【Gastroenterology】(IF=33.88)質譜流式助力肝轉移瘤的多組學景觀-技術前沿-資訊-生物在線

【Gastroenterology】(IF=33.88)質譜流式助力肝轉移瘤的多組學景觀

作者：思百拓（上海）儀器科技有限公司 2023-01-06T12:42 (訪問量:12483)


近日，第二軍醫大學國家肝癌科學中心陳磊研究員、王紅陽院士課題組，龍華醫院劉維薇教授課題組和復旦大學附屬腫瘤醫院王鵬教授課題組在Gastroenterology雜志（IF=33.88）合作發表了名為《Integrated Multi-omics Landscape of Liver Metastases》的文章。文章應用Standard BioTools 質譜流式技術，轉錄組和全外顯子測序等技術研究了原發性肝癌和肝轉移癌患者的免疫細胞圖譜以及免疫細胞亞型的潛在機制。
腫瘤微環境（TME）在原發性肝癌（PLC）和肝轉移（LM）的形成和發展中起著重要作用。確定TME的特征并將其作為靶點，可能對各種轉移性腫瘤有益。然而，各種LM中TME的異質表型和可能的貢獻仍未得到證實。因此作者試圖研究了LMs內TME的多樣化組成及其對LM進展和臨床結果的潛在意義。
作者設計了32個marker的表型panel，用質譜流式技術檢測了100例肝轉移（LM）和50例原發性肝癌（PLC）患者的隊列樣本。由于樣本數目眾多，作者采用了在質譜流式上廣泛使用的Pd（鈀元素） Barcoding技術，有效地減少了批次染色操作對實驗結果的影響。作者重點研究了T細胞亞群，通過評估經典的表面標志物（HLA-DR：T細胞激活標志物，PD-1：T細胞抑制標志物）確定了八個功能不同的亞群（圖A）。并且得到五種由不同的T細胞組成的免疫微環境(IM)亞型（IM1至IM5）。結合病人的生存分析發現，五種IM亞型（IM1至IM5）與不同類型腫瘤的不同免疫特征和臨床結果有關, 具有終末衰竭（IM1）或稀有T細胞炎癥（IM2和IM3）免疫特征的患者預后較差。在質譜流式的結果的基礎上，作者也進一步結合轉錄組等其他技術探索了其機制，發現了關鍵分子SLC2A1，其通過增加肝轉移病灶中Spp1+巨噬細胞的比例及其對T細胞的抑制作用，促進免疫抑制和沙漠化。此外，SLC2A1通過誘導原發性結直腸癌中的調節性T細胞（Tregs和LAG3+CD4+T cells）來促進其免疫逃避和肝轉移。

圖A：根據HLA-DR和PD-1表達得到的8個功能不同的經典T細胞亞群。
圖B：T細胞功能相關指標的表達水平。
圖C：所有病人樣本中T細胞亞群的表達頻率熱圖。

總之，作者全面描述了LMs免疫、基因組和轉錄組特征的研究，提供了肝臟轉移的綜合多組學景觀，揭示了惡性腫瘤亞型的潛在機制，增加了對多種類型LMs的腫瘤微環境的全面了解。

參考文獻：

[1] Yang, Shuai & Qian, Ling & Li, Zhixuan & Li, Ye & Bai, Jian & Zheng, Bo & Kun, Chen & Qiu, Xinyao & Cai, Guoxiang & Wang, Shan & Huang, Haiyan & Jianmin, Wu & Zhu, Yanjing & Zhangyang, Qianwen & Feng, Lanyun & Wu, Tong & Wu, Rui & Yang, Airong & Wang, Kaiting & Chen, Lei. (2022). Integrated multi-omics Landscape of liver metastases. Gastroenterology. 10.1053/j.gastro.2022.11.029.


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