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Label-free非標記蛋白質組定量

Label-free非標記蛋白質組定量

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產品名稱: Label-free非標記蛋白質組定量

英文名稱: Label-free Quantitative Proteomics

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定量蛋白質組學Quantitative Proteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內所有蛋白質進行精確鑒定和定量??捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,結合生物信息學揭示細胞生理病理功能,同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。?

對一個特定時間、特定突變體、特定環境變化條件下進行細胞或組織全蛋白質的鑒定是生物學中常見問題。以質譜為基礎的定量蛋白質組學,主要可以分成兩類,第一是穩定同位素標記的定量蛋白質組學,比如SILAC iTRAQ;另一類是非標記的定量蛋白質組學技術,比如使用Maxquant 軟件進行的非標記蛋白質組學分析。武漢華美基于AB SCIEX公司的5600-plus質譜平臺,采用基于圖像方式簡化大量LC-MS數據分析,并對肽和蛋白質進行相對定量,反復試驗證實Label-free非標定量技術具有較好的定量準確性和可信性。

技術特點:

l? 對液相色譜串聯質譜的穩定性和重復性要求較高

l? 無需昂貴的同位素標簽做內部標準,實驗耗費低

l? 對樣本的操作也最少,從而使其最接近原始狀態,并且不受樣品條件的限制,克服了標記定量技術在對多個樣本進行定量方面的缺陷。

圖:蛋白質組高通量測序流程圖(label-free定量)

應用領域

l? 免疫沉淀方法制備的蛋白質混合物鑒定

l? Pull-down方法制備的蛋白質混合物鑒定

l? 某一生理狀態下組織、細胞或細胞器中所有表達蛋白質鑒定

信息分析內容

l? mascot數據庫檢索,結果可靠性評估和過濾;

l? 鑒定結果質量評估、重復性分析;

l? GO功能注釋、Pathway 代謝通路注釋;

l? GO富集、Pathway富集;

l? 樣品間label-free定量,差異表達分析。

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