宏轉錄組/宏基因組測序-分子生物學服務 -技術服務-生物在線
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宏轉錄組/宏基因組測序

宏轉錄組/宏基因組測序

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產品名稱: 宏轉錄組/宏基因組測序

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產品價格: 詢價 023-6316556/65316016

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更新時間: 2023-07-31T09:56:51

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宏轉錄組測序


宏轉錄組(Metatranscriptome)測序是指從整體水平上研究某一特定環境,特定時期群體生命全部基因組轉錄情況以及轉錄調控規律的研究手段,它以生態環境中的全部RNA為研究對象,避開了微生物分離培養困難的問題,能有效的擴展微生物資源的利用空間。相較于宏基因組,宏轉錄組能從轉錄水平研究復雜微生物群落變化,能更好的挖掘潛在的新基因。


轉錄組測序優勢

短周期,高通量,全分析,已廣泛應用于腸道內容物、土壤、水體等研究中。


轉錄測序操作步驟

1、研究對象的選??;

2、提取RNA,RNA2.5ug;

3、文庫構建;

4、PE150測序(5-10Gb);

5、信息分析,分析內容包含De novo拼接、物種注釋及分類、功能注釋(KEGG,eggNOG,CAZY,Nr數據庫比對,GO富集,KEGG富集,多樣品比較分析等。


微生物樣本的制備(土壤、水體樣本制備)

(1)普通土壤樣本根據研究目的確定采樣范圍,取樣器具要事先消毒滅菌處理。采樣時應去除表面浮土,使用乙醇火燒的鏟子挖取地下5~20cm的土層,去除可見雜質后,土壤過2mm篩網。每個樣品從3個或以上采樣點采集并混合,去除雜質后,每5~10g分為一份,保存于無菌離心管中,置于0℃以下運回實驗室,用于抽提DNA。如不能馬上實驗,置于-80℃保存。

(2)水體樣本:根據研究目的確定采樣深度和范圍,采集好的水樣需要通過濾膜進行過濾,可以根據水樣的渾濁程度選擇相應孔徑的濾膜,之后置于-80℃保存備用。

清亮水樣:可選擇小孔徑的濾膜,一般選0.22μm 0.45μm 的濾膜,過濾水樣體積大于10L;

渾濁水樣:過濾前靜置分離懸浮顆粒,也可以用大孔徑的濾膜預過濾一遍,再用小孔徑的濾膜進行過濾。

服務周期

65

威斯騰生物服務流程


威斯騰生物服務項目

分子生物學檢測蛋白質與免疫學動物實驗
實時熒光定量PCR單克隆抗體制備帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP多克隆抗體制備抑郁癥動物模型
ELISA(酶聯免疫吸附法)技術Western-blot?實驗服務脊髓損傷模型
生化指標檢測蛋白雙向電泳實驗服務腦外損傷模型
雙熒光素酶報告基因檢測原核蛋白表達純化骨神經損傷模型
染色質免疫共沉淀(ChIP真核蛋白表達純化心肌缺血模型
GST?pull?DownITRAQ定量蛋白質組學心力衰竭模型
SLAC蛋白組學肺動脈高血壓動物模型
高血壓模型
病毒包裝實驗課題整體外包粥樣動脈硬化模型
過表達/干擾慢病毒包裝純化整體課題外包大腦中動脈阻塞模型
過表達/干擾腺病毒包裝純化細胞整體實驗外包慢性之氣管炎模型
逆轉錄病毒包裝純化動物整體實驗外包過敏性哮喘模型
腺相關病毒包裝純化肺炎大鼠模型
肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片原代細胞培養肝纖維化模型
細胞因子芯片骨髓間充質干細胞培養膽結石模型
BioPlex懸浮芯片脂肪干細胞培養急性胰腺炎模型
生長因子芯片心肌成纖維細胞培養急性腎衰竭模型
炎癥因子芯片軟骨細胞培養體內血栓模型
血管生成因子芯片血管內皮細胞培養關節炎模型
凋亡因子芯片神經元細胞培養I型和II型糖尿病模型
趨化因子芯片內皮組細胞原代培養裸鼠成瘤
HuProt?TM?20K人類蛋白組芯片基因編輯動物
電生理相關服務動物整體實驗服務
膜片鉗實驗
細胞生物學檢測高通量測序代謝組學
細胞原代培養mRNA測序氣相色譜GC/MS
MTT檢測LncRNA測序液相色譜LC/MS
細胞凋亡檢測全基因組測序核磁共震NMR
細胞周期檢測RNA-Seq測序
細胞克隆形成實驗外顯子測序影像學相關實驗
Transwell細胞遷移/侵襲16s擴增子測序Micro-CT
流式分選Small?RNA測序小動物活體成像
CCK8/XTT檢測宏基因組測序核磁共振
臺盼藍檢測細胞活性單細胞測序PET-CT
藥物篩選細胞學實驗circleRNA測序
細胞粘附性檢測甲基化測序基因編輯動物
細胞劃痕實驗條件性敲除小鼠/大鼠
細胞生物學整體實驗全基因敲除小鼠/大鼠
細胞成管實驗
病理檢測CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入基因芯片
掃描電鏡基因定點突變細胞系LncRNA芯片
透射電鏡單基因敲除細胞系miRNA芯片
HE染色多基因敲除細胞系mRNA芯片
免疫組化目的基因敲入細胞系甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
Tunel(原位末端凋亡法)檢測報告基因敲入細胞系SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
激光共聚焦miRNA/LncRNA敲除細胞系
免疫熒光
Masson染色CRISPR/Cas9動物敲除/敲入科研設計指導&文章評估/潤色
原位雜交基因敲除大鼠/小鼠科研文獻論著翻譯
熒光原位雜交基因敲入大鼠/小鼠論文翻譯潤色服務
特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等)臨床實驗/科研實驗設計方案指導
行為學檢測藥物篩選服務項目藥效學評價
曠場實驗高通量自動藥物篩選平臺抗腫瘤藥物藥效學評價
重復性刻板行為檢測細胞高內涵藥物篩選平臺心血管系統藥物藥效學評價
動物跑臺檢測蛋白質組學靶標研發平臺泌尿系統藥物藥效學評價
強迫游泳分子藥理研究平臺內分泌系統藥物藥效學評價
生物膜片鉗藥物篩選平臺抗炎免疫藥物藥效學評價
常規藥物體外篩選


【本平臺合作項目】

分子生物學、細胞生物學、基因敲出/入、模式動物、SPF動物保種、病理學檢測、免疫學檢測、影像學檢測、原代培養、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學、代謝組學、高通量高內涵篩選、藥效學評價、藥理毒理學實驗、慢病毒包裝與穩轉株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學分析、知識產權服務!?
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