舍為斯-16s/18s/ITs微生物多樣性測序/微生物/多樣性測序/多樣性/測序/微生物鑒定/微生物學(xué)服務(wù)
產(chǎn)品名稱: 舍為斯-16s/18s/ITs微生物多樣性測序/微生物/多樣性測序/多樣性/測序/微生物鑒定/微生物學(xué)服務(wù)
英文名稱: 16S / 18S / its microbial diversity sequencing
產(chǎn)品編號:
產(chǎn)品價格: 10000
產(chǎn)品產(chǎn)地: null
品牌商標(biāo): null
更新時間: null
使用范圍: null
- 聯(lián)系人 :
- 地址 : 天津市濱海新區(qū)洞庭路220號(國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院實驗樓N212室)
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- 所在區(qū)域 : 天津
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- 郵箱 : sws008@sheweisi.com.cn
產(chǎn)品簡介
? ? ? ?擴增子測序,即對特定長度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進行測序,主要包括16S rDNA測序、18S rDNA測序及ITS測序等。擴增子測序通常是選擇某個或某幾個變異區(qū)域,利用保守區(qū)設(shè)計通用引物進行PCR擴增,然后對高變區(qū)進行測序分析和菌種鑒定,具有所需樣本量少、高通量和高精確性等特點。
數(shù)據(jù)分析策略
1.從測序所得的原始數(shù)據(jù)出發(fā),首先對原始數(shù)據(jù)進行質(zhì)控,得到有效數(shù)據(jù)(Clean Data);
2.基于有效數(shù)據(jù)進行OTUs(Operational Taxonomic Units)聚類;
3.根據(jù)OTUs聚類結(jié)果,一方面對每個OTU的代表序列做物種注釋,得到對應(yīng)的物種信息,另一方面將各個樣品的有效數(shù)據(jù),和代表序列進行比對,獲得對應(yīng)OTU在各個樣品中的豐度分布情況;
4.基于構(gòu)建好的OTU豐度表,獲得不同分類層級的物種豐度表;
5.基于OTU豐度表及不同分類層級的豐度表,進行樣品微生物群落組成分析;
6.基于OTU豐度表及不同分類層級的豐度表,進行Alpha多樣性和Beta多樣性分析;
7.根據(jù)研究需求,可選擇高級分析,深入挖掘樣品中的物種組成和差異。
數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

