我們特別選擇了一組2019冠狀病毒疾病血清樣本,這些樣本涵蓋了大量SARS-CoV-2特異性抗體濃度。通過對三聚體棘突蛋白和RBD蛋白用于血清學分析中檢測SARS-CoV-2特異性IgG。發(fā)現(xiàn)新冠病毒樣本的中值信號強度比對照樣本高400倍以上(圖5a)。統(tǒng)計分析顯示,S1單體和兩種RBD的ROC之間沒有差異,武漢和D614G三聚體棘突之間也沒有差異。此外,我們的結(jié)果表明,CHO產(chǎn)生的三聚體棘突比S1單體和RBD具有更高的診斷特異性和敏感性。
圖 5. CHO產(chǎn)生的三聚體棘突具有更高的診斷特異性和敏感性(a)在癥狀出現(xiàn)的第4-40天收集的對照血清(n=151)和 2019冠狀病毒疾病血清(n=72)進行了測試,并比較了免疫球蛋白G的濃度。(b)用 ROC分析(a)中檢測的血清。
Cytena單細胞打印機溫和篩選的原理保證了CHO具有較高的活性,為下游的擴展生產(chǎn)工藝奠定了基礎(chǔ),以提供足夠數(shù)量的具有哺乳動物型糖基化的三聚體SARS-CoV-2棘突蛋白。功能分析表明,三聚體SARS-CoV-2棘突蛋白能夠有效地阻斷病毒的傳染性。此外,三聚體棘突對SARS-CoV-2特異性IgG的診斷性能超過RDB和單體S1蛋白。
參考文獻:
[1].Kirtipal N , Bharadwaj S , Kang S G . From SARS to SARS-CoV-2, insights on structure, pathogenicity and immunity aspects of pandemic human coronaviruses[J]. Infection Genetics and Evolution, 2020, 85:104502.[1] Kirtipal N , Bharadwaj S , Kang S G . From SARS to SARS-CoV-2, insights on structure, pathogenicity and immunity aspects of pandemic human coronaviruses