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中科新生命首批購入timsTOF Pro 2,推動蛋白質(zhì)組學(xué)創(chuàng)新高

作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2021-10-29T18:25 (訪問量:2834)

為了更好地滿足客戶的需求,提高檢測準(zhǔn)確度和精準(zhǔn)度,近日中科新生命在已有timsTOF Pro質(zhì)譜的基礎(chǔ)上,率先引進(jìn)timsTOF Pro 2,成為國內(nèi)首家購入該儀器的科研服務(wù)企業(yè)。

相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了最新一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡最大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精準(zhǔn),也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,在短梯度下實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋。

特色一、助力4D-DIA臨床大隊(duì)列蛋白質(zhì)組,挖掘復(fù)雜樣本更多信息

大隊(duì)列臨床樣本如最常見臨床血液樣本,往往存在高低豐度蛋白。4D-DIA蛋白質(zhì)組在基于數(shù)據(jù)非依賴采集(DIA)的全息掃描模式分析同時,搭載基于雙TIMS技術(shù)的 PASEF(平行累積連續(xù)碎裂)技術(shù),打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸,由 PASEF驅(qū)動的 timsTOF Pro 2可以實(shí)現(xiàn)超過100 Hz的掃描速度,而不會損失靈敏度和分辨率,進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)對低豐度肽段離子多次重復(fù)選擇并碎裂,以提高低豐度肽的二級譜圖質(zhì)量,從而實(shí)現(xiàn)了更高置信度的肽譜匹配(PSM)。在保證高通量分析基礎(chǔ)上,為臨床大隊(duì)列樣本的高低豐度蛋白檢測靈敏度和可信度帶來更進(jìn)一步提升。

特色二、助力4D-修飾蛋白質(zhì)組學(xué),實(shí)現(xiàn)更微量更深度檢測性能升級

dia-PASEF在timsTOF Pro 2的性能改進(jìn)(高靈敏度、掃描速度、重現(xiàn)性)為4D-修飾蛋白質(zhì)組學(xué)更微量更深度帶來無限可能。磷酸化、泛素化、乙酰化等翻譯后修飾,廣泛參與至腫瘤、藥物、代謝、免疫等過程中,但極低修飾肽段豐度對起始樣本量提出更高要求。在最新升級的timsTOF Pro 2官方測試中,通過檢測小鼠腦樣本的磷酸化蛋白質(zhì)組,在起始總蛋白量僅為25 μg的磷酸化蛋白質(zhì)組的非標(biāo)記定量分析中,三次重復(fù)鑒定出多達(dá) 4473 個磷酸化肽段;在150ug的蛋白質(zhì)中鑒定27768條特異性磷酸化肽段,同時基于TIMS和PASEF組合,成功分離了457種共洗脫的磷酸化異構(gòu)體,精確區(qū)分了相近修飾位點(diǎn)定位的同分異構(gòu)修飾肽段。這些結(jié)果為更微量樣本的修飾分析帶來可能,為進(jìn)一步擴(kuò)充疾病信號通路、修飾信息提供補(bǔ)充。


中科新生命引進(jìn)最新的儀器設(shè)備timsTOF Pro2,將為我們的合作伙伴提供更加精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)結(jié)果和更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù),助推多組學(xué)研究邁向新高度。

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