文獻速遞 | 轉錄組在慢性炎癥研究中的應用-商家動態-資訊-生物在線

文獻速遞 | 轉錄組在慢性炎癥研究中的應用

作者:和元生物技術(上海)股份有限公司 暫無發布時間 (訪問量:24725)

轉錄調控是指通過調節基因轉錄水平來控制基因表達的過程。它是細胞內基因表達調控的重要機制之一,可以通過激活或抑制轉錄因子與DNA結合來影響基因的轉錄過程。慢性炎癥是一種持續存在的炎癥反應,與多種疾病的發生和發展密切相關。炎癥反應的調控主要涉及到多種信號通路和分子機制,其中包括轉錄調控。它能通過調節基因的轉錄水平來影響炎癥反應的發生和發展。進一步的研究其在慢性炎癥中的機制,有助于深入理解炎癥相關疾病的發病機制,并為開發新的治療策略提供理論依據。

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和元生物現推出高通量測序活動(測序平臺為Illumina)

01.?轉錄組測序(6G),600元/樣本

02.?miRNA測序(10M),1400元/樣本

03.?IncRNA測序(12G),1680元/樣本

04.?circRNA測序(12G),1680元/樣本

05.?全轉錄組測序(15G),2800元/樣本

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1 .NRF2活化可重新編程氧化代謝缺陷,以恢復慢性阻塞性肺疾病的巨噬細胞功能

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文章標題:NRF2 Activation Reprograms Defects in Oxidative Metabolism to Restore Macrophage Function in Chronic Obstructive Pulmonary Disease

發表期刊:American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine

影響因子:24.7

中科院分區:1區

發表時間:2023.4

  • 摘要

慢性阻塞性肺疾病(COPD)是以持續氣道炎癥和巨噬細胞功能紊亂為特征的疾病。巨噬細胞生物能量學改變導致抗氧化反應受損和疾病發病的程度尚不清楚。本研究對慢性阻塞性肺疾病(COPD)供者和健康供者的AMs和MDMs進行了功能、代謝和轉錄組分析。研究發現來自慢性阻塞性肺病供體的AMs和MDMs顯示出糖酵解和線粒體呼吸衍生能量儲備的嚴重耗竭,由于過度依賴糖酵解導致能量狀態降低。此外,與NADPH生成酶ME1(蘋果酸酶1)表達缺陷相關的氧化還原平衡受損,然而,選擇性激活NRF2可重置COPD轉錄組,從而增加TCA循環中間產物的生成、改善能量狀態、有利的氧化還原平衡以及巨噬細胞功能的恢復。

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2?.神經元-少突膠質細胞鉀穿梭在Ranvier的節點處可防止炎癥性脫髓鞘

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文章標題:Neuron-oligodendrocyte potassium shuttling at nodes of Ranvier protects against inflammatory demyelination

發表期刊:Journal of Clinical Investigation

影響因子:15.9

中科院分區:1區

發表時間:2023.4

  • 摘要

多發性硬化癥(MS)是一種中樞神經系統進行性炎癥性脫髓鞘疾病。越來越多的證據表明,多發性硬化癥中的脆弱神經元隨著時間的推移會表現出致命的代謝衰竭,這種現象被假設是由慢性過度興奮引起的。軸突Kv7(向外整復)和少突膠質細胞Kir4.1鉀通道在調節Ranvier結及其周圍神經元的興奮性方面起著重要作用。本實驗研究了神經元Kv7和少突膠質細胞Kir4.1通道之間的空間和功能關系,并評估了皮質和視網膜投射神經元在生理性和炎癥性脫髓鞘條件下的轉錄和功能特征。發現這兩種通道在多發性硬化癥和實驗性自身免疫性腦脊髓炎(EAE)中都出現了失調,其中Kir4.1通道長期下調,而Kv7通道亞基在炎癥性脫髓鞘過程中短暫上調。此外還觀察到,用retigabine開通Kv7通道可降低人和EAE神經元的過度興奮性,改善EAE臨床癥狀,并挽救少突膠質細胞-Kir4.1缺陷(OL-Kir4.1缺陷)小鼠的神經元病理學。研究結果表明,神經元-少突膠質細胞的代償相互作用通過Kv7和Kir4.1通道促進了恢復能力,并確定了藥理激活結節Kv7通道作為抗炎性脫髓鞘的神經保護策略。

圖片

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3 .lncRNA LUCAT1在炎癥性疾病中升高,并通過調節NR4A2的剪接和穩定性來抑制炎癥

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文章標題:The lncRNA LUCAT1 is elevated in inflammatory disease and restrains inflammation by regulating the splicing and stability of NR4A2

發表期刊:Proceedings of the national academy of sciences of the united states of America

影響因子:11.1

中科院分區:1區

發表時間:2023.1

  • 摘要

核長非編碼RNA LUCAT1是人類髓系細胞中I型干擾素和炎性細胞因子表達的負反饋調節因子。本項研究中,我們明確了LUCAT1抑制炎癥基因表達的機理基礎。通過質譜法和RNA免疫沉淀法對RNA結合蛋白進行全面鑒定,我們發現在mRNA的加工和替代剪接中起重要作用的蛋白是LUCAT1結合蛋白。這些蛋白包括異質核糖核蛋白C、M和A2B1。與之相一致的是,缺乏LUCAT1的細胞改變了特定免疫基因的剪接。特別是,在脂多糖刺激下,核受體4A2(NR4A2)基因的剪接尤其受到影響。因此,在缺乏LUCAT1的細胞中,NR4A2的表達減少并延遲。NR4A2缺陷細胞的免疫基因表達升高。這些觀察結果表明,LUCAT1被誘導控制NR4A2的剪接和穩定性,而這正是LUCAT1抗炎作用的部分原因。此外,研究還分析了大量的炎癥性腸病患者以及哮喘和慢性阻塞性肺疾病患者。在這些患者中,LUCAT 1水平升高,在這兩種疾病中,與疾病嚴重程度呈正相關。這些研究通過mRNAs轉錄后調控確定了LUCAT 1依賴免疫調節的關鍵分子機制,強調了其在炎癥性疾病調控中的作用。

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參考文獻

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