關注人類健康-中國學者研究揭示IncRNA與類風濕關節炎發病機制相關聯-技術前沿-資訊-生物在線

關注人類健康-中國學者研究揭示IncRNA與類風濕關節炎發病機制相關聯

作者:思百拓(上海)儀器科技有限公司 2020-04-08T22:50 (訪問量:7794)

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長鏈非編碼RNA(lncRNA) 因其重要的調控功能而受到研究工作者的廣泛關注,許多研究都表明它們與疾病有千絲萬縷的關系,或通過調控基因的轉錄,或通過調節蛋白的功能,但它們在類風濕關節炎(RA)中扮演的角色依然成謎。近日,安徽醫科大學葉冬青教授團隊在《Biomolecules》發表的文章揭示 H19,GAS5,linc0597這3種lncRNA與類風濕關節炎的發病機制相關聯。

在此文章中,研究人員設計了兩個階段的病例-對照研究方案。在第一階段,研究人員選取77例RA病人樣本和78例對照樣本來探查H19,GAS5,linc0597在外周血單個核細胞(PBMC)中的表達情況。研究結果表明,與對照樣本相比,RA病人樣本中的H19,GAS5,linc0597表達顯著降低。此外,在RA病人樣本中GAS5的表達水平與C-反應蛋白(CRP)負相關。

在第二階段,結合e-QTL數據庫,研究人員甄選了位于這三種lncRNA的重要功能區域,例如3’ UTR、5’UTR、非同義突變和移碼突變等區域及其側翼的14個SNP位點,利用Taqman探針法對828例RA病人樣本和780例對照樣本進行基因分型分析,闡釋了這三種lncRNA的基因多態性與類風濕關節炎易感性的相關性。通過數據分析,研究人員鑒定出2個潛在的功能性SNP與類風濕關節炎易感性有關,它們分別是GAS5 rs6790 和linc0597 rs2680700。

這一研究為進一步探索lncRNA在類風濕關節炎發生發展過程中的確切作用提供了依據。本文第二階段的研究中使用了Fluidigm公司的EP1高通量基因分型系統及192.24基因分型動態芯片,每張芯片可在一次反應中完成192個樣本,每個樣本24個SNP位點的基因分型,在獲得高質量數據的同時大大縮短了實驗周期,并顯著降低了實驗的成本。

參考文獻:
1. Jun Wu 1,2, Tian-Ping Zhang 1,2, Yu-Lan Zhao 1,2,et al, Decreased H19, GAS5, and linc0597 Expression and Association Analysis of Related Gene Polymorphismsin Rheumatoid Arthritis, Biomolecules 2020, 10(1), 55

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