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長鏈非編碼RNA(lncRNA) 因其重要的調(diào)控功能而受到研究工作者的廣泛關(guān)注，許多研究都表明它們與疾病有千絲萬縷的關(guān)系，或通過調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄，或通過調(diào)節(jié)蛋白的功能，但它們在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎（RA）中扮演的角色依然成謎。近日，安徽醫(yī)科大學(xué)葉冬青教授團隊在《Biomolecules》發(fā)表的文章揭示 H19，GAS5，linc0597這3種lncRNA與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的發(fā)病機制相關(guān)聯(lián)。
在此文章中，研究人員設(shè)計了兩個階段的病例-對照研究方案。在第一階段，研究人員選取77例RA病人樣本和78例對照樣本來探查H19，GAS5，linc0597在外周血單個核細胞（PBMC）中的表達情況。研究結(jié)果表明，與對照樣本相比，RA病人樣本中的H19，GAS5，linc0597表達顯著降低。此外，在RA病人樣本中GAS5的表達水平與C-反應(yīng)蛋白（CRP）負相關(guān)。
在第二階段，結(jié)合e-QTL數(shù)據(jù)庫，研究人員甄選了位于這三種lncRNA的重要功能區(qū)域，例如3’ UTR、5’UTR、非同義突變和移碼突變等區(qū)域及其側(cè)翼的14個SNP位點，利用Taqman探針法對828例RA病人樣本和780例對照樣本進行基因分型分析，闡釋了這三種lncRNA的基因多態(tài)性與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎易感性的相關(guān)性。通過數(shù)據(jù)分析，研究人員鑒定出2個潛在的功能性SNP與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎易感性有關(guān)，它們分別是GAS5 rs6790 和linc0597 rs2680700。
這一研究為進一步探索lncRNA在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎發(fā)生發(fā)展過程中的確切作用提供了依據(jù)。本文第二階段的研究中使用了Fluidigm公司的EP1高通量基因分型系統(tǒng)及192.24基因分型動態(tài)芯片，每張芯片可在一次反應(yīng)中完成192個樣本，每個樣本24個SNP位點的基因分型，在獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)的同時大大縮短了實驗周期，并顯著降低了實驗的成本。
參考文獻：
1. Jun Wu 1,2, Tian-Ping Zhang 1,2, Yu-Lan Zhao 1,2,et al, Decreased H19, GAS5, and linc0597 Expression and Association Analysis of Related Gene Polymorphismsin Rheumatoid Arthritis, Biomolecules 2020, 10(1), 55