De novo測序也叫從頭測序，不需要任何基因序列信息即可對某個物種進行測序。用生物信息學的分析方法對測讀序列進行拼接、組裝，從而獲得該物種的基因組序列圖譜。隨著新一代測序技術的飛速發展，大大降低了基因組測序的成本和時間，為研究新物種全基因組序列提供了一個嶄新的研究平臺。

沃森生物采用Illumina第二代高通量測序平臺和PacBio第三代測序結合的方法，對未知物種的個體進行基因組測序，Illumina能產生海量的數據，可為動植物基因組組裝提供高覆蓋度的數據, PacBio第三代測序平臺能產生非常長的讀長，能跨越基因組中高重復、高雜合等復雜區域,從而能得到非常好的基因組組裝結果。從基因組水平上對物種的生長、發育、進化、起源等重大問題進行研究，將加深我們對物種的認識，在發掘重要的功能基因、培育優良新品種，加速分子育種進程及相關物種的各種研究提供可靠的基礎。

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技術路線：

數據分析：

1、? 基因組組裝

2、? 基因組注釋

·???????????? 重復序列分析與注釋；

·???????????? 基因預測；

·???????????? 基因功能注釋；

·???????????? ncRNA注釋。

3、? 動植物比較基因組學與進化分析

·???????????? 基因家族分析；

·???????????? ?物種系統發育樹構建；

·???????????? ?基因組共線性分析；

·???????????? ?全基因組復制分析。

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4、? 基因組數據庫網站的建立

●參考文獻

1、Kim S,et al.Genome?sequence?of the?hot?pepper?provides?insights?into the?evolution?of?pungency?in?Capsicum?species. Nat Genet.?2014: 10.1038

2、Wang X,et al.The?locust?genome?provides?insight?into?swarm?formation?and?long-distance?flight. Nat Commun.2014;5:2957.

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3、Venkatesh B,et al.Elephant?shark?genome?provides?unique?insights?into?gnathostome?evolution. Nature.?2014;505(7482)