源數(shù)據(jù)庫的目標基因皆具高度專一性，避免非目標基因的雜交影響。?
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控制探針?
??????為確保芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量，華聯(lián)技術(shù)團隊經(jīng)過一連串的測試及驗證， 設(shè)計一系列的質(zhì)量控制探針，以監(jiān)控完整的芯片實驗步驟，包含樣本 RNA 完整性、 樣本 RNA 放大流程、熒光標記效率、芯片雜交、芯片掃描等。
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大鼠表達譜芯片?
?????大鼠表達譜芯片為全新開發(fā)的表達譜芯片產(chǎn)品，與其它表達譜系列產(chǎn)品一樣， 采用 “一個基因，一個探針” 的設(shè)計原理，以 IMPORT 專利技術(shù)針對蛋白質(zhì)編碼基因設(shè)計高專一性探針， 根據(jù) RefSeq 42 及 Ensembl 59 數(shù)據(jù)庫進行探針的設(shè)計， 提供高基因覆蓋率的表達譜芯片，以自主的高速布放技術(shù)進行芯片生產(chǎn)。?
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探針信息
| 探針種類 |
探針數(shù) |
基因探針設(shè)計數(shù)據(jù)庫：
???????? - RefSeq release?42
?????????-Ensembl release 59 |
24,358 |
| 控制探針數(shù) |
980 |
| 總探針數(shù) |
25,338 |
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基因探針?
?????? 大鼠表達譜芯片是參考國際公認之 RefSeq 及 Ensembl 序列數(shù)據(jù)庫， 設(shè)計長煉 60 個堿基寡核酸 (sense-strand) 的基因探針， 內(nèi)容主要以蛋白質(zhì)編碼基因 (protein-coding gene) 為主， 提供高基因覆蓋率并且每一個探針對其源數(shù)據(jù)庫的目標基因皆具高度專一性，避免非目標基因的雜交影響。
控制探針?
??????為確保芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量，華聯(lián)技術(shù)團隊經(jīng)過一連串的測試及驗證， 設(shè)計一系列的質(zhì)量控制探針，以監(jiān)控完整的芯片實驗步驟，包含樣本 RNA 完整性、 樣本 RNA 放大流程、熒光標記效率、芯片雜交、芯片掃描等。?
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華聯(lián)目前已有人類、小鼠、大鼠、酵母菌與水稻等表達譜芯片：
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| 表達譜產(chǎn)品 |
總探針數(shù) |
基因探針數(shù) |
控制探針數(shù) |
酵母菌 |
參考數(shù)據(jù)庫 |
| HOA v5 Huamn OneArray |
30,275 |
29,187 |
1,088 |
60 mer |
RefSeq release 38
Ensembl release 56 |
| MOA v2?Mouse OneArray |
27,294 |
26,423 |
872 |
60 mer |
RefSeq release 42
Ensembl release 59 |
| ROA v1 Rat OneArray |
25,338 |
24,358 |
980 |
60 mer |
RefSeq release 42
Ensembl release 59 |
| YOA v1 Yeast OneArray |
7,642 |
6,958 |
684 |
70 mer |
AROSa v1.1 YBOXb v1.0 |
| RiOA v1 Rice OneArray |
22,063 |
21,179 |
884 |
60 mer |
RGAPc v6.1 BGId(2008) |
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