Hieff NGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina? ATAC建庫試劑盒
產(chǎn)品名稱： Hieff NGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina? ATAC建庫試劑盒
英文名稱： Hieff NGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina? ATAC建庫試劑盒
產(chǎn)品編號： 12208ES
產(chǎn)品價格： 詢價
產(chǎn)品產(chǎn)地： Yeasen
品牌商標(biāo)： Yeasen
更新時間： 2025-11-07T19:46:48
使用范圍： null
- 聯(lián)系人 : 李自轉(zhuǎn)
- 地址 : 上海市浦東新區(qū)天雄路166弄一號樓三層南單元
- 郵編 : 200030
- 所在區(qū)域 : 上海
- 電話 : 139****5640 點擊查看
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- 郵箱 : lizizhuan@yeasen.com
- 二維碼 : 點擊查看
樣本即用型試劑盒：含ATAC-seq實驗中除樣本以外的所有試劑，無需額外其他組分。
組織樣本需搭配12514/12516ES（組織細(xì)胞核提取試劑盒）。
植物樣本需自行處理成細(xì)胞核樣本后再搭配12208使用。
Hieff NGS® ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina®是針對Illumina®高通量測序平臺研發(fā)的用于ATAC-Seq實驗的文庫構(gòu)建試劑盒，適用于100-100,000個細(xì)胞起始量的樣本建庫。ATAC-Seq(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)技術(shù)能夠利用Tn5 轉(zhuǎn)座酶識別染色質(zhì)開放區(qū)域，快速有效的反映表觀遺傳狀態(tài)。經(jīng)過細(xì)胞收集及裂解、轉(zhuǎn)座酶片段化、磁珠回收片段化DNA、文庫擴(kuò)增和磁珠分選等步驟，DNA片段最終轉(zhuǎn)化為適用于Illumina®平臺測序的文庫。
本試劑盒包含兩個獨(dú)立模塊：BOX-I和BOX-II。BOX-I為提取DNA的DNA Extract Beads和回收文庫的DNA Clean Beads，BOX-II包含細(xì)胞裂解、片段化以及后續(xù)文庫擴(kuò)增所需的所有試劑。此外，本試劑盒已在不同種類樣本(如K562、MCF-7細(xì)胞，小鼠肝臟等)中進(jìn)行了驗證，均具有良好的建庫效率和建庫產(chǎn)量。本試劑盒提供的所有試劑都經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗證，最大程度上保證了文庫的穩(wěn)定性和重復(fù)性。
●含兩種純化磁珠：針對小片段純化，回收效果更好。
●實驗操作簡單、實驗周期短：建庫一步法，節(jié)省建庫時間；
●樣本投入量低，投入量兼容范圍廣：能兼容100~10萬個細(xì)胞投入。
●實驗重復(fù)性好
產(chǎn)品應(yīng)用：ATAC-seq、染色質(zhì)開放性研究、轉(zhuǎn)錄因子鑒定、足跡分析等
1、不同細(xì)胞投入量的ATAC建庫結(jié)果一致性較高
293細(xì)胞ATAC建庫，細(xì)胞投入量從100個到10萬個，不同細(xì)胞投入量建庫后，文庫峰型以及IGV可視化結(jié)果一致性較高。
2、凍存樣本ATAC建庫結(jié)果展示
對不同凍存時間的樣本進(jìn)行ATAC建庫，目前測試凍存20天內(nèi)的樣本建庫無問題，且測序結(jié)果信號明顯。
凍存樣本要求：盡量客戶樣本保存在液氮中，如果保存-80℃冰箱，需要無反復(fù)凍融情況。
BOX-I：2~8℃保存。
BOX-II：-25~-15℃保存。
Q：投入多少細(xì)胞量合適？
A：兼容100-100000個細(xì)胞或細(xì)胞核，最佳投入量為5w個細(xì)胞或細(xì)胞核。
Q：ATAC文庫產(chǎn)量低的原因？
A：1. 細(xì)胞核投入量少或?qū)嶒炦^程中細(xì)胞核部分丟失。細(xì)胞核離心后棄去上清液時容易造成丟失，在離心時，統(tǒng)一EP管方向并標(biāo)記細(xì)胞沉積位置，棄上清時避免碰到沉淀，在實驗操作過程中避免劇烈渦旋振蕩；2. 轉(zhuǎn)座酶切割不充分，這種原因有很多，首選需要確認(rèn)細(xì)胞核的純度，如果雜質(zhì)較多，可能影響轉(zhuǎn)座酶的效果，提取細(xì)胞核時盡量多清洗幾遍，以獲得純凈的細(xì)胞核。
Q：TSS富集程度不好是什么原因？如何增加？
A：TSS富集效果不好通常是由于實驗樣本細(xì)胞活性不好或游離DNA較多。可對細(xì)胞或細(xì)胞核進(jìn)行鏡檢確認(rèn)細(xì)胞或細(xì)胞核完整性。
2、ATAC文庫中的線粒體reads較多，如何減少？
A：通常是由于細(xì)胞核提取過程中，細(xì)胞漂洗時未能吸出所有的上清液(其中包含mtDNA)。應(yīng)吸盡上清，同時注意不要影響到細(xì)胞核完整性。或者可以多清洗幾遍，提升細(xì)胞核的純度。