??轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和，主要包括 mRNA和非編碼RNA 。轉錄組研究是基因功能及結構研究的基礎和出發點，通過新一代高通量測序，能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息，已廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。

技術優勢

1. 任意物種的全轉錄組分析：無需預先設計特異性探針，因此無需了解物種基因或基因組信息，能夠直接對任何物種進行最全面的轉錄組分析；
2. 覆蓋度高：數字化信號，直接測定幾乎所有轉錄本片段的序列；
3. 檢測閾值寬：跨越6個數量級的寬檢測閾值，從幾個到數十萬個拷貝精確計數cli>
4. 分辨率高：可以檢測基因家族中相似基因及可變剪接造成的單堿基差異；
5. 檢測范圍廣：從幾個到數十萬個拷貝精確計數，可同時鑒定及定量正常和稀有的轉錄本。

研究內容

一、無參考基因組序列的轉錄組

1. 標準信息分析

1)??? 對原始數據進行去除接頭、污染序列及低質量reads的處理；

2)??? 數據產出統計及測序數據的成分和質量評估；

3)??? 組裝結果分析；

4)??? Unigene功能注釋；

5)??? Unigene的GO分類；

6)??? Unigene的COG 分類；

7)??? Unigene代謝通路分析；

8)??? 預測編碼蛋白框（CDS）；

9)??? Unigene表達差異分析；

10)?? Unigene在樣品間的差異GO分類和Pathway富集性分析。

2. 定制化信息分析

可結合客戶的需求，協商確定定制化信息分析內容；

二、有參考基因組序列的轉錄組

?1.?標準信息分析

1)?? 對原始數據進行去除接頭、污染序列及低質量reads的處理；

2)?? 測序評估；

3)?? 基因表達注釋；

4)?? 基因差異表達分析；

5)?? 對基因結構進行優化（僅針對真核生物）；

6)?? 鑒定基因的可變剪接（僅針對真核生物）；

7)?? 預測新轉錄本；

8)?? SNP 分析。

2. 定制化信息分析

可結合客戶的需求，協商確定定制化信息分析內容。

三、 鏈特異性轉錄組（需提供參考基因序列、參考基因組序列）

鏈特異性技術，也稱 strand-specific RNA sequencing method，是一種能夠區分正義鏈或反義鏈信息的方法，其對于轉錄組的功能分析具有十分重要的意義。

1. 標準信息分析

1）? 正負鏈信息；

2）? 反義鏈表達；

3）? 其他（分析內容同常規轉錄組）。

2. 定制化信息分析

可結合客戶的需求，協商確定定制化信息分析內容。

四、均一化文庫

分析內容同常規轉錄組。

五、非編碼RNA測序分析（需提供參考基因序列、參考基因組序列及基因注釋結果）

定制化信息分析:?可結合客戶的需求，協商確定定制化信息分析內容。