目前多采用人抗體的部分氨基酸序列代替某些鼠源性抗體的序列，經修飾制備基因工程抗體，稱為第三代抗體。 SFv穿透力強，易于進入局部組織發揮作用。因其減少了鼠源成分，從而降低了鼠源性抗體引起的不良反應，并有助于提高療效。重組抗體的體積越來越小，或被 重新構建成多價分子，或與其它分子相融合，如放射性核素、毒素、酶、脂質體和病毒。 雙特異性抗體將識別效應細胞的抗體和識別靶細胞的抗體聯結在一起，制成雙功能性抗體，稱為雙特異性抗體。
最近，美國FDA強調：目前在臨床試驗中基因工程抗體約占生物制劑的30%。 由于目前制備的抗體均為鼠源性，臨床應用時，對人是異種抗原，重復注射可使人產生抗鼠抗體，從而減弱或失去療效，并增加了超敏反應的發生，因此，在 80 年代早期，人們開始利用基因工程制備抗體，以降低鼠源抗體的免疫原性及其功能。 基因工程抗體主要包括嵌合抗體、人源化抗體、完全人源抗體、單鏈抗體、雙特異性抗體等。重組技術的出現使篩選、人源化、抗體的生產得到革新，并取代雜交瘤 技術，從而使以抗體為基礎的藥劑設計成為可能。單鏈抗體是將 Ig 的 H 鏈和 L 鏈的 V 區基因相連，轉染大腸桿菌表達的抗體分子，又稱單鏈 FV （ single chain fragment of variable region,sFv ）。
人源性抗體是將人抗體的 CDR 代之以鼠源性單克隆抗體的 CDR ，由此形成的抗體，鼠源性只占極少，稱為人源化抗體。如由識別腫瘤抗原的抗體和識別細胞毒性免疫效應細胞（ CTL 細胞、 NK 細胞、 LAK 細胞）表面分子的抗體（ CD3 抗體或 CD16 抗體）制成的雙特異性抗體，有利于免疫效應細胞發揮抗腫瘤作用。完全人源化抗體 采用基因敲除術將小鼠 Ig 基因敲除，代之以人 Ig 基因，然后用 Ag 免疫小鼠，再經雜交瘤技術即可產生大量完全人源化抗體。它是由鼠源性抗體的 V 區基因與人抗體的 C 區基因拼接為嵌合基因，然后插入載體，轉染骨髓瘤組織表達的抗體分子。嵌合抗體（ chimeric atibody ）是最早制備成功的基因工程抗體。
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