細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定
產(chǎn)品名稱: 細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定
英文名稱: 細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定
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細(xì)菌16S?rDNA菌種鑒定
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16S?rDNA是編碼原核生物核糖體小亞基Rrna(16S?rRNA)的DNA序列,存在于所有細(xì)菌染色體基因組中。16S?rDNA分子大小適中,突變率小,是細(xì)菌系統(tǒng)分類學(xué)研究中最常用,最有用的“分子鐘”。其序列包含9個可變區(qū)(variable?region)和10個恒定區(qū)(constant?region)。保守序列區(qū)域反映了生物物種間的新緣關(guān)系,而高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。16S?rDNA的序列特征為不同分類級別的近緣種系統(tǒng)分類奠定了分子生物學(xué)基礎(chǔ)。
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近幾年來,國內(nèi)外學(xué)者采用不同的分子生物學(xué)方法對各種細(xì)菌的16S?rDNA進(jìn)行了廣泛的研究,獲得了大量的16S?rDNA序列信息,瓶集中于NCBI數(shù)據(jù)庫中。將測序得到的16S?rDNA序列在NCBI上進(jìn)行Blas比對,即可獲知與該序列同源性較高的已知序列,為確定菌種的分類學(xué)地位提供依據(jù)。
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送樣要求
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1.?若提供平板,甘油菌或穿刺菌,請注明培養(yǎng)條件,菌種培養(yǎng)需特殊培養(yǎng)基的請?zhí)峁┡囵B(yǎng)基;請確保您提供的平板或斜面上的單菌落經(jīng)過至少三次的分離純化。因?qū)嶒灅悠凡患冊斐傻臏y序套峰,我們將收取全額的實驗費(fèi)用。
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2.?若提供基因組DNA樣品,請確保基濃度≥?10ng/ul,總體積≥50ul.樣品定量檢測結(jié)果將以我們?yōu)闇?zhǔn)。
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3.?若提供的菌株為革蘭氏陽性菌,建議您提供基因組DNA。
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4.?我們不接受具有致病性的樣品。如果您的菌株帶有致病性,請?zhí)峁┚甑幕蚪MDNA,并對其進(jìn)行處理以滅活致病菌。
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實驗周期
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實驗周期為1-2周,實際完成時間視具體樣品量而定。
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提供結(jié)果
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1.?結(jié)題報告,包括實驗流程,PCR產(chǎn)物電泳圖,進(jìn)化樹結(jié)果等
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2.?測序峰圖文件
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3.?序列文件
