項目文章Plant J(IF 7)| 杭州師范大學王慧中團隊通過空間代謝+單細胞測序等揭示紅豆杉幼莖細胞特異的紫杉烷合成調控模式-技術前沿-資訊-生物在線

項目文章Plant J(IF 7)| 杭州師范大學王慧中團隊通過空間代謝+單細胞測序等揭示紅豆杉幼莖細胞特異的紫杉烷合成調控模式

作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2023-06-25T09:42 (訪問量:33042)


英文標題Integrated mass spectrometry imaging and single-cell tranome atlas strategies provide novel insights into taxoid biosynthesis and transport in Taxus maireistems

中文標題通過空間代謝+單細胞測序等揭示紅豆杉幼莖細胞特異的紫杉烷合成調控模式

發表期刊The Plant Journal(IF=7,2023)

單位:杭州師范大學浙江省藥用植物種質改良與質量控制技術重點實驗室王慧中團隊

研究結論:

1. 深度空間代謝組繪制紅豆杉幼莖中紫杉烷類化合物空間分布

利用最新的質譜成像技術,繪制了紫杉烷類化合物在紅豆杉幼莖中的可視化分布圖。諸如:10-脫乙酰基紫杉醇(10-deacetyl paclitaxel)均勻分布于整莖中,10-脫乙?;涂ǘ?10-DAB)和巴卡丁(BAC)主要積累于內皮層和韌皮部中,而紫杉醇(taxol)特異積累于外皮層中。研究結果驗證了紫杉烷類化合物具有組織異性積累。



2. 單細胞測序揭示紅豆杉莖組織高度細胞異質性

通過制備紅豆杉幼莖原生質體并采??通量單細胞測序,繪制了紅豆杉幼莖單細胞表達圖譜,為揭示紫杉烷類化合物細胞群差異積累的調控機制打下了基礎。該研究指出,T14OH、T5OH和TS基因主要在內皮層細胞群中表達,T10OH和DBTNBT基因主要在木質部薄壁細胞群中表達,DBAT基因在外皮層細胞群中表達?;趩渭毎磉_譜,篩選得到了包括MYB,TEM,RAV,NAC家族成員在內的大量細胞群特異表達轉錄因?,并預測了它們的下游靶基因。



3. 多組學整合分析揭示紅豆杉莖組織紫杉醇合成分子機制

本研究以空間水平、單細胞水平的分辨率建立了紅豆杉幼莖中代謝物、及細胞類型的表達圖譜,為進?步研究細胞特異的紫杉烷合成調控機制提供了基礎。




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