?——即質譜法全序列分析的技術服務

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蛋白質的氨基酸序列分析，包括N/C端氨基酸和全序列氨基酸序列分析。經典的氨基酸序列分析方法主要是使用化學方法進行解析（如Edman法），這里要介紹的是使用質譜法對氨基酸全序列進行分析。APT為客戶提供兩種質譜方案，分別是MALDI-TOF/TOF法和LTQ-Velos法。其中MALDI-TOF/TOF方法擅長對多肽類樣品進行全序列分析（包括含有復雜修飾的多肽）；LTQ-Velos方法較適合對蛋白質類樣品的N/C端進行氨基酸序列分析。不少多肽類的藥物分子中含有大量的非標準氨基酸、各種修飾和環形結構等等，APT為客戶提供的質譜法全序列分析是現有科技能力下的最有效的序列解析方法。

“當遇到非標準氨基酸時，經典的化學方法（Edman）法就無能為力了?！?/span>

多肽類藥物的質譜法結構確認

隨著生物科技的不斷進步，多肽藥物在新藥研發中正占據越來越大的比重，而多肽分子結構的復雜性又要求對多肽藥物必須進行全面表征，以滿足新藥報批、工藝改進和專利保護的要求。目前多肽藥物的研發和表征還面臨很多挑戰，尤其是在重組多肽的序列確證、不同批次間產品的比較和質量控制等方面。

技術指標

質譜法全序列分析的供試品，大多數情況下是多肽類樣品。原因是對于全序列分析而言，分子量不宜太大（盡管現在也有一些Top-down的質譜方法進行全序列分析，但是目前APT并不提供這類服務工作）。多肽類樣品無論在MALDI-TOF/TOF還是LC-MS/MS中進行序列分析，分子量的范圍一般情況下都在800-4000Da之間。分子量太小，由于碎片中的序列信息不足難以分析；分子量太大，由于質譜儀器本身的碎裂能量限制，也不能得到良好的碎片信息對氨基酸序列進行分析。

案例分析

下圖顯示的是一個多肽類藥物的全序列碎片圖譜，通過人工和算法比對，可以從圖譜中得到多肽分子的序列信息。

質譜法全序列分析案例圖譜

Q&A

1)???質譜方法對多肽類藥物的復雜修飾、環形結構進行全序列解析工作。

使用質譜方法對多肽藥物分子的全序列進行分析的基本原理為：多肽分子的分子量一般在800-4000Da，在這個范圍內質譜儀能夠有效地分析多肽分子的分子量，并將其破碎后成為MS2。通過記錄供試品母離子及其碎片離子信息，再與其理論序列比對，就可確定該序列中的氨基酸組成及排列方式。