譜度眾合 | LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選服務(wù)
產(chǎn)品名稱: 譜度眾合 | LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選服務(wù)
英文名稱: Spec- Ally | LiP-MS Drug Target Screening Service
產(chǎn)品編號(hào): 4
產(chǎn)品價(jià)格: null
產(chǎn)品產(chǎn)地: 湖北武漢
品牌商標(biāo): null
更新時(shí)間: 2025-11-26T11:07:28
使用范圍: null
| 規(guī)格 | 價(jià)格 |
| 樣 | 1500.0 |
- 聯(lián)系人 : 劉宜子
- 地址 : 武漢市東湖新技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)高新大道666號(hào)武漢國(guó)家生物產(chǎn)業(yè)(九峰創(chuàng)新)基地B5棟B024室
- 郵編 :
- 所在區(qū)域 : 湖北省
- 電話 : 187****3965 點(diǎn)擊查看
- 傳真 : 點(diǎn)擊查看
- 郵箱 : proteome@spec-ally.com
有限蛋白水解質(zhì)譜技術(shù)(Limited Proteolysis Mass Spectrometry,LiP-MS)是研究小分子化合物(天然產(chǎn)物、代謝物等)與蛋白質(zhì)相互作用,揭示蛋白結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)變化的高通量質(zhì)譜篩選技術(shù)。本公司推出LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選解決方案,包含三種研究目的場(chǎng)景:
- LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選:體外生理?xiàng)l件下尋找小分子藥物的潛在作用靶點(diǎn);
- LiP-MS藥物-蛋白結(jié)合域分析:體外生理?xiàng)l件下研究純化重組蛋白與目標(biāo)藥物的作用域與結(jié)合位點(diǎn)。
- LiP-MS藥物機(jī)制研究:體內(nèi)給藥條件下研究小分子藥物的潛在作用靶點(diǎn)及其藥物作用機(jī)制。
技術(shù)原理
有限水解(LiP)的概念是指在生理狀態(tài)下蛋白酶對(duì)蛋白的不完全酶切。研究表明,生理狀態(tài)下折疊的蛋白具有較強(qiáng)的抗酶切能力,所以實(shí)驗(yàn)中想要實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白的完全酶切需要先對(duì)蛋白進(jìn)行變性處理(去折疊)(圖1)。而在生理狀態(tài)下,折疊蛋白的不完全酶切也需要蛋白酶識(shí)別位點(diǎn)的暴露,通常涉及到多達(dá)12以上氨基酸殘基肽段的構(gòu)象變化(局部展開(kāi)),這依賴于蛋白的動(dòng)態(tài)變化,蛋白表面肽段的柔性變化可能會(huì)形成這種能被蛋白酶識(shí)別切割的位點(diǎn)。

圖 1 蛋白有限水解示意圖
LiP-MS利用有限水解的原理來(lái)識(shí)別小分子藥物作用的蛋白靶點(diǎn)。具體來(lái)講,生理狀態(tài)下蛋白的動(dòng)態(tài)變化會(huì)暴露出表面肽段的酶切位點(diǎn),但是小分子藥物與靶蛋白結(jié)合后,會(huì)在整體或者局部水平穩(wěn)定蛋白的結(jié)構(gòu),這使得蛋白表面的肽段暴露和被蛋白酶酶切的可能性大大降低(圖2)。
在這個(gè)理論背景下,設(shè)置藥物處理組與溶劑處理的對(duì)照組,同時(shí)以非特異性的蛋白酶進(jìn)行處理,會(huì)在藥物結(jié)合的靶蛋白上形成酶切位點(diǎn)(肽段)的差異,最后通過(guò)質(zhì)譜檢測(cè)來(lái)定量篩選出組間差異的肽段(蛋白),最終可以確認(rèn)為藥物作用的結(jié)合靶點(diǎn)(圖3)。

圖 2 小分子配體(藥物)穩(wěn)定蛋白結(jié)構(gòu)

圖 3 LiP-MS流程圖
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
- 簡(jiǎn)單便捷:無(wú)需設(shè)計(jì)合成分子探針;提供野生型細(xì)胞/組織和藥物分子就可以進(jìn)行實(shí)驗(yàn);
- 真實(shí)直接:使用藥物分子在體外直接進(jìn)行結(jié)合實(shí)驗(yàn),得到直接結(jié)合靶點(diǎn)及其結(jié)合位點(diǎn);
- 數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng):利用質(zhì)譜技術(shù)的高通量性能,無(wú)偏見(jiàn)的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)篩選保障獲得真實(shí)的陽(yáng)性結(jié)果,實(shí)現(xiàn)治療靶點(diǎn)與脫靶靶點(diǎn)的全覆蓋;
- 直接結(jié)論:通過(guò)比較篩選、生信分析和數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘,報(bào)告直接給出推薦的靶點(diǎn)列表清單;
驗(yàn)證數(shù)據(jù):對(duì)潛在靶蛋白與藥物分子進(jìn)行分子對(duì)接,在計(jì)算機(jī)模擬層面給藥物靶點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證;
產(chǎn)品介紹
LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選
藥物靶點(diǎn)研究最常見(jiàn)的場(chǎng)景是有了一個(gè)有效的藥物,但是不清楚這個(gè)藥物作用的具體靶點(diǎn)和機(jī)制。這個(gè)時(shí)候可以進(jìn)行蛋白質(zhì)組水平的LiP-MS藥物靶點(diǎn)篩選。客戶提供原始的細(xì)胞或組織及藥物,譜度眾合實(shí)驗(yàn)室在非變性條件下提取疾病模型細(xì)胞/組織中的全部蛋白,分別使用藥物和溶劑進(jìn)行處理,隨后進(jìn)行有限水解實(shí)驗(yàn),通過(guò)質(zhì)譜高通量篩選兩組間差異肽段,實(shí)現(xiàn)在整體蛋白水平篩選藥物作用的蛋白靶點(diǎn)。
送樣要求:
1. 至少6個(gè)給藥前樣本(藥物處理組3個(gè),溶劑對(duì)照組3個(gè);如需增加不同濃度或者不同藥物處理組,每組增加3個(gè)樣本);
2. 單個(gè)樣本起始細(xì)胞量建議>1*10E7(組織樣本>5mg);藥物用量:摩爾分子質(zhì)量/10(μg),例如分子量1000的藥物,需要100μg的量;或者20μL*5mM的藥物溶液。
3. 收集細(xì)胞/組織樣本時(shí)需以PBS清洗干凈,樣本不含有任何去垢劑/變性劑成分。
