人類miRNA芯片Human miRNA?OneArray????v5?
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? ? 人類 miRNA 芯片 v5 延續 v4 的設計原理, 參考 Sanger miRBase 數據庫 release 19.0 的序列進行探針設計, 并以自有的高速布放技術進行芯片生產。v5 版芯片于 2013 年 7月正式上線。
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探針信息
| 人類miRNA芯片v5探針內容 |
| 學名 |
Homo sapiens |
| 常用中文名稱 |
人類 |
| 探針代表號 |
hsa |
| 常用英文名稱 |
Human |
| miRNA探針數 |
2,003 |
| 總所對應的成熟miRNA數 |
2,019 |
| miRNA探針重復數 |
3 |
| 控制探針數 |
144 |
| 總探針數 |
6,153 |
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基因探針?
? ? 人類 miRNA 芯片 v5 是參考 Sanger miRBase 數據庫 release 19.0 的序列進行探針設計, 共有?2,003 個序列,可對應到?2,019 個成熟的 miRNA, 在探針設計的過程,依據各序列的特性,進行嚴格 Tm 值的把關及調整。 在每一芯片上,每一個 miRNA 序列具有 3 個重復的探針。
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控制探針?
? ? 為確保芯片數據質量,華聯技術團隊經過一連串的測試及驗證, 設計一系列的質量控制探針,以監控完整的芯片實驗步驟,包含樣本RNA完整性、樣本RNA放大流程、熒光標記效率、芯片雜交、芯片掃描等。
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小鼠&大鼠miRNA芯片?Mouse&Rat miRNA OneArray??v4?
? ? 小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 延續 v3 的設計原理, 參考 Sanger miRBase 數據庫 release 18 的序列進行探針設計, 并以自有的高速布放技術進行芯片生產。v3 版芯片于 2012 年 3 月正式上線。
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探針信息
| 小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 探針內容 |
| 學名 |
Mus musculus |
Rattus norvegicus? |
| 常用中文名稱 |
小鼠 |
大鼠? |
| 常用英文名稱 |
Mouse |
Rat? |
| 探針代表號 |
mmu |
rno? |
| miRNA探針數 |
1,129 |
676 |
| 所對應的成熟miRNA |
1,157 |
680 |
| RmiOA v3 miRNA探針總數 |
1,362 |
| RmiOA v3 所對應的成熟miRNA總數 |
1,837 |
| miRNA探針重復數 |
3 |
| 控制探針數 |
144 |
| 總探針數 |
4,230 |
?
基因探針?
? ? 小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 是參考 Sanger miRBase 數據庫 release 18 的序列進行探針設計, 共計 1,362 個序列, 可對應到 1,837 個成熟的 miRNA, 在探針設計的過程,依據各序列的特性,進行嚴格 Tm 值的把關及調整。 在每一芯片上,每一個 miRNA 序列具有 3 個重復的探針。
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控制探針?
? ? 為確保芯片數據質量,華聯技術團隊經過一連串的測試及驗證, 設計一系列的質量控制探針,以監控完整的芯片實驗步驟,包含矩陣校準標記探針、 陽性控制探針及陰性控制探針。
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??華聯生物芯片探針設計主要以Sanger miRBase的資料庫為主,依資料庫的更新狀態,定期提供新版本探針內容的人類、小鼠與大鼠的標準miRNA芯片,詳細規格如下表:
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| miRNA芯片 |
基因探針數 |
對應miRNA數 |
控制探針數 |
探針重復數 |
參考數據庫 |
| HmiOA v3 Human miRNA OneArray |
1,711 |
1,732 |
105 |
3 |
Sanger miRBase v17 |
| RmiOA v3 Mouse & Rat miRNA OneArray |
Mouse 1,080 |
Mouse 1,111 |
105 |
3 |
Sanger miRBase v17 |
| ?Rat 680 |
?Rat 672 |
| MPmiOA v3 Model Plant miRNA OneArray |
1,022? |
1,817? |
105? |
3? |
?Sanger miRBase v17 |
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