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進(jìn)化分析

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  • 分子系統(tǒng)發(fā)育分析: 基于核酸序列、氨基酸序列構(gòu)建進(jìn)化樹(距離法、簡(jiǎn)約法、似然法及貝葉斯 推斷)、系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹的精確性和統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)、重建祖先序列、估計(jì)同義與非同義核酸置換速率、相對(duì)速率檢驗(yàn)、分子鐘假說檢驗(yàn)、估計(jì)物種分歧時(shí)間
  • 適應(yīng)性進(jìn)化檢測(cè):即承受正選擇的分枝和位點(diǎn)的檢測(cè)
  • 基因水平轉(zhuǎn)移檢驗(yàn)
  • 密碼子研究
  • 遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù): snp分析、等位基因頻率分析
  • 趨同進(jìn)化、平行進(jìn)化、網(wǎng)狀進(jìn)化分析