來源：APT客戶發表

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經典蛋白質組學技術與常規蛋白質組學生物信息分析的完美碰撞

——比較分析苜蓿銀紋夜蛾核型多角體病毒（AcMNPV）感染不同時期草地夜蛾細胞（Sf9）的蛋白質組

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文獻：Comparative proteomics analysis of Spodoptera frugiperda cells during Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus infection. Virol J. 2015; 12: 115.

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文章摘要

桿狀病毒（Baculovirus）是一類節肢動物特異的病毒，在農林領域常被用作微生物殺蟲劑，其中研究最多且應用最廣泛的是苜蓿銀紋夜蛾核型多角病毒（AcMNPV）。AcMNPV能夠感染一小部分鱗翅目昆蟲，并且易于在草地夜蛾細胞系（Sf9）中繁殖。目前，AcMNPV基因組測序已經完成，但對于病毒感染過程中的宿主應答研究較少。

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本研究利用蛋白質組學iTRAQ技術，比較AcMNPV感染不同時期（mock，6hpi和12hpi）Sf9細胞的蛋白質表達差異。研究一共鑒定到4009個蛋白質，其中413個是差異表達的蛋白質；利用生物信息學分析，對差異蛋白質進行了GO功能注釋、KEGG信號通路注釋以及蛋白質互作網絡分析。該研究揭示了Sf9細胞在病毒感染不同時期的蛋白質表達變化，有助于病毒感染后宿主細胞應答以及病毒-宿主相互作用的機理研究，為優化桿狀病毒的應用奠定了基礎。

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結果展示

1) GO功能注釋

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Fig. 1 GO terms distribution. GO terms distribution in the molecular functions (a), cellular component (b), and biological process (c). In (a), binding and catalytic activity were the most represented biological processes. In (b), the most represented categories were cell, followed by organelle. In (c), the most represented categories were metabolic process and cellular process.

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2) KEGG信號通路注釋

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3) PPI蛋白質互作網絡分析

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Fig.6 Protein-protein interaction networks. Network illustration of interactions among proteins from three groups of SF9 cells. Yellow spots: significantly differentially expressed proteins. Green spots: proteins that did not expressed differentially.

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