Pulldown
產品名稱: Pulldown
英文名稱: Pulldown
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?GST Pull-down實驗
摘要:體外利用GST-PES1六種突變體蛋白(1-588aa全長,1-415aa, 322-455aa缺失,322-588aa,220-588aa,101-588aa)與His-NPM1的pull-down實驗,確定PES1的220-322aa區域是與NPM1相互作用的結構域。為進一步研究PES1的功能提供實驗數據。
關鍵詞:PES1,NPM1,Pull-down, 蛋白相互作用,原核表達
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一、?實驗原理
利用重組技術將PES1蛋白與GST (Glutathione S transferase) 融合表達,融合蛋白通過GST與瓊脂糖微球上結合的GTH (Glutathione)親和結合。因此,如果PES1與NPM1之間有直接相互作用,當結合了PES1蛋白的GTH微球的與含有NPM1蛋白的細胞裂解液混合孵育,再通過離心富集GST微球,得到的樣品中可以檢測到NPM1。
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二、?實驗目的
在體外檢測?NPM1 (nucleophosmin )與PES1(pescadillo)之間的直接相互作用,確定PES1與NPM1相互作用的結構域。
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三、?實驗步驟
1.?6×His-NPM1(pET-28a)質粒轉化BL21-DE3感受態細胞:
2.?培養誘導蛋白表達 :
1)?挑取6×His-NPM1單克隆菌落到5ml培養基(含amp抗生素)。
2)?搖床37℃培養12-15h。按照1:100比例接種到50ml的培養基(含amp抗生素)。
3)?37℃培養到OD600吸光光度值0.6-0.8(大概2.5-3h)。
4)?加入100mM IPTG至終濃度1.0mM誘導表達。
5)?低溫(30℃)繼續誘導培養2-4h。
6)?轉移菌液到離心管,7700 g離心10min。棄去上清,在冰上控干。
7)?沉淀重懸在2.5ml PBS中。取10μl留用SDS-PAGE分析。
3.?裂解細胞:
1)?加入25 μl lysozyme(10 mg/ml in ddH2O)。利用干冰或者液氮凍融三次。 適宜條件下超聲使菌液變得澄清。
2)?12,000g 4℃離心15min,上清轉移到新的離心管。
4.?準備glutathione sepharose 4B beads,結合GST融合蛋白:
1)?將sepharose 4B搖動后使其重懸。
2)?取 500μl sepharose 4B beads,使用10ml PBS徹底清洗3次以去除乙醇。
3)?500g離心5min去除上清。
4)?使用500μl PBS重懸Sepharose 4B beads。
5)?每樣品取20μl Sepharose 4B beads, 加入1ml binding buffer,再加入5μg純化的GST對照蛋白,1-588aa全長GST-PES1
蛋白,1-415aa, 322-455aa缺失,322-588aa,220-588aa,101-588aa。
6)?室溫混合孵育1h。
5.?Pull-down 實驗:
1)?每樣品中加入His-NMP1誘導表達裂解液100μl。
2)?4℃混合過夜。
3)?500g離心5分種棄去上清。
4)?使用lysis buffer洗滌3-4 次。
5)?加入2x SDS上樣液,煮樣品10min。
6.?Western Blot分析結果:
使用anti-his標簽抗體檢測 。
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四、?實驗結果
??????????????????????????????????????????????????????????????????????? 圖1. GST-PES1各種突變體示意圖
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????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 圖2. GST Pull-down結果
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從圖2的結果可以看到,PES1的220-322aa之間的結構域是與NPM1相互作用必須的。
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五、?參考文獻
1.?Zhang J, Yang Y, Wu J. B23 interacts with PES1 and is involved in nucleolar localization of PES1. Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai). 2009; 12: 991-997.
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