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Patharray?機制研究服務——生物信息分析

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• 您是否明確待研基因生物學功能，但對于下游機制研究一籌莫展？

• 某項科研工作已告一段落，但還想進行更深入的研究？

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吉凱基因Patharray?服務幫助您更好更快的進行深入的機制研究！

目前主流的研究思路都是從一個待研基因出發，通過尋找明星的通路或者直接作用的明星基因來解釋一個臨床問題或者提出一個科學假說，那么找到這個明星通路或者明星基因就顯得至關重要，吉凱基因通過10多年的努力，建立了一套完整疾病基因數據庫、基因作用網絡數據庫，在目的細胞中敲減或過表達目的基因后，幫助您在所研究方向上靶向明星通路并且提供后續的研究建議。

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芯片綜合產品分析流程

數據分析樣例

1.?芯片數據QC

1.1 Signal Histogram

芯片的信號值分布圖。每條信號分布曲線的重合度越好表示芯片實驗的可靠性越高。

1.2 Relative Signal Box Plot

芯片Normalization后的箱型圖，紅線是baseline。此圖表示了每張芯片數據在進行permutation后的百分位數分布，它們的分布越接近，數據的重復性就越高。

1.3 Pearson's Correlation (signal)

芯片的相關系數圖，表示所有芯片兩兩之間的相關程度，本圖使用皮爾森相關系數，當系數等于1.0時未完全正相關，相關系數越接近1.0，其相關性越高。

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1.4 PCA

PCA (Principal Component Analysis),?主成分分析。用來表示每張芯片在組內組間的相似和差異度。

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2.?芯片數據分析

2.1?有顯著差異表現的基因數目

根據實驗設計要求，將差異基因的比較結果以下表呈現，基因表現有顯著差異的篩選標準為必須符合丨FC丨要大于2，并且P?value值要小于0.05，詳細基因表達分析見“數據分析報告”

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2.2?火山圖

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2.3?散點圖

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2.4?聚類圖

3. Pathway和GO分析

根據篩選出的差異基因，進行Pathway分析和Gene Ontology分析（即GO分析）。

根據生物學功能的不同，將差異基因進行Pathway Analysis，計算包含多少差異基因，并列式基因名稱。

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Pathway分析

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GO分析

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?4.?深入分析

根據初步分析結果，挑選感興趣的pathway/gene進行深入分析。

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5.下游基因驗證?

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