人類miRNA芯片Human miRNA?OneArray????v5?
???????
? ? 人類 miRNA 芯片 v5 延續(xù) v4 的設(shè)計(jì)原理， 參考 Sanger miRBase 數(shù)據(jù)庫(kù) release 19.0 的序列進(jìn)行探針設(shè)計(jì)， 并以自有的高速布放技術(shù)進(jìn)行芯片生產(chǎn)。v5 版芯片于 2013 年 7月正式上線。
?
探針信息
| 人類miRNA芯片v5探針內(nèi)容 |
| 學(xué)名 |
Homo sapiens |
| 常用中文名稱 |
人類 |
| 探針代表號(hào) |
hsa |
| 常用英文名稱 |
Human |
| miRNA探針數(shù) |
2,003 |
| 總所對(duì)應(yīng)的成熟miRNA數(shù) |
2,019 |
| miRNA探針重復(fù)數(shù) |
3 |
| 控制探針數(shù) |
144 |
| 總探針數(shù) |
6,153 |
?
基因探針?
? ? 人類 miRNA 芯片 v5 是參考 Sanger miRBase 數(shù)據(jù)庫(kù) release 19.0 的序列進(jìn)行探針設(shè)計(jì)， 共有?2,003 個(gè)序列，可對(duì)應(yīng)到?2,019 個(gè)成熟的 miRNA， 在探針設(shè)計(jì)的過程，依據(jù)各序列的特性，進(jìn)行嚴(yán)格 Tm 值的把關(guān)及調(diào)整。 在每一芯片上，每一個(gè) miRNA 序列具有 3 個(gè)重復(fù)的探針。
?
控制探針?
? ? 為確保芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量，華聯(lián)技術(shù)團(tuán)隊(duì)經(jīng)過一連串的測(cè)試及驗(yàn)證， 設(shè)計(jì)一系列的質(zhì)量控制探針，以監(jiān)控完整的芯片實(shí)驗(yàn)步驟，包含樣本RNA完整性、樣本RNA放大流程、熒光標(biāo)記效率、芯片雜交、芯片掃描等。
?
小鼠&大鼠miRNA芯片?Mouse&Rat miRNA OneArray??v4?
? ? 小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 延續(xù) v3 的設(shè)計(jì)原理， 參考 Sanger miRBase 數(shù)據(jù)庫(kù) release 18 的序列進(jìn)行探針設(shè)計(jì)， 并以自有的高速布放技術(shù)進(jìn)行芯片生產(chǎn)。v3 版芯片于 2012 年 3 月正式上線。
?
探針信息
| 小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 探針內(nèi)容 |
| 學(xué)名 |
Mus musculus |
Rattus norvegicus? |
| 常用中文名稱 |
小鼠 |
大鼠? |
| 常用英文名稱 |
Mouse |
Rat? |
| 探針代表號(hào) |
mmu |
rno? |
| miRNA探針數(shù) |
1,129 |
676 |
| 所對(duì)應(yīng)的成熟miRNA |
1,157 |
680 |
| RmiOA v3 miRNA探針總數(shù) |
1,362 |
| RmiOA v3 所對(duì)應(yīng)的成熟miRNA總數(shù) |
1,837 |
| miRNA探針重復(fù)數(shù) |
3 |
| 控制探針數(shù) |
144 |
| 總探針數(shù) |
4,230 |
?
基因探針?
? ? 小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v4 是參考 Sanger miRBase 數(shù)據(jù)庫(kù) release 18 的序列進(jìn)行探針設(shè)計(jì)， 共計(jì) 1,362 個(gè)序列， 可對(duì)應(yīng)到 1,837 個(gè)成熟的 miRNA， 在探針設(shè)計(jì)的過程，依據(jù)各序列的特性，進(jìn)行嚴(yán)格 Tm 值的把關(guān)及調(diào)整。 在每一芯片上，每一個(gè) miRNA 序列具有 3 個(gè)重復(fù)的探針。
?
控制探針?
? ? 為確保芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量，華聯(lián)技術(shù)團(tuán)隊(duì)經(jīng)過一連串的測(cè)試及驗(yàn)證， 設(shè)計(jì)一系列的質(zhì)量控制探針，以監(jiān)控完整的芯片實(shí)驗(yàn)步驟，包含矩陣校準(zhǔn)標(biāo)記探針、 陽(yáng)性控制探針及陰性控制探針。
?
??華聯(lián)生物芯片探針設(shè)計(jì)主要以Sanger miRBase的資料庫(kù)為主，依資料庫(kù)的更新狀態(tài)，定期提供新版本探針內(nèi)容的人類、小鼠與大鼠的標(biāo)準(zhǔn)miRNA芯片，詳細(xì)規(guī)格如下表：
?
| miRNA芯片 |
基因探針數(shù) |
對(duì)應(yīng)miRNA數(shù) |
控制探針數(shù) |
探針重復(fù)數(shù) |
參考數(shù)據(jù)庫(kù) |
| HmiOA v3 Human miRNA OneArray |
1,711 |
1,732 |
105 |
3 |
Sanger miRBase v17 |
| RmiOA v3 Mouse & Rat miRNA OneArray |
Mouse 1,080 |
Mouse 1,111 |
105 |
3 |
Sanger miRBase v17 |
| ?Rat 680 |
?Rat 672 |
| MPmiOA v3 Model Plant miRNA OneArray |
1,022? |
1,817? |
105? |
3? |
?Sanger miRBase v17 |
?
