如何進行組蛋白丙二酰化蛋白質組學分析?
產品名稱: 如何進行組蛋白丙二酰化蛋白質組學分析?
英文名稱: How to Perform Histone Malonylation Proteomics Analysis?
產品編號: histone-malonylation-analysis-zh7
產品價格: 詢價
產品產地: 中國北京
品牌商標: 百泰派克生物科技
更新時間: 2026-06-06T11:31:30
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組蛋白丙二酰化(Histone Propionylation, Hpr)是一種新型組蛋白酰化修飾,近年來在表觀遺傳學和代謝研究中備受關注。丙二酰化通過在組蛋白賴氨酸殘基上添加丙二酰基,影響染色質結構和基因表達,為研究代謝與表觀遺傳的聯系提供了新視角。為了深入理解丙二酰化的生物學功能,蛋白質組學分析成為不可或缺的工具。
一、為什么要進行組蛋白丙二酰化蛋白質組學分析?
常規的組蛋白修飾研究往往依賴免疫印跡(Western blot)或染色質免疫沉淀(ChIP)技術,雖然可以定性或半定量分析單個修飾,但難以同時捕獲全組蛋白修飾的動態變化。
蛋白質組學分析通過高分辨質譜(HRMS)可以實現:
- 高覆蓋識別:同時檢測多個丙二酰化位點及其他修飾(如乙酰化、甲基化)。
- 精確定量:對低豐度修飾位點實現可靠定量。
- 動態監測:分析細胞在不同條件、不同時間點的丙二酰化變化。
這些優勢使蛋白質組學成為研究丙二酰化在基因表達調控、代謝調節及疾病模型中的作用的核心方法。
二、樣本準備與組蛋白富集
蛋白質組學分析的成功與樣本處理密切相關。組蛋白丙二酰化分析通常包括以下步驟:
1、樣本裂解與蛋白提取
組織或細胞通過強裂解緩沖液提取全蛋白。為避免蛋白降解及修飾丟失,通常加入蛋白酶抑制劑和HDAC抑制劑。
2、組蛋白富集
由于組蛋白在總蛋白中占比低,直接分析容易被高豐度蛋白掩蓋。常用方法包括:
- 酸提取法:利用組蛋白對酸的耐受性,去除非組蛋白。
- 免疫富集:利用特異性抗體富集丙二酰化組蛋白,提升檢測靈敏度。
三、酶解與肽段制備
組蛋白酰化修飾多發生在賴氨酸殘基,因此常用胰蛋白酶(Trypsin)進行消化,但在組蛋白丙二酰化蛋白質組學分析中需要特別注意賴氨酸的丙二酰化會阻礙胰蛋白酶切割,導致肽段過長或分布不均。為提高酶解效率,常結合賴氨酸特異性修飾保護法(如丙二酰化封閉法),確保關鍵肽段被合理切割。消化后的肽段通常通過固相萃取(SPE)進行凈化,為質譜分析做好準備。
四、質譜分析與數據采集
1、高分辨率質譜平臺
丙二酰化屬于低豐度修飾,分析要求高分辨率和高靈敏度。典型設備包括:
- Orbitrap質譜:分辨率高,適合復雜樣品中組蛋白丙二酰化位點精確鑒定。
- Q-TOF質譜:適合快速掃描和相對定量。
2、肽段分離
通過液相色譜(LC)分離肽段,提高修飾肽的檢測概率。LC-MS/MS結合可實現修飾位點的精確鑒定。
3、數據采集策略
DDA(數據依賴采集)適合發現性分析,識別未知丙二酰化位點。DIA(數據獨立采集)適合定量分析,可對多個樣品進行高通量比較。
五、數據分析與生物學解讀
質譜獲得的原始數據需通過生物信息學處理才能揭示生物學意義,主要流程包括:
1、肽段識別:通過數據庫搜索,匹配丙二酰化修飾的肽段。
2、定量分析:比較不同實驗條件下修飾肽的豐度變化。
3、功能注釋:結合GO、KEGG通路分析,解析丙二酰化在基因表達、代謝調控中的潛在作用。
4、可視化呈現:生成熱圖、蛋白網絡圖,便于科研人員快速理解數據。
六、常見問題與解決策略
1、丙二酰化肽段低豐度
解決方案:使用高靈敏質譜與抗體富集,增加檢測成功率。
2、酶切效率受阻
解決方案:采用丙二酰化封閉策略,確保關鍵肽段被有效切割。
3、數據分析復雜
解決方案:結合專業生物信息學軟件和數據庫,提供定制化分析與可視化報告。
組蛋白丙二酰化蛋白質組學分析是揭示表觀遺傳修飾與代謝調控關系的重要工具。通過樣本優化、組蛋白富集、酶解策略、高分辨質譜分析和專業數據解讀,研究者可以全面、定量地分析丙二酰化修飾位點及其動態變化。百泰派克生物科技憑借高端質譜平臺與專業科研服務,為丙二酰化研究提供全方位支持,助力科研人員在表觀遺傳學和代謝研究中獲得突破性進展。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質,提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、蛋白質組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種蛋白質標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.專業生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,最后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從最小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等專業服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,專業提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
