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人類表達譜芯片?
??????人類表達譜芯片 v6 延續 "One Gene-One Probe" 的設計原理, 以 IMPORT 專利技術針對蛋白質編碼基因設計高專一性探針, 并以自主的高速布放技術進行芯片生產。v6 版芯片于 2012 年 9 月正式上市, 根據 RefSeq 51 及 Ensembl 65 數據庫進行探針的更新, 以提供更高基因覆蓋率的表達譜芯片。?
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探針信息
| 探針種類 |
探針數 |
基因探針設計數據庫:
???????? - RefSeq release 51
?????????-Ensembl release 65 |
31,741 |
| 控制探針數 |
938 |
| 總探針數 |
32,679 |
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基因探針?
?????? 人類表達譜芯片 v6 版本的更新是參考國際公認之 RefSeq 及 Ensembl 序列數據庫, 設計長鏈 60 個堿基寡核酸 (sense-strand) 的人類表達譜基因探針, 內容以 protein-coding gene 為主,相較于 v5 版本, 除了提高整體的基因覆蓋率外,更完整的覆蓋與生理途徑反應相關的基因, 并且每一個探針對其源數據庫的目標基因皆具高度專一性,避免非目標基因的雜交影響。
此外,華聯專業團隊建構 ”華聯探針批注搜索引擎” (PASS) 網站,方便使用者查詢各探針相對應于 NCBI 及 Ensembl 數據庫的詳細批注。?
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控制探針?
??????為確保芯片數據質量,華聯技術團隊經過一連串的測試及驗證,設計一系列的質量控制探針, 以監控完整的芯片實驗步驟,包含樣本 RNA 完整性、樣本 RNA 放大流程、熒光標記效率、芯片雜交、芯片掃描等。
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小鼠表達譜芯片
?????小鼠表達譜芯片 v2 保留 v1 中專一性佳的 MEEBO 探針, 并依據 RefSeq 42 及 Ensembl 59 數據庫進行探針的更新, 提供更高基因覆蓋率的表達譜芯片。探針設計采用 “一個基因,一個探針” 的設計原理, 以 IMPORT 專利技術針對蛋白質編碼基因設計高專一性探針, 并以自主的高速布放技術進行芯片生產。?
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探針信息
| 探針種類 |
探針數 |
基因探針設計數據庫:
???????? - RefSeq release?42
?????????-Ensembl release 59 |
26,423 |
| 控制探針數 |
872 |
| 總探針數 |
27,295 |
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基因探針?
?????? 小鼠表達譜芯片 v2 版次除了保留 v1 中專一性佳的 MEEBO 探針外, 更參考國際公認之 RefSeq 42 及 Ensembl 59 序列數據庫, 設計長鏈 60 個堿基寡核酸 (sense-strand) 的基因探針, 內容以蛋白質編碼基因 (protein-coding gene) 為主, 提高整體的基因覆蓋率外與提供完整的生理途徑反應相關的基因, 并且每一個探針對其源數據庫的目標基因皆具高度專一性,避免非目標基因的雜交影響。?
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控制探針?
??????為確保芯片數據質量,華聯技術團隊經過一連串的測試及驗證, 設計一系列的質量控制探針,以監控完整的芯片實驗步驟,包含樣本 RNA 完整性、 樣本 RNA 放大流程、熒光標記效率、芯片雜交、芯片掃描等。
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大鼠表達譜芯片?
?????大鼠表達譜芯片為全新開發的表達譜芯片產品,與其它表達譜系列產品一樣, 采用 “一個基因,一個探針” 的設計原理,以 IMPORT 專利技術針對蛋白質編碼基因設計高專一性探針, 根據 RefSeq 42 及 Ensembl 59 數據庫進行探針的設計, 提供高基因覆蓋率的表達譜芯片,以自主的高速布放技術進行芯片生產。?
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探針信息
| 探針種類 |
探針數 |
基因探針設計數據庫:
???????? - RefSeq release?42
?????????-Ensembl release 59 |
24,358 |
| 控制探針數 |
980 |
| 總探針數 |
25,338 |
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基因探針?
?????? 大鼠表達譜芯片是參考國際公認之 RefSeq 及 Ensembl 序列數據庫, 設計長煉 60 個堿基寡核酸 (sense-strand) 的基因探針, 內容主要以蛋白質編碼基因 (protein-coding gene) 為主, 提供高基因覆蓋率并且每一個探針對其源數據庫的目標基因皆具高度專一性,避免非目標基因的雜交影響。
控制探針?
??????為確保芯片數據質量,華聯技術團隊經過一連串的測試及驗證, 設計一系列的質量控制探針,以監控完整的芯片實驗步驟,包含樣本 RNA 完整性、 樣本 RNA 放大流程、熒光標記效率、芯片雜交、芯片掃描等。?
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華聯目前已有人類、小鼠、大鼠、酵母菌與水稻等表達譜芯片:
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| 表達譜產品 |
總探針數 |
基因探針數 |
控制探針數 |
酵母菌 |
參考數據庫 |
| HOA v5 Huamn OneArray |
30,275 |
29,187 |
1,088 |
60 mer |
RefSeq release 38
Ensembl release 56 |
| MOA v2?Mouse OneArray |
27,294 |
26,423 |
872 |
60 mer |
RefSeq release 42
Ensembl release 59 |
| ROA v1 Rat OneArray |
25,338 |
24,358 |
980 |
60 mer |
RefSeq release 42
Ensembl release 59 |
| YOA v1 Yeast OneArray |
7,642 |
6,958 |
684 |
70 mer |
AROSa v1.1 YBOXb v1.0 |
| RiOA v1 Rice OneArray |
22,063 |
21,179 |
884 |
60 mer |
RGAPc v6.1 BGId(2008) |
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