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如何選擇合適的DNA聚合酶?
聚合酶鏈式反應(PCR)是分子生物學研究的核心技術,每位生物科研工作者對其都不陌生。PCR技術的核心成份是DNA聚合酶,它是PCR反應成敗的一個關鍵因素。目前市場上的DNA聚合酶種類繁多,常見的有:Taq,Canace,Pfu,KOD,Phusion,Primerstar,Tth等,面對眾多選擇,對于不了解各種DNA聚合酶特性的科研菜鳥來說,都不知該如何下手。

在選擇之前,先了解一下DNA聚合酶的四個重要特點:熱穩定性,保真度,擴增速度及特異性。
l?? 熱穩定性
熱穩定性是指DNA聚合酶能夠耐受高溫的能力。不同的DNA聚合酶的熱穩定性差異較大,一般通過半衰期來體現。
l?? 保真度
保真度是指DNA聚合酶精確復制DNA模板的能力。部分DNA聚合酶具有3’-5’的核酸外切酶活性,能夠校正錯誤堿基。保真度的高低可通過錯配率來體現。
l?? 擴增速度
擴增速度是指在延伸時,DNA聚合酶向DNA新鏈中摻入核苷酸的速率。擴增速度除與DNA聚合酶有關,還會受到延伸溫度,緩沖液及模板復雜程度等的影響。
l?? 特異性
特異性是指DNA聚合酶在PCR過程中只擴增目的片段的能力。為了提高PCR特異性,常通過抗體法或配體法等方式對DNA聚合酶進行修飾,使酶活性在低溫條件下封閉,減少非特異性延伸和擴增。
接下來,小編介紹幾種常用的DNA聚合酶及其應用,您可根據實驗目的不同,選擇合適的DNA聚合酶。
1)Taq DNA聚合酶(應用:常規PCR。)
Taq DNA聚合酶來源于Thermus aquaticus,熱穩定性高,在PCR循環高溫條件下仍可保持較高的酶活。Taq DNA聚合酶具有良好的行進性,擴增效率高,擴增速度為30-60 sec/kb。但該酶無3’→5’核酸外切酶活性,即無校正功能,易產生錯配堿基。使用該酶擴增得到的PCR產物3’末端帶A,可直接用于TA克隆。
2)高保真DNA聚合酶(應用:高保真PCR,如基因克隆、點突變、測序及SNP分析等。)

高保真DNA聚合酶是一類具有3’→5’核酸外切酶活性的酶,具有校正功能,擴增產物為平末端。當實驗對保真度要求較高時,需選擇此類酶。常見的高保真酶有Pfu、KOD、Phusion、Canace等。不同的高保真酶在保真度,擴增速度,擴增效率等方面有所差異。一代的高保真酶的保真度較低,擴增速度較慢,如Pfu,KOD等。
翊圣生物推出了Canace高保真DNA聚合酶。該酶是基于Pfu DNA聚合酶改造而成的新一代高保真DNA聚合酶。該酶的保真性,擴增速度,擴增長度等都有了很大提升。其保真性是Taq酶的52倍,Pfu酶的6倍,延伸速度可達15 sec/kb,可擴增20 kb的長片段,非常適合高保真PCR。Canace酶具有極高的性價比和廣泛的模板適應性,已經成為市場上熱門的新產品。
3)熱啟動DNA聚合酶(應用:低拷貝基因擴增。)
熱啟動DNA聚合酶是一類提高PCR產物特異性的酶。該類酶是通過抗體法或配體法等方式對DNA聚合酶進行修飾而成,使得DNA聚合酶活性在預變性溫度下才被激活。
翊圣生物根據對DNA聚合酶修飾方式的不同,將熱啟動酶分為兩類:一類是配體法修飾的熱啟動酶,如HieffTM Hot Start DNA Polymerase,預變性95℃,2-3 min釋放酶活;另一類是抗體法修飾的熱啟動酶,如UNICON? Hot Start Taq DNA Polymerase,50℃,30 min條件下仍然可以完全封閉活性。預變性95℃,30 sec即可釋放酶活。使用該類酶擴增得到的PCR產物3’末端帶A,可直接用于TA克隆。
4)Taq Plus DNA聚合酶(?應用:快速、常規PCR。)
Taq?Plus DNA聚合酶是由Taq?DNA聚合酶和具有3’→5’核酸外切酶活性的高保真DNA聚合酶按比例混合而成,具有擴增效率高和錯配率低的優良性能,其擴增速度為30 sec/kb,錯配率是Taq DNA聚合酶的1/6。使用該酶擴增得到的PCR產物3’末端帶A,可直接用于TA克隆。
5)Long Taq DNA聚合酶(應用:長片段PCR。)
Long Taq DNA聚合酶也是Taq?酶與高保真酶按比例混合而成的酶,配上優化的緩沖體系可使得該酶可擴增長達8?kb的人基因組DNA片段和10?kb的質粒模板。其PCR產物3’末端帶A,可直接用于TA克隆。
6)直接擴增DNA聚合酶(應用:轉基因型鑒定,基因分型)
直接擴增DNA聚合酶是指可以直接以樣本裂解產物或未純化的基因組DNA為模板進行擴增的酶。該類酶具有很強的PCR反應抑制物耐受性。
翊圣生物針對不同樣本,通過對Taq DNA聚合酶改造,并配上優化的緩沖體系,開發出四款直接擴增DNA聚合酶。分別是用于動物組織的Animal Tissue Direct PCR Kit,特別針對小鼠組織的Mouse Tissue Direct PCR Kit,用于全血的Animal Blood Direct PCR Kit以及植物組織的Plant Tissue PCR Kit。這四款產品均可直接對樣本裂解液擴增,操作方便,減少了樣本用量、實驗成本和時間等。
產品選擇指南
|
酶名稱 |
合成長度 |
延伸速度 |
保真度 |
熱啟動 |
擴增產物 |
應用 |
|
HieffTM Taq DNA Polymerase |
5 kb |
60 sec/kb |
1× |
- |
粘端 |
常規PCR |
|
HieffTM Taq Plus DNA Polymerase |
5 kb |
30 sec/kb |
6× |
- |
粘端 |
快速、常規PCR |
|
HieffTM Long Taq DNA Polymerase |
10 kb |
30 sec/kb |
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