Visium HD | 空間基因表達-分子生物學服務 -技術服務-生物在線
上海伯豪生物技術有限公司
Visium HD | 空間基因表達

Visium HD | 空間基因表達

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產品名稱: Visium HD | 空間基因表達

英文名稱: Shbio

產品編號: 無

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更新時間: 2025-04-15T16:07:51

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Visium HD | 空間基因表達

技術簡介

Visium HD 開啟了空間探索的新時代,它通過單細胞水平的分辨率增強了成熟的全轉錄組空間分析,實現了連續的組織覆蓋,并通過基于探針的創新化學方法和基于 Visium CytAssist 的工作流程帶來了一流的數據。

無偏好性的單細胞分辨率

此次發布的 VisiumHD 芯片摒棄了以大直徑 55um 的 spot 設計,而是采用 2 *2um 的正方形當做基礎分析單位,芯片中間沒有空隙。真正的能夠做到無間隙,無偏好性的單細胞分辨率水平的空間轉錄組。目前 HD 芯片發布捕獲框大小是 6.5*6.5mm 的規格,可檢測物種是人和小鼠,兼容石蠟樣本。

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▲Visium HD  空間基因表達玻片包含兩個 6.5 x 6.5 mm 的捕獲區

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▲Visium HD  空間基因表達玻片的捕獲區含有約 1100 萬個 2 x 2 µm 連續區塊,實現單細胞水平的空間分辨率。

 

 Visium
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 Visium HD
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搭載 Visium CytAssist 獲得最好的數據  

Visium HD 將強大的全轉錄組空間基因表達與單細胞尺度分辨率結合起來,來發現每一微米組織中獨特的生物學特性。同時啟用 CytAssist  儀器,讓樣本在簡單的運行工作流中獲得最好的數據。

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▲全轉錄組、單細胞分辨率、連續覆蓋

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▲通過 Visium CytAssist 實現精準的轉錄本定位

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▲通過高分辨率的空間轉錄組學來增強 H & E 或 IF 成像后的樣本。

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▲從 FFPE 組織塊或載玻片上的組織切片中獲得強大的數據

 

技術原理

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▲兼容 H & E 染色以及 IF 染色 Visium HD 空間基因表達兼容 H &E 染色以及 IF 染色。

(可在同一組織切片上進行高分辨率空間轉錄組學數據分析)

 

Visium HD  芯片與基礎芯片技術比較

芯片型號 Visium Visium CytAssist Visium HD
分辨率 直徑 55um 直徑 55um 2*2um, 全組織覆蓋
檢測范圍 mRNA mRNA mRNA
物種 全物種 人 / 小鼠 人 / 小鼠
組織兼容性 FF FF/FFPE FFPE(后面應該會加入 FF)
捕獲原理

polyA 尾捕獲

探針法捕獲 探針法捕獲
芯片大小 6.5 mm× 6.5 mm 6.5 mm × 6.5 mm
11 mm × 11 mm
6.5 mm× 6.5 mm

 

伯豪生物客戶項目發文

序號 伯豪生物提供服務 文章名稱 雜志 IF 發表年份 研究方向
1

【樣本】角膜組織

【服務】空間轉錄組測序

Identification of glutamine as a potential therapeutic target in dry eye disease Signal Transduction and Targeted Therapy 40.8 2025年 疾病機制
2

【樣本】外周血

【服務】空間轉錄組測序

Unveiling the immunological landscape of disseminated tuberculosis: a single-cell transcriptome perspective Frontiers in Immunology 5.7 2025年 疾病機制
3

【樣本】宮頸組織

【服務】空間轉錄組測序

Radiotherapy-Associated Cellular Senescence and EMT Alterations Contribute to Distinct Disease Relapse Patterns in Locally Advanced Cervical Cancer Advanced Science 14.3 2025年 醫學機制
4

【樣本】滑膜組織

【服務】空間轉錄組測序

CCN2 mediates fibroblast-macrophage interaction in knee arthrofibrosis based on single-cell RNA-seq analysis Bone Research 14.3 2025年 醫學機制
5

【樣本】肺轉移腫瘤組織

【服務】空間轉錄組測序

Methionine intervention induces PD-L1 expression to enhance the immune checkpoint therapy response in MTAP-deleted osteosarcoma Cell Reports Medicine 11.7 2025年 醫學機制
6

【樣本】肺組織

【服務】空間轉錄組測序

Single-cell atlas reveals multi-faced responses of losartan on tubular mitochondria in diabetic kidney disease Journal of Translational Medicine 6.1 2025年  疾病機制
7

【樣本】腦組織

【服務】空間轉錄組測序

Neuroligin 1 Regulates Autistic-Like Repetitive Behavior through Modulating the Activity of Striatal D2 Receptor-Expressing Medium Spiny Neurons Advanced Science 14.3 2024年 疾病機制
8

【樣本】肝臟組織

【服務】空間轉錄組測序

Potential role of liver resident CD3+ macrophages in HBV clearance in a mouse hepatitis B model JHEP Reports 9.5 2024年 疾病機制