1. 鏈酶親和素磁珠在使用磁力架時無法沉淀，如何解決？

可能樣品溶液粘度過高或者由于蛋白-蛋白相互作用，磁珠形成了聚集體。解決辦法：1.延長分離時間（將管子放在磁力架上2-5分鐘）。2.裂解物加入DNase酶（0.01mg/ml）。3.將Tween 20濃度提高至結合和/或者0.05%洗滌緩沖液。4.向結合緩沖液和或洗滌緩沖液加入20mMβ-巰基乙醇。

2. 鏈霉親和素是否會從鏈霉親和素磁珠中脫落？

鏈霉親和素分子與磁珠表面共價結合；在正常的推薦條件下，脫落可忽略不計 (37℃下，鏈霉親和素分子總量不到0.2%)。然而，應該注意的是，并非所有的四個鏈霉親和素亞單元都與磁珠是共價偶聯的。通常，一個或兩個亞單元共價偶聯。鏈霉親和素與其它蛋白類似，如果加熱會變性并解聚為亞基。如果鏈霉親和素偶聯的磁珠被煮過，一些鏈霉親和素亞基可能會從磁珠上釋放出來（以單體或者聚合物形式）。共價偶聯的鏈霉親和素亞基不受這種處理的影響。當鏈霉親和素與生物素偶聯時，鏈霉親和素—生物素復合物比單獨的鏈霉親和素更加穩定。

3. 如果鏈霉親和素磁珠被意外冷凍了是否還能使用？

仍然可以使用，為了在實驗室內測試低溫下的穩定性，將鏈霉親和素磁珠在 -20 ℃下放置 24 小時，然后將其轉移到室溫 (15-25℃) 下72 小時。 此凍融循環重復 4 次，并將磁珠在 2-8℃條件下儲存 60 個月。然后檢測了生物素結合能力，并發現其符合質量標準要求。

4. 如何優化鏈霉親和素磁珠偶聯的磁珠結合能力？

鏈霉親和素偶聯的磁珠的結合能力具有片段長度依賴性。對大分子DNA 或 RNA 片段結合能力的下降可能是由于空間位阻所致。以下是一些優化結合能力的建議。

鹽濃度會影響生物素化核酸與鏈霉親和素磁珠的結合效率。生物素化DNA片段 (長達 1 kb) 的較優結合條件是在1 M NaCl (最終濃度) ，5°C和孵育15分鐘下實現的。更長的DNA片段應固定過夜。生物素化抗體應在 pH 7.4 的PBS 緩沖液中固定，并添加 0.1% 的 BSA。

請確保樣品中沒有過量的游離生物素，因為游離生物素會比較大的生物素化分子更快地結合鏈霉親和素磁珠。生物素化寡核苷酸應通過反相 HPLC 或 FPLC 進行回收，以去除樣品中的游離生物素。

我們還建議根據每個特定應用的需要進行滴定實驗，以優化使用的磁珠數量，因為特定分子的大小和生物素化過程都會影響磁珠的結合能力。

5. 使用的鏈霉親和素磁珠出現了核酸的非特異性結合問題。我能做些什么來減少此種情況？

保持高 pH 值和低鹽濃度，這將有助于保持核酸和磁珠上的負電荷。

6. 使用鏈霉親和素磁珠得到了高背景，如何防止這種情況發生？

背景可能是由于磁珠表面與 BSA 的非特異性結合所致，或者高背景可能是由于與鏈霉親和素的非特異性結合引起的。增加 pH 值或鹽濃度可能有助于減少結合。

7. 如果鏈霉親和素磁珠聚集，應該怎么辦？

鏈霉親和素磁珠具有帶負電荷的表面，磁珠的表面電荷可能會導致一些樣品中的磁珠浮在液面上，或變得粘稠或聚集。粘性可能是由于磁珠之間或磁珠與管壁之間的靜電相互作用造成的。通常，我們建議在進行實驗之前，用諸如 Tween 20 去污劑的非離子去污劑洗滌磁珠。通常只需將 Tween 20 去污劑加入到磁珠中，最終濃度可達到0.1%，然后在不含去污劑的緩沖液中重懸并洗滌磁珠，就可以減少或消除這個問題?？赡苄枰?nbsp;Tween 20 溶液中孵育，例如在室溫下滾動孵育 5-10 分鐘。此外，我們建議使用硅化管。這種處理很可能降低磁珠的靜電電勢。

8. 在使用鏈霉親和磁珠進行mRNA分離后出現DNA污染的情況，為什么會這樣？

有以下幾種原因：1.DNA 剪切不完整。 2.雜交步驟后未完全去除樣品裂解物。

3.洗滌不充分和/或未完全去除洗滌緩沖液。 4.樣品與磁珠的比率過高。