轉錄組與脂質組聯合分析-科研實驗整體外包服務-技術服務-生物在線
上海中科新生命生物科技有限公司
轉錄組與脂質組聯合分析

轉錄組與脂質組聯合分析

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產品名稱: 轉錄組與脂質組聯合分析

英文名稱: Combined analysis of transcriptome and lipid group

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?轉錄組學和脂質組學整合分析,是指對來自轉錄組和脂質組的批量數據進行歸一化處理及統計學分析,建立不同層次分子間數據關系;同時結合功能分析、代謝通路富集、分子互作等生物功能分析,系統全面地解析生物分子功能和調控機制,最終實現對生物變化大趨勢與方向的綜合了解,進而提出分子生物學變化機制模型,并篩選出重點代謝通路或者基因、代謝產物進行后續深入實驗分析與應用。

應用方向

生物領域各個研究方面,如:

? 農林領域:抗逆脅迫機制,生長發育機制,育種保護研究等;

? 畜牧業:肉類及乳品質研究,致病機理研究等;

? 基礎醫學、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治療等;

? 生物醫藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發等;

? 微生物領域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;

? 海洋水產:漁業資源,海水養殖,漁業環境與水產品安全等;

? 生物能源、環境科學領域:發酵過程優化,生物燃料生產,環境危定風險評估研究等;

? 食品營養:食品儲藏及加工條件優化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發,食品安全監檢測等。

數據分析

技術優勢

??通過對不同層面的表達水平分析,實現對基因及脂質的全譜分析。

??同時實現從“因”和“果”兩個方向探究生物學問題,相互間的驗證作用更明顯。

??闡述分子調控-表型間的關聯機制,系統全面地解析生物分子功能和調控機制。

??從海量的數據中去偽存真,篩選出重點代謝通路或者基因、代謝產物進行后續深入實驗分析與應用。

參考文獻

1.

Transcriptomic and metabolic analyses provide new insights into chilling injury in peach fruit. Plant Cell Environ. 2017.

文章以水蜜桃為研究材料,借助轉錄組學及脂質組學分析,發現冷藏保存可以增強貯藏早期果實乙烯的合成,乙烯信號傳遞到下游轉錄因子ERFs,協同調控脂質代謝以及其它修飾代謝,減輕果實冷害,促使果實正常后熟軟化。

2.

Integration of metabolomics and transcriptomics revealed a fatty acid network exerting growth inhibitory effects in Human pancreatic cancer. Clin Cancer Res. 2013.

腫瘤細胞存在脂代謝異常,文章借助轉錄組和脂質組分析手段,首先通WGCNA分析,找到跟胰腺癌發生相關的重要脂質,進一步借助相關性分析找到跟脂質變化相關的重要基因,通過對這些基因的KEGG通路分析和相關性分析,找到了調控關鍵脂質變化的重要脂代謝酶,最終闡明了胰腺癌發生發展機制。