VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina(鏈特異性轉錄組建庫)
產品名稱: VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina(鏈特異性轉錄組建庫)
英文名稱: VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina
產品編號: NR602-01/02
產品價格: 0
產品產地: 江蘇南京
品牌商標: Vazyme
更新時間: null
使用范圍: null
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- 郵編 : 210000
- 所在區域 : 江蘇
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保留了mRNA的鏈方向性,更加準確的獲得基因的結構以及基因表達信息
對于復雜植物模板具有很高的成功率
建庫流程與Illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit相同
優化的大片段建庫方案
測序數據與Illumina試劑具有高度的一致性


圖1. 1 μg universal human reference RNA分別用VAHTS??mRNA-seq v2 Library Prep Kit for Illumina、 VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina、 llumina TruSeq Stranded RNA Sample Preparation Kit構建文庫,用Hiseq 2500測序??梢钥吹剑溙禺愋晕膸煊谐^99%的Reads比對到正義鏈上。

圖2. 1 μg (A) 或100 ng (B) universal human reference RNA分別用VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina以及Illumina TruSeq Stranded RNA Sample Preparation Kit構建文庫,用Hiseq 2500測序,分析數據均一性分布。可以看出,本產品構建的文庫數據分布均勻,沒有5’或3’偏好性,并且和Illumina試劑盒高度一致。

圖3. 1 μg 或100 ng universal human reference RNA分別用VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina以及llumina TruSeq Stranded RNA Sample Preparation Kit構建文庫,用Hiseq 2500測序,兩兩比較表達重復相關性, 以spearman相關系數r表示。可以看出,1 μg (A)、 100 ng (B)模板量下Vazyme VAHTS??和Illumina TruSeq之間以及用Vazyme VAHTS??建庫1 μg和100 ng (C)之間的相關系數r均大于0.97,說明具有很高的表達重復相關性。

VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina適用于起始模板為0.1-1 μg總RNA的鏈特異性轉錄組文庫構建。與常規轉錄組文庫構建不同的是,在第二鏈cDNA合成時,摻入dUTP標記第二鏈;PCR前將標記的第二鏈模板用UDG酶消化,使得最終的測序信息都來自于第一鏈cDNA,從而保留了mRNA的鏈方向性。測序后的數據分析可確定轉錄本是來自正義還是反義DNA鏈。本產品的模板適應性廣泛,對于植物樣本具有很高的成功率。 本產品不僅提供與Illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Preparation Kit相同的建庫流程 (插入片段150-200 bp),還針對插入片段大于200 bp的文庫提供優化的打斷及分選條件。用本產品構建的文庫在數據產出及數據質量上均與Illumina官方試劑盒保持高度的一致性。

| ? | 組分 | NR602-01(24 rxn) | NR602-02(96 rxn) |
| NR1 | mRNA Capture Beads | 1.2 ml | 4.8 ml |
| Beads Binding Buffer | 1.2 ml | 4.8 ml | |
| Beads Wash Buffer | 9.6 ml | 38.4 ml | |
| Tris Buffer | 1.2 ml | 4.8 ml | |
| NR5 | Frag/Prime Buffer | 468 μl | 2 × 936 μl |
| Actinomycin D (5 mg/ml) | 24 μl | 96 μl | |
| 1st Strand Buffer | 144 μl | 576 μl | |
| 1st Strand Enzyme Mix | 48 μl | 192 μl | |
| 2nd Strand Marking Buffer | 480 μl | 2 × 960 μl | |
| 2nd Strand/End Repair Enzyme Mix | 120 μl | 480 μl | |
| NR6 | dA-Tailing Buffer Mix | 240 μl | 960 μl |
| dA-Tailing Enzyme Mix | 60 μl | 240 μl | |
| Ligation Mix | 60 μl | 240 μl | |
| Stop Ligation Mix | 120 μl | 480 μl | |
| PCR Primer Mix | 120 μl | 480 μl | |
| Amplification Mix 1 | 600 μl | 4 × 600 μl | |
| Heat-labile UDG | 24 μl | 96 μl |
貯藏與保質期
