GO功能富集差異
KEGG通路富集差異
KEGG通路富集的分析可以幫助科研用戶進一步了解差異蛋白質/磷酸化蛋白質富集在哪些通路上，以便找到最受影響的通路。分析結果呈現方式與GO功能富集方式類似，因此此處不另外展示。
Venn分析
針對兩組學篩選到的差異蛋白進行Venn分析，直觀地展示兩組學同時定量到的差異蛋白數量以及各組學特異性定量到的差異蛋白數量，并對Venn結果進行GO/KEGG通路富集分析。分析結果呈現方式與前述Venn分析、GO/KEGG富集方式類似，因此此處不另外展示。
（3）去本底聯合結果展示：新增4項
引起磷酸化修飾水平變化的原因主要有兩種：1)蛋白質表達量發生改變；2）磷酸化反應調節機制的作用(如上游激酶活性發生改變）?？紤]到激酶/磷酸酶介導的磷酸化調節機制受到廣大研究者關注，且在高水平的Cell期刊上一項關于人類結腸癌的蛋白基因組分析中，研究人員最終選擇的是癌癥相關的磷酸位點時，不僅考慮了磷酸化差異倍數，還考慮了蛋白表達本底。因此，此版聯合分析我們保留了去本底聯合分析內容。
除此之外，我們也考慮到高水平聯合文獻中還通常涉及激酶靶點的篩選。因此，新版聯合分析報告在保留了激酶-底物相互作用網絡分析的基礎上，新增了以激酶為核心的4項內容：
激酶-底物關系表
在保留原表中差異磷酸化位置、變化倍數、上游激酶預測結果等信息的基礎上，增加了預測激酶在蛋白質組學和磷酸化蛋白質組學中的表達變化情況（FC、P值）。
激酶-底物數量統計
激酶-底物和弦圖
激酶活性預測分析
三大高級服務
從癌癥到炎癥性疾病、糖尿病、傳染病、心血管疾病等多種疾病的發生均與蛋白質磷酸化的異常存在關聯性。這也意味著蛋白激酶/磷酸酶可以成為多種疾病的藥物靶點。隨著MAPK、JAK 及PI3K等信號通路研究的發展，激酶作用機制以及對激酶抑制劑的研究也逐漸成為了新藥研究的熱點，尤其是在癌癥治療中是最有吸引力的治療靶點之一。
為了助力廣大科研工作者對激酶結構特征、作用機制和對激酶抑制劑做進一步研究，我們將提供三大高級服務（收費內容）：
（1）人激酶樹注釋
（2）激酶抑制劑/藥物注釋
基于目前生命科學研究領域最可靠、最全面的功能研究數據庫—Ingenuity Pathway Analysis（IPA數據庫）注釋靶向激酶的抑制劑&藥物注釋服務。
（3）吉凱激酶病毒產品
吉凱基因擁有20年專業病毒生產經驗，已提供過200多種定制的激酶病毒產品，可滿足研究者對激酶敲減、過表達等操作的研究需求。
以上為本次新版聯合分析報告的最主要的升級看點和內容。我們衷心的希望2022版聯合報告能夠助力科研用戶輕松走完“科研的最后一公里“。自2022年4月25日起，尚未進入生信分析的老合同（項目進展可查看吉凱推送的項目進展郵件）和新簽的蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合項目，即可享受全新升級分析，加量不加價！歡迎訂購吉凱基因蛋白質組+磷酸化蛋白質組產品及聯合分析，以及推薦給身邊正需要的朋友！
吉凱基因憑借多年在靶標篩選及驗證服務領域的技術積累，建立的標準化 、工程化 、系統化的GRP平臺，為中國研究型醫生提供科研服務，加快科研成果轉化。其中，多組學平臺包含蛋白質組學平臺和單細胞測序平臺：
·蛋白質組學平臺擁有多臺timsTOF Pro、Exploris 480高精度質譜儀，專業的Spectronaut Plusar、Mascot等分析軟件，提供專業的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組和Olink蛋白質組等檢測服務，強大的機器學習算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務，系統的生物標志物、分子分型、藥物靶點、基因功能研究等解決方案，真正讓廣大研究型醫生的科研工作更省心、更省力、更高效；
·單細胞測序擁有10x和BD兩個平臺，提供單細胞RNA-seq、單細胞核測序、單細胞混樣RNA-seq、單細胞（RNA+ATAC）、空間轉錄組測序等服務。 ,
近年來，蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合表現出強勁的增長勢頭。在Pubmed上不管是磷酸化蛋白質組，還是蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合的文章數量都在持續增加，且上升的趨勢同步。這也表明越來越多的研究者關注磷酸化的同時，也同時關注蛋白質組學水平的變化。Letpub數據顯示2021年國家自然基金批準的磷酸化研究突破了300項，總資助金額超過1.4億，其增長趨勢與文獻數增長趨勢也一致。蛋白質組研究的是蛋白表達變化，磷酸化蛋白質組研究的是蛋白的磷酸化修飾變化。兩組學聯合能解釋蛋白不同層面的信息，互為補充，為識別研究課題相關的磷酸化事件、關鍵信號通路和調控機制提供了一個全面的視角，有助于發現疾病靶點和生物標志物，輔助疾病的診斷與治療。
吉凱基因一直致力于提供專業的蛋白質組學服務，本次我們對蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合分析（以下簡稱聯合分析）進行了全面升級！產品詳情可點擊查看4.20日線上發布會視頻。
簡單來說，此次我們基于創新藥物靶點的科研與轉化需求以及高水平文章的生信分析內容進行了產品升級，新版報告具有4大核心看點，新增14項生信分析（累計基礎分析近30項）和3大高級服務，豐富度超過大多數同行！自2022年4月25日起，尚未進入生信分析的老合同（項目進展可查看吉凱推送的項目進展郵件）和新簽的蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合項目，即可享受全新升級分析，加量不加價！
新版聯合分析報告升級成網頁版，界面干凈、整潔。右側目錄欄幫助科研用戶快速知曉報告的主體內容，點擊主目錄可展開其子目錄，支持科研用戶隨心所欲切換到感興趣的條目上。新版報告內嵌了多重交互式體驗，比如增加浮動顯示窗，隱藏或展開分析結果，點擊下拉按鈕可切換分析結果以及網絡圖中的蛋白可任意拖動，讓整個報告更加人性化、個性化。
干凈整潔的報告界面
交互式的報告設計
2. 全面升級的生信分析：近30項基礎分析+3大高級服務
新版聯合分析報告包含3大分析模塊，對應從基礎到復雜的生信數據分析需求，幫助科研用戶由淺入深，循序漸進理解組學結果。此次新增venn、PCA、相關性分析、激酶-底物和弦圖以及激酶活性等14項分析，累計基礎分析達27項之多。同時為滿足科研用戶對激酶功能的深度科研需求，提供激酶樹、激酶抑制劑&藥物注釋服務和定制病毒等三大高級服務。
新版聯合分析基礎內容
3. 詳細的文獻注釋和圖表解釋：讓每一項分析都讀得懂，有據可依
新版聯合分析報告涉及高水平文獻37篇，讓整篇報告都有據可依。同時每一項分析都有明確的圖表說明和解釋，幫助科研用戶更好的理解和使用分析結果。
部分報告內容示例
4. 新增論文框架和投稿建議：想客戶所想，讓科研更輕松一點
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