VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina(鏈特異性轉錄組建庫)-文庫及構建-試劑-生物在線
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VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina(鏈特異性轉錄組建庫)

VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina(鏈特異性轉錄組建庫)

商家詢價

產品名稱: VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina(鏈特異性轉錄組建庫)

英文名稱: VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina

產品編號: NR602-01/02

產品價格: 0

產品產地: 江蘇南京

品牌商標: Vazyme

更新時間: null

使用范圍: null

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保留了mRNA的鏈方向性,更加準確的獲得基因的結構以及基因表達信息

對于復雜植物模板具有很高的成功率

建庫流程與Illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit相同

優化的大片段建庫方案

測序數據與Illumina試劑具有高度的一致性

圖1. 1 μg universal human reference RNA分別用VAHTS??mRNA-seq v2 Library Prep Kit for Illumina、 VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina、 llumina TruSeq Stranded RNA Sample Preparation Kit構建文庫,用Hiseq 2500測序??梢钥吹剑溙禺愋晕膸煊谐^99%的Reads比對到正義鏈上。

圖2. 1 μg (A) 或100 ng (B) universal human reference RNA分別用VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina以及Illumina TruSeq Stranded RNA Sample Preparation Kit構建文庫,用Hiseq 2500測序,分析數據均一性分布。可以看出,本產品構建的文庫數據分布均勻,沒有5’或3’偏好性,并且和Illumina試劑盒高度一致。

圖3. 1 μg 或100 ng universal human reference RNA分別用VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina以及llumina TruSeq Stranded RNA Sample Preparation Kit構建文庫,用Hiseq 2500測序,兩兩比較表達重復相關性, 以spearman相關系數r表示。可以看出,1 μg (A)、 100 ng (B)模板量下Vazyme VAHTS??和Illumina TruSeq之間以及用Vazyme VAHTS??建庫1 μg和100 ng (C)之間的相關系數r均大于0.97,說明具有很高的表達重復相關性。

VAHTS??Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina適用于起始模板為0.1-1 μg總RNA的鏈特異性轉錄組文庫構建。與常規轉錄組文庫構建不同的是,在第二鏈cDNA合成時,摻入dUTP標記第二鏈;PCR前將標記的第二鏈模板用UDG酶消化,使得最終的測序信息都來自于第一鏈cDNA,從而保留了mRNA的鏈方向性。測序后的數據分析可確定轉錄本是來自正義還是反義DNA鏈。本產品的模板適應性廣泛,對于植物樣本具有很高的成功率。 本產品不僅提供與Illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Preparation Kit相同的建庫流程 (插入片段150-200 bp),還針對插入片段大于200 bp的文庫提供優化的打斷及分選條件。用本產品構建的文庫在數據產出及數據質量上均與Illumina官方試劑盒保持高度的一致性。

?組分NR602-01(24 rxn)NR602-02(96 rxn)
NR1mRNA Capture Beads1.2 ml4.8 ml
Beads Binding Buffer1.2 ml4.8 ml
Beads Wash Buffer9.6 ml38.4 ml
Tris Buffer1.2 ml4.8 ml
NR5Frag/Prime Buffer468 μl2 × 936 μl
Actinomycin D (5 mg/ml)24 μl96 μl
1st Strand Buffer144 μl576 μl
1st Strand Enzyme Mix48 μl192 μl
2nd Strand Marking Buffer480 μl2 × 960 μl
2nd Strand/End Repair Enzyme Mix120 μl480 μl
NR6dA-Tailing Buffer Mix240 μl960 μl
dA-Tailing Enzyme Mix60 μl240 μl
Ligation Mix60 μl240 μl
Stop Ligation Mix120 μl480 μl
PCR Primer Mix120 μl480 μl
Amplification Mix 1600 μl4 × 600 μl
Heat-labile UDG24 μl96 μl

貯藏與保質期
Box 1: 2-8°C保存。
Box 2 :-20°C保存。
Box 3 :-20°C保存。
適用范圍
起始模板:0.1–1 μg完整度良好的總RNA。建議用Agilent ?2100 Bioanalyzer對提取的總RNA進行質控,RIN值應≥8。不完整或降解的總RNA模板會給測序結果帶來3’偏好性。
轉錄本信息:本試劑盒適合于針對mRNA的鏈特異性RNA-seq分析,包括:基因表達、單核苷酸變異 (single nucleotide variation),可變剪切/融合基因、目標轉錄組分析等。如果需要分析非編碼RNA,請選擇VAHTS?Total RNA-seq Library Prep Kit for Illumina (Vazyme NR603)。