舍為斯-16s/18s/ITs微生物多樣性測(cè)序/微生物/多樣性測(cè)序/多樣性/測(cè)序/微生物鑒定/微生物學(xué)服務(wù)
產(chǎn)品名稱(chēng): 舍為斯-16s/18s/ITs微生物多樣性測(cè)序/微生物/多樣性測(cè)序/多樣性/測(cè)序/微生物鑒定/微生物學(xué)服務(wù)
英文名稱(chēng): 16S / 18S / its microbial diversity sequencing
產(chǎn)品編號(hào):
產(chǎn)品價(jià)格: 10000
產(chǎn)品產(chǎn)地: null
品牌商標(biāo): null
更新時(shí)間: null
使用范圍: null
- 聯(lián)系人 :
- 地址 : 天津市濱海新區(qū)洞庭路220號(hào)(國(guó)際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院實(shí)驗(yàn)樓N212室)
- 郵編 :
- 所在區(qū)域 : 天津
- 電話(huà) : 199****7108 點(diǎn)擊查看
- 傳真 : 點(diǎn)擊查看
- 郵箱 : sws008@sheweisi.com.cn
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
? ? ? ?擴(kuò)增子測(cè)序,即對(duì)特定長(zhǎng)度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進(jìn)行測(cè)序,主要包括16S rDNA測(cè)序、18S rDNA測(cè)序及ITS測(cè)序等。擴(kuò)增子測(cè)序通常是選擇某個(gè)或某幾個(gè)變異區(qū)域,利用保守區(qū)設(shè)計(jì)通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后對(duì)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序分析和菌種鑒定,具有所需樣本量少、高通量和高精確性等特點(diǎn)。
數(shù)據(jù)分析策略
1.從測(cè)序所得的原始數(shù)據(jù)出發(fā),首先對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控,得到有效數(shù)據(jù)(Clean Data);
2.基于有效數(shù)據(jù)進(jìn)行OTUs(Operational Taxonomic Units)聚類(lèi);
3.根據(jù)OTUs聚類(lèi)結(jié)果,一方面對(duì)每個(gè)OTU的代表序列做物種注釋?zhuān)玫綄?duì)應(yīng)的物種信息,另一方面將各個(gè)樣品的有效數(shù)據(jù),和代表序列進(jìn)行比對(duì),獲得對(duì)應(yīng)OTU在各個(gè)樣品中的豐度分布情況;
4.基于構(gòu)建好的OTU豐度表,獲得不同分類(lèi)層級(jí)的物種豐度表;
5.基于OTU豐度表及不同分類(lèi)層級(jí)的豐度表,進(jìn)行樣品微生物群落組成分析;
6.基于OTU豐度表及不同分類(lèi)層級(jí)的豐度表,進(jìn)行Alpha多樣性和Beta多樣性分析;
7.根據(jù)研究需求,可選擇高級(jí)分析,深入挖掘樣品中的物種組成和差異。
數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

