sRNA測序/mRNA測序/LnRNA測序

sRNA測序

Small RNA測序是基于Illumina HiSeq2500測序平臺，研究特定組織在特定狀態下的所有已知Small RNA，也可以發現新的或特有的Small RNA并預測其靶基因，為研究Small RNA的功能及基因調控機制提供了有力手段。Small RNA主要包括microRNA、siRNA(Small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)三類。

案例分析

利用Illumina第二代測序技術進了激素性股骨頭壞死患者血漿miRNA的高通量測序研究。成功的構建激素性股骨頭壞死患者血漿miRNA的cDNA文庫。通過比較狼瘡合并股骨頭壞死患者與狼瘡對照患者及健康志愿者的血漿miRNA測序結果，發現27個差異表達的血漿miRNA，其中15個miRNA表達上調，12個miRNA表達下調。研究為激素性股骨頭壞死早期診斷的血清標記物研究奠定了基礎。同時股骨股骨頭壞死特異性miRNA的存在，提示miRNA可能參與了股骨頭壞死發病過程的調控，其具體機制尚不明確，尚需進一步研究予以闡明。

選mRNA表達水平熱圖

mRNA測序

轉錄組測序是基于HiSeq平臺，對待特定組織或者細胞在某個時期轉錄出來的所有mRNA進行測序，即可研究已知基因，亦能發掘新基因，全面快速地獲得mRNA序列和風度信息。

案例分析

案 例 通過RNAseq技術全面解析乳腺癌組織中的可變剪切形式

乳腺癌組織由特定形式的轉錄本發揮特殊功能，本研究應用RNAseq技術獲得了三種典型乳腺癌組織TNBC、non-TNBC和HER2陽性乳腺癌的轉錄本信息。該研究發現了新可變剪切形式和可變剪切后的新轉錄本，進一步研究發現，乳腺癌組織與正常乳腺組織在轉錄本表達水平和啟動子轉移水平存在顯著差異，并RT-PCR驗證CDK4，LARP1 , ADD3和PHLPP2等轉錄本形式。該研究第一次系統研究了不同亞型乳腺癌組織轉錄本利用可變剪切形式和轉錄本特異表達的情況。

LnRNA測序

長鏈非編碼RNA測序介紹：

長鏈非編碼RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一類長度超過200 nt的長鏈非編碼RNA，通過與DNA、RNA或蛋白質結合，在表觀遺傳、轉錄及轉錄后等水平調控基因表達。
測序采用Illumina HiSeq平臺進行測序，針對有參考基因組樣本開展準確的lncRNA鑒定
和lncRNA靶基因預測，同時提供針對測序數據中mRNA的分析，結果更全面，廣泛應用于醫學、農學研究領域。

長鏈非編碼RNA測序的特點：

LncRNA的研究作為RNA研究的新領域，在生產、生活、健康方面具有重要意義，可通過不同的分子生物學機制調控編碼基因的表達，在生產上對物種的改良，在人類健康方面參與疾病相關的信號通路從而對疾病的發生發展及治療有重要作用。

長鏈非編碼RNA測序操作步驟：

1、研究對象的選??；

2、提取RNA，RNA量≥2.0ug;

3、鏈特異性文庫的構建；

4、PE150測序（12-24Gb）;

5、信息分析，利用六步法對lncRNA進行準確篩選，高效預測靶基因，并完成對轉錄本中mRNA的分析，以及lncRNA和mRNA的比較分析、共表達網絡構建。

客戶提供目的樣本：

如動物組織、細胞等以及相關的樣本信息，需要干冰運輸。

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