腫瘤結構變異 5% FFPE標準品
產品名稱： 腫瘤結構變異 5% FFPE標準品
英文名稱： Onco Structural Multiplex 5% FFPE DNA
產品編號： GW-OPSM002
產品價格： 0
產品產地： 深圳
品牌商標： GeneWell
更新時間： null
使用范圍： null
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產品介紹
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FFPE是活檢標本的一種保存和制備方式，有助于實驗研究和診斷流程/藥物開發。首先通過將組織樣品固定在甲醛（也稱為福爾馬林）中來保存，以保護組織內的蛋白質和重要結構。接下來，將其嵌入石蠟塊中，這樣可以更容易地切割所需尺寸的切片，以便安裝在顯微鏡載玻片上進行相關實驗。
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腫瘤結構變異 5% FFPE 標準品是一種高度特征化，生物學相關的FFPE質量控制材料，涵蓋多種基因變異，包含SNP和插入，缺失，拷貝數變異，基因融合等突變類型，用于評估從樣本提取到定量的全流程各步驟，有助于修正和監測您的實驗方案、操作規范及生物信息學流程等，并進行后續的一系列應用。
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詳細信息
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突變類型 |
突變位點 |
突變頻率 |
COSMIC編號 |
CDS突變 |
染色體編號 |
染色體位置 |
|
SNV High GC |
AKT1 E17K |
5% |
COSM33765 |
c.49G＞A |
14 |
104780214 |
|
SNV Low GC |
PIK3CA E545K |
5% |
COSM763 |
c.1633G＞A |
3 |
179218303 |
|
Long Insertion |
EGFR_V769_D770insASV |
5% |
COSM12376 |
c.2307_2308insGCCAGCGTG |
7 |
55181316-55181317 |
|
Long Deletion |
EGFR_ΔE746-A750 |
5% |
COSM6223 |
c.2235_2249del15 |
7 |
55174772-55174786 |
|
Fusion |
CD74-ROS1 translocation |
5% |
COSF1200 |
NA |
6,5 |
117700222,149782188 |
|
Fusion |
EML4-ALK translocation |
5% |
COSF734 |
NA |
2,2 |
42472827,29446394 |
|
CNV |
MET amplification |
3.5 copies |
NA |
NA |
7 |
116672196-116798386 |
|
CNV |
HER2 amplification |
7.0 copies |
NA |
NA |
17 |
39687914-39730426 |
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QC標準
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檢測項目 |
檢測方法 |
質量標準 |
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等位基因突變頻率 |
伯樂 QX200微滴式數字PCR |
AF＝0，可接受AF≤0.1% ；? AF＜1%，可接受誤差范圍＝±40%；? 1%≤AF≤5%，可接受誤差范圍＝±30%；? 5%＜AF≤20%，可接受誤差范圍＝±20% ； ?20%＜AF，可接受誤差范圍＝±10%；? 拷貝數變異＜5，可接受誤差范圍= ±10% ；? 5≤拷貝數變異＜10，可接受誤差范圍＝±30%；? 10≤拷貝數變異，可接受誤差范圍＝±20% |
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基因型 |
Sanger |
檢出突變 |
|
質量 |
瓊脂糖凝膠電泳 |
電泳條帶清晰明亮 |
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定量 |
Qubit? dsDNA BR assay (DNA) |
≥400 ng/片(Maxwell? 16 FFPE plus LEV DNA Purification Kit (Promega)) |
|
RNA表達（FFPE RNA） |
End-Point RT-PCR |
目標區域出現清新明亮的條帶，而陰性對照組在目標區域不出現條帶 |
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