【Gastroenterology】(IF=33.88)質(zhì)譜流式助力肝轉(zhuǎn)移瘤的多組學景觀-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

【Gastroenterology】(IF=33.88)質(zhì)譜流式助力肝轉(zhuǎn)移瘤的多組學景觀

作者：思百拓（上海）儀器科技有限公司 2023-01-06T12:42 (訪問量:13555)

近日，第二軍醫(yī)大學國家肝癌科學中心陳磊研究員、王紅陽院士課題組，龍華醫(yī)院劉維薇教授課題組和復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院王鵬教授課題組在Gastroenterology雜志（IF=33.88）合作發(fā)表了名為《Integrated Multi-omics Landscape of Liver Metastases》的文章。文章應用Standard BioTools 質(zhì)譜流式技術(shù)，轉(zhuǎn)錄組和全外顯子測序等技術(shù)研究了原發(fā)性肝癌和肝轉(zhuǎn)移癌患者的免疫細胞圖譜以及免疫細胞亞型的潛在機制。

腫瘤微環(huán)境（TME）在原發(fā)性肝癌（PLC）和肝轉(zhuǎn)移（LM）的形成和發(fā)展中起著重要作用。確定TME的特征并將其作為靶點，可能對各種轉(zhuǎn)移性腫瘤有益。然而，各種LM中TME的異質(zhì)表型和可能的貢獻仍未得到證實。因此作者試圖研究了LMs內(nèi)TME的多樣化組成及其對LM進展和臨床結(jié)果的潛在意義。

作者設計了32個marker的表型panel，用質(zhì)譜流式技術(shù)檢測了100例肝轉(zhuǎn)移（LM）和50例原發(fā)性肝癌（PLC）患者的隊列樣本。由于樣本數(shù)目眾多，作者采用了在質(zhì)譜流式上廣泛使用的Pd（鈀元素） Barcoding技術(shù)，有效地減少了批次染色操作對實驗結(jié)果的影響。作者重點研究了T細胞亞群，通過評估經(jīng)典的表面標志物（HLA-DR：T細胞激活標志物，PD-1：T細胞抑制標志物）確定了八個功能不同的亞群（圖A）。并且得到五種由不同的T細胞組成的免疫微環(huán)境(IM)亞型（IM1至IM5）。結(jié)合病人的生存分析發(fā)現(xiàn)，五種IM亞型（IM1至IM5）與不同類型腫瘤的不同免疫特征和臨床結(jié)果有關, 具有終末衰竭（IM1）或稀有T細胞炎癥（IM2和IM3）免疫特征的患者預后較差。在質(zhì)譜流式的結(jié)果的基礎上，作者也進一步結(jié)合轉(zhuǎn)錄組等其他技術(shù)探索了其機制，發(fā)現(xiàn)了關鍵分子SLC2A1，其通過增加肝轉(zhuǎn)移病灶中Spp1+巨噬細胞的比例及其對T細胞的抑制作用，促進免疫抑制和沙漠化。此外，SLC2A1通過誘導原發(fā)性結(jié)直腸癌中的調(diào)節(jié)性T細胞（Tregs和LAG3+CD4+T cells）來促進其免疫逃避和肝轉(zhuǎn)移。

圖A：根據(jù)HLA-DR和PD-1表達得到的8個功能不同的經(jīng)典T細胞亞群。

圖B：T細胞功能相關指標的表達水平。

圖C：所有病人樣本中T細胞亞群的表達頻率熱圖。

總之，作者全面描述了LMs免疫、基因組和轉(zhuǎn)錄組特征的研究，提供了肝臟轉(zhuǎn)移的綜合多組學景觀，揭示了惡性腫瘤亞型的潛在機制，增加了對多種類型LMs的腫瘤微環(huán)境的全面了解。

參考文獻：

[1] Yang, Shuai & Qian, Ling & Li, Zhixuan & Li, Ye & Bai, Jian & Zheng, Bo & Kun, Chen & Qiu, Xinyao & Cai, Guoxiang & Wang, Shan & Huang, Haiyan & Jianmin, Wu & Zhu, Yanjing & Zhangyang, Qianwen & Feng, Lanyun & Wu, Tong & Wu, Rui & Yang, Airong & Wang, Kaiting & Chen, Lei. (2022). Integrated multi-omics Landscape of liver metastases. Gastroenterology. 10.1053/j.gastro.2022.11.029.

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