1. Hallmarks of Cancer: The Next Generation
Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg
這是一篇經(jīng)典的介紹癌癥特征的文章,作者是Robert A.Weinberg,這位著名的科學(xué)家是美國(guó)科學(xué)院院士,世界著名的Whitehead研究所創(chuàng)始人之一,他曾發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)人類(lèi)癌基因Ras和第一個(gè)抑癌基因Rb,他的一系列杰出研究工作已經(jīng)成為腫瘤研究領(lǐng)域乃至整個(gè)醫(yī)學(xué)生物學(xué)領(lǐng)域的重要里程碑。
從事腫瘤學(xué)研究的學(xué)者可能都讀過(guò)他的一篇文章:The Hallmarks of Cancer,這篇綜述性文章介紹了腫瘤細(xì)胞的六大基本特征,被稱(chēng)為腫瘤學(xué)研究的經(jīng)典論文,到目前為止,這篇論文已經(jīng)被引用了上萬(wàn)次。
3月新出版的Cell雜志上,Weinberg教授又發(fā)表了一篇升級(jí)版綜述:Hallmarks of Cancer: The Next Generation,這篇同樣也是與Douglas Hanahan合作的論文長(zhǎng)達(dá)29頁(yè),簡(jiǎn)述了最近10年腫瘤學(xué)中的熱點(diǎn)和進(jìn)展,包括細(xì)胞自噬、腫瘤干細(xì)胞、腫瘤微環(huán)境等等,并且將原有的腫瘤細(xì)胞六大特征擴(kuò)增到了十個(gè),這十個(gè)特征分別是:
自給自足生長(zhǎng)信號(hào)(Self-Sufficiency in Growth Signals);抗生長(zhǎng)信號(hào)的不敏感(Insensitivity to Antigrowth Signals);抵抗細(xì)胞死亡(Resisting Cell Death);潛力無(wú)限的復(fù)制能力(Limitless Replicative Potential);持續(xù)的血管生成(Sustained Angiogenesis);組織浸潤(rùn)和轉(zhuǎn)移(Tissue Invasion and Metastasis);避免免疫摧毀(Avoiding Immune Destruction);促進(jìn)腫瘤的炎癥(Tumor Promotion Inflammation); 細(xì)胞能量異常(Deregulating Cellular Energetics);基因組不穩(wěn)定和突變(Genome Instability and Mutation)。
2. A DNA Repair Complex Functions as an Oct4/Sox2 Coactivator in Embryonic Stem Cells
Yick W. Fong, Carla Inouye, Teppei Yamaguchi, Claudia Cattoglio, Ivan Grubisic, Robert Tjian
近日來(lái)自加州大學(xué)伯克利分校的研究人員在新研究中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)Oct4/Sox2共激活因子,并證實(shí)其在維持干細(xì)胞多潛能性和基因組完整性等方面起關(guān)鍵性的作用。
領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是美國(guó)著名華裔生物化學(xué)家、加州大學(xué)伯克利分校生物化學(xué)與分子生物學(xué)系錢(qián)澤南(Robert Tjian)教授,其以研究真核生物細(xì)胞遺傳信息轉(zhuǎn)錄聞名,擔(dān)任國(guó)際頂級(jí)生物學(xué)期刊《Cell》雜志的編委,1991年當(dāng)選美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院士,2009年擔(dān)任美國(guó)霍華德?休斯醫(yī)學(xué)研究所(HIMI)主席。
在這篇文章中,研究人員利用體外重組轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)結(jié)合生化分析技術(shù)鑒別出了一個(gè)Oct4/Sox2共激活因子(SCC),并證實(shí)SCC可直接與Oct4 /Sox2相互作用從而招募至Oct4和Sox2結(jié)合的基因啟動(dòng)子區(qū)域。并證實(shí)其在維持ES細(xì)胞多潛能性和體細(xì)胞重編程中發(fā)揮關(guān)鍵性的作用。此外,通過(guò)進(jìn)一步的生化特征鑒定,研究人員還證實(shí)SCC是一種XPC-RAD23B-CETN2 (XPC) 核苷酸切除修復(fù)(nucleotide excision repair;NER)三聚體復(fù)合物。研究結(jié)果表明這個(gè)SCC/XPC具有維持干細(xì)胞多潛能性和基因組完整性雙重重要功能。
3. An Alternative Splicing Switch Regulates Embryonic Stem Cell Pluripotency and Reprogramming
Mathieu Gabut, Payman Samavarchi-Tehrani, Xinchen Wang, Valentina Slobodeniuc, Dave O'Hanlon, Hoon-Ki Sung, Manuel Alvarez, Shaheynoor Talukder, Qun Pan, Esteban O. Mazzoni et al.
