
Visium HD 開啟了空間探索的新時代,它通過單細胞水平的分辨率增強了成熟的全轉錄組空間分析,實現了連續的組織覆蓋,并通過基于探針的創新化學方法和基于 Visium CytAssist 的工作流程帶來了一流的數據。
無偏好性的單細胞分辨率
此次發布的 VisiumHD 芯片摒棄了以大直徑 55um 的 spot 設計,而是采用 2 *2um 的正方形當做基礎分析單位,芯片中間沒有空隙。真正的能夠做到無間隙,無偏好性的單細胞分辨率水平的空間轉錄組。目前 HD 芯片發布捕獲框大小是 6.5*6.5mm 的規格,可檢測物種是人和小鼠,兼容石蠟樣本。

▲Visium HD 空間基因表達玻片包含兩個 6.5 x 6.5 mm 的捕獲區

▲Visium HD 空間基因表達玻片的捕獲區含有約 1100 萬個 2 x 2 µm 連續區塊,實現單細胞水平的空間分辨率。
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Visium
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Visium HD
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搭載 Visium CytAssist 獲得最好的數據
Visium HD 將強大的全轉錄組空間基因表達與單細胞尺度分辨率結合起來,來發現每一微米組織中獨特的生物學特性。同時啟用 CytAssist 儀器,讓樣本在簡單的運行工作流中獲得最好的數據。

▲全轉錄組、單細胞分辨率、連續覆蓋

▲通過 Visium CytAssist 實現精準的轉錄本定位

▲通過高分辨率的空間轉錄組學來增強 H & E 或 IF 成像后的樣本。

▲從 FFPE 組織塊或載玻片上的組織切片中獲得強大的數據


▲兼容 H & E 染色以及 IF 染色 Visium HD 空間基因表達兼容 H &E 染色以及 IF 染色。
(可在同一組織切片上進行高分辨率空間轉錄組學數據分析)
Visium HD 芯片與基礎芯片技術比較
| 芯片型號 | Visium | Visium CytAssist | Visium HD |
| 分辨率 | 直徑 55um | 直徑 55um | 2*2um, 全組織覆蓋 |
| 檢測范圍 | mRNA | mRNA | mRNA |
| 物種 | 全物種 | 人 / 小鼠 | 人 / 小鼠 |
| 組織兼容性 | FF | FF/FFPE | FFPE(后面應該會加入 FF) |
| 捕獲原理 |
polyA 尾捕獲 |
探針法捕獲 | 探針法捕獲 |
| 芯片大小 | 6.5 mm× 6.5 mm | 6.5 mm × 6.5 mm 11 mm × 11 mm |
6.5 mm× 6.5 mm |


