4D-DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
產(chǎn)品名稱： 4D-DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)
英文名稱： 4D-DIA quantitative proteomics
產(chǎn)品編號： AX-S045
產(chǎn)品價格： 詢價
產(chǎn)品產(chǎn)地： null
品牌商標(biāo)： null
更新時間： 2024-03-06T15:05:43
使用范圍： null
- 聯(lián)系人 : 楊雨
- 地址 : 武漢東湖新技術(shù)開發(fā)區(qū)光谷大道70號B-1棟(原5棟)2樓S02號
- 郵編 : /
- 所在區(qū)域 : 湖北
- 電話 : 180****4798 點(diǎn)擊查看
- 傳真 : 點(diǎn)擊查看
- 郵箱 : 2108370006@qq.com
實(shí)驗(yàn)介紹
4D-蛋白質(zhì)組學(xué)是基于新一代timsTOF Pro質(zhì)譜儀，通過捕集離子淌度（TIMS）與同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）掃描模式進(jìn)行差異定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究。該技術(shù)核心是在傳統(tǒng)3D分離（保留時間、質(zhì)荷比、離子強(qiáng)度）基礎(chǔ)上，增加肽段的碰撞截面積（CCS），實(shí)現(xiàn)第4維度（離子淌度）的分離檢測。 4D-DIA蛋白質(zhì)組學(xué)是基于timsTOF Pro離子淌度平臺的新一代DIA技術(shù)，通過數(shù)據(jù)非依賴采集-同步累積連續(xù)碎裂（diaPASEF）掃描模式進(jìn)行差異定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析。將DIA技術(shù)與基于timsTOF Pro上的diaPASEF技術(shù)相結(jié)合，具有高掃描速度和高靈敏度優(yōu)勢的同時，外加第四維離子淌度分離，使DIA數(shù)據(jù)在采集時不犧牲窗口循環(huán)速度的同時，降低譜圖復(fù)雜度和提高離子利用率，實(shí)現(xiàn)了蛋白質(zhì)組學(xué)在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。
實(shí)驗(yàn)流程：
應(yīng)用方向
▶ 臨床微量樣本最佳檢測方式，如：外泌體、FFPE石蠟切片、活檢穿刺組織等
▶ 臨床大隊列樣本分析，如腫瘤、心血管等重大疾病精準(zhǔn)分型
▶ 作物群體性狀等大規(guī)模樣本研究，如育種品系、脅迫干預(yù)等
▶ 臨床生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)：DIA接近MRM的定量能力，實(shí)現(xiàn)標(biāo)志物篩選與初步驗(yàn)證過程合二為一
▶ 生物樣本信息庫構(gòu)建：DIA可實(shí)現(xiàn)生物信息的完整保存，為后續(xù)回溯分析提供保障。藥物應(yīng)答、基因敲除/過表達(dá)的蛋白表達(dá)譜分析
數(shù)據(jù)分析
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
鑒定結(jié)果統(tǒng)計與分析 | 樣本蛋白質(zhì)及肽段鑒定柱狀圖、PCA分布圖、定量差異統(tǒng)計分析 |
生物信息學(xué)分析 | GO及GO富集、KEGG及KEGG富集分析、PPI互作網(wǎng)絡(luò)與module分析 |
差異上下調(diào)蛋白KEGG蝴蝶圖、KEGG通路功能歸屬等 | |
高級數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
標(biāo)志物篩選 | 集成機(jī)器學(xué)習(xí)、LASSO回歸分析、標(biāo)志物panel、ROC分析 |
分子分型分析 | 無監(jiān)督聚類分型分析、蛋白質(zhì)組+轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析、激酶分析 |
臨床表征與組學(xué)結(jié)果聯(lián)合分析 | |
疾病相關(guān)功能模塊分析 | WGCNA共表達(dá)分析 |
生存曲線分析 | 臨床分型與生存曲線分析 |