加拿大多倫多大學(xué)的研究人員近日發(fā)現(xiàn)了一個(gè)控制開(kāi)關(guān),可調(diào)控干細(xì)胞的多能性。他們發(fā)現(xiàn),F(xiàn)OXP1的選擇性剪接在干細(xì)胞多能性及重編程上扮演了重要的角色。
研究人員發(fā)現(xiàn)了進(jìn)化上保守的胚胎干細(xì)胞特異的選擇性剪接事件。這一事件改變了FOXP1基因的DNA結(jié)合性質(zhì)。FOXP1的ESC特異異構(gòu)體刺激了多能性所需轉(zhuǎn)錄因子基因的表達(dá),包括OCT4、NANOG、NR5A2和GDF3,同時(shí)伴隨著ESC分化所需基因的抑制。
干細(xì)胞科學(xué)的潛在應(yīng)用包括培育細(xì)胞和組織以便檢測(cè)新藥,或者修復(fù)或更換疾病狀態(tài)下受損的組織,如心臟病、糖尿病、脊髓損傷和阿爾茨海默氏癥。對(duì)調(diào)控多能性、細(xì)胞分裂和分化等機(jī)制的更深入了解將提供疾病如何發(fā)生的知識(shí),并暗示更多靶向的治療方法。
4. Basic and Therapeutic Aspects of Angiogenesis
Michael Potente, Holger Gerhardt, Peter Carmeliet
在這篇綜述文章中,著名的比利時(shí)科學(xué)家Peter Carmeliet總結(jié)了近期關(guān)于血管形成信號(hào)機(jī)制及臨床治療方面的一些新研究發(fā)現(xiàn)。
5. Artemisinin: Discovery from the Chinese Herbal Garden
Louis H. Miller, Xinzhuan Su
蘇新專(zhuān)和Louis H. Miller以“青蒿素:源自中草藥園的發(fā)現(xiàn)”為題介紹了屠呦呦教授的相關(guān)成果。文中提到,在基礎(chǔ)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,許多重大發(fā)現(xiàn)的價(jià)值和效益并不在短期內(nèi)顯而易見(jiàn)。但也有少數(shù),它們的誕生對(duì)人類(lèi)健康的改善所起的作用和意義是立竿見(jiàn)影的。由屠呦呦和她的同事們一起研發(fā)的抗瘧藥物青蒿素就是這樣的一個(gè)例子。從上個(gè)世紀(jì)90年代末以來(lái),青蒿素作為治療瘧疾的一線(xiàn)藥物挽救了無(wú)數(shù)的生命,其中大部分是生活在全球最貧困地區(qū)的兒童。
6. Driving Opposing Behaviors with Ensembles of Piriform Neurons
Gloria B. Choi, Dan D. Stettler, Benjamin R. Kallman, Shakthi T. Bhaskar, Alexander Fleischmann, Richard Axel
7. Molecular Mechanism of Protein Folding in the Cell
James E. Rothman, Randy Schekman
與上文相同,都是Cell介紹今年拉斯克獎(jiǎng)得主的成果的文章,今年獲得拉斯克基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)科學(xué)獎(jiǎng)的是馬普生物化學(xué)研究院的Franz-Ulrich Hartl和耶魯大學(xué)分子生物學(xué)家Arthur Horwich。這兩位科學(xué)家的獲獎(jiǎng)理由是發(fā)現(xiàn)了蛋白折疊中分子伴侶的作用。在上個(gè)世紀(jì)80年代,這兩位科學(xué)家發(fā)現(xiàn),雖然線(xiàn)性氨基酸能在試管中折疊成需要的三維結(jié)構(gòu),但是在細(xì)胞中,氨基酸卻不能自身完成這個(gè)過(guò)程。他們通過(guò)研究提出伴侶蛋白的一種籠形分子結(jié)構(gòu)包圍著新生的蛋白質(zhì),并利用ATP——一種能量供應(yīng)分子——來(lái)幫助氨基酸序列在沒(méi)有粘黏其他蛋白質(zhì)的情況下正確折疊。這項(xiàng)工作與涉及到蛋白質(zhì)錯(cuò)誤折疊的包括從阿爾茨海默氏病到肌萎縮性脊髓側(cè)索硬化癥各種各樣的神經(jīng)退行性疾病有關(guān)。
8. Acetylation of Yeast AMPK Controls Intrinsic Aging Independently of Caloric Restriction
Jin-Ying Lu, Yu-Yi Lin, Jin-Chuan Sheu, June-Tai Wu, Fang-Jen Lee, Yue Chen, Min-I Lin, Fu-Tien Chiang, Tong-Yuan Tai, Shelley L. Berger et al.
