重組腺相關病毒( Recombinant adeno-associated virus, rAAV)是一種無包膜、以單鏈DNA為遺傳物質、基因組容量4.7kb的復制缺陷型微小病毒。rAAV具有多種血清型可親嗜不同靶器官,免疫原性極低安全性高,2-3周可達到表達高峰且長時間穩定表達等特點,因此,rAAV廣泛應用于動物研究、基礎研究和基因治療領域。

自互補AAV(Self-complementary AAV, scAAV)在rAAV的基礎上將其編碼區域設計成雙鏈DNA,因此scAAV感染細胞后互補部分互補形成雙鏈DNA,然后進行轉錄、翻譯,不需等待第二鏈DNA合成,取消了rAAV基因表達的限速步驟,縮短了開始表達的時間,scAAV感染后一般3-5天即可到達表達高峰。但也正是scAAV的雙鏈DNA結構,致使其容量縮小至2.1kb,因此外源目的基因大小需要控制在1kb左右。

圖1 ssAAV與scAAV肝臟表達(1E+11 VG/只,尾靜脈注射)
自互補AAV應用領域
1. 干擾靶點篩選
短發夾RNA(Short hairpin RNA, shRNA)克隆進病毒載體感染細胞后,在細胞中表達小干擾RNA(Small interfering RNA, siRNA),抑制mRNA轉錄,實現抑制目的基因表達目的。對于未知的干擾靶基因的篩選一般采取體外實驗的方式進行驗證,在細胞系上進行驗證時常會遇到體外有效果體內無效果的情況;或在原代細胞上驗證,原代細胞分離難度大、培養難度高也同樣制約了shRNA的靶基因效果驗證;常規體內篩選靶點的方式又大大的影響了研究的速度。然而,scAAV-shRNA篩選干擾靶點可以快速并且準確地獲得干擾結果,極大的加快了研究的效率。

圖2 scAAV2/8-WT1 shRNA抑制Wt1基因在腎臟表達
(Chen T L, et al., The Scientific World Journal, 2014)
2. 基因編輯
CRISPR/Cas9技術通過對基因水平操作實現基因敲除或基因定點編輯。利用病毒載體表達向導RNA(guide RNA, gRNA),配合Cas9小鼠/病毒,可以對小鼠的目的基因進行編輯。

圖3 肌肉注射AAV9基因編輯元件傳遞到D52 DMD小鼠改善營養不良蛋白表達
(Min Y L, et al., Molecular Therapy, 2020)
3. 基因敲降
Cre-LoxP重組酶體系因其特異性質,廣泛應用在基因敲除(Knock out,KO)或敲入(Knock in,KI)研究中,目前常用轉基因小鼠來實現。轉基因小鼠由于構建周期長,價格高,繁育時間久,部分基因敲除或過表達胚胎致死等原因制約了研究的順利進行,然而,病毒載體可以克服以上研究中出現的問題。scAAV-cre配合Flox小鼠使用,可在成年或幼年小鼠上實現快速基因敲降(Knock down, KD)。

圖4 scAAV-Cre在Rosa26報告小鼠肝臟中表達
(Chen S, et al., Angiogenesis, 2010)
4. 特異性標記
另外,利用Cre小鼠或scAAV-Cre配合scAAV-DIO實現更加精細、快速的細胞標記。

圖5 scAAV-FLEx-mRuby2熒光蛋白在HVC(X)細胞群中限制性表達
(Sánchez-Valpuesta M, et al.,PNAS, 2019)
5. 過表達
利用scAAV過表達目的基因可以實現改目的基因在體內快速表達的目的,但是值得注意的是,由于scAAV容量有限,為了保證出毒及感染效率,目的基因盡量選擇1kb以內。

圖6 scAAV9-GFP感染皮層,三天結果
小結
scAAV具有多種血清型、快速表達、穩定表達、免疫原性相對較低的特點,因此適用于多種應用場景。