來(lái)自臺(tái)灣大學(xué)公關(guān)衛(wèi)生學(xué)院,約翰霍普金斯醫(yī)學(xué)院,芝加哥大學(xué)等處的研究人員發(fā)現(xiàn)一種關(guān)鍵激酶的乙酰化能調(diào)控細(xì)胞衰老,并指出這種調(diào)控與營(yíng)養(yǎng)攝入無(wú)關(guān),這對(duì)于進(jìn)一步分析衰老的機(jī)制具有重要的意義。
組蛋白與非組蛋白的乙酰化是一種重要的翻譯后修飾,影響了許多細(xì)胞進(jìn)程。這種可逆的動(dòng)態(tài)過(guò)程,能通過(guò)多種組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶(HATs)和去乙酰基酶(HDAcs)的共同作用,使染色質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生動(dòng)態(tài)改變,對(duì)基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生相應(yīng)的影響。
在這篇文章中,研究人員發(fā)現(xiàn)腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK,AMP-activated protein kinase)中一個(gè)亞基:Sip2能通過(guò)NuA4乙酰化,并隨著細(xì)胞衰老,其乙酰化程度降低,從而提出Sip2乙酰化具有抗衰老的作用。
Sip2是Snf1復(fù)合物(AMPK)中的一種調(diào)控性β亞基,這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)乙酰轉(zhuǎn)移酶,和Rpd3去乙酰化酶能調(diào)控Sip2的乙酰化,并且Sip2乙酰化后,能與Snf1更加緊密的結(jié)合,增強(qiáng)Snf1復(fù)合物的催化活性,Sip2-Snf1的相互作用會(huì)抑制Snf1的活性,因而會(huì)降低下游靶標(biāo):Sch9的磷酸化程度,并最終減緩生長(zhǎng)的速度,延長(zhǎng)生命周期。
研究人員還通過(guò)進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn),證明Sip2的抗衰老作用與營(yíng)養(yǎng)攝入和TORC1活性無(wú)關(guān),從這些研究數(shù)據(jù),研究人員提出了一種調(diào)控Sch9活性的蛋白乙酰化-磷酸化級(jí)聯(lián)效應(yīng),這種效應(yīng)能調(diào)控酵母內(nèi)源性衰老,延長(zhǎng)生命周期,這對(duì)于進(jìn)一步分析衰老的機(jī)制具有重要的意義。
9. Clan Genomics and the Complex Architecture of Human Disease
James R. Lupski, John W. Belmont, Eric Boerwinkle, Richard A. Gibbs
9月30日Cell雜志上,來(lái)自美國(guó)貝勒醫(yī)學(xué)院,德州兒童醫(yī)院,華盛頓大學(xué)等多處的幾位著名科學(xué)家發(fā)表了多篇有關(guān)人類(lèi)遺傳學(xué)(Human Genetics)的文章,探討這一領(lǐng)域的研究進(jìn)展和未來(lái)發(fā)展。
貝勒醫(yī)學(xué)院人類(lèi)基因組測(cè)序中心主任Richard Gibbs博士,分子與人類(lèi)遺傳學(xué)副主任James Lupski博士等人發(fā)表了題為“Clan Genomics and the Complex Architecture of Human Disease”的文章,分析了族群基因組與人類(lèi)疾病復(fù)雜構(gòu)架之間的關(guān)聯(lián),認(rèn)為由全基因組測(cè)序,千人基因組計(jì)劃,以及靶向基因組測(cè)序獲得的大量數(shù)據(jù)揭示了豐富的罕見(jiàn),個(gè)體突變,這可能說(shuō)明了近期的突變,比遠(yuǎn)古出現(xiàn)的突變對(duì)于疾病易感性和保護(hù)性,具有更大的影響。
10. DNA Demethylation Dynamics
Nidhi Bhutani, David M. Burns, Helen M. Blau
由Helen M. Blau與其他幾位研究人員發(fā)表的這篇綜述性文章,概括總結(jié)了DNA去甲基化動(dòng)力學(xué)研究方面的最新進(jìn)展。
來(lái)源:生物通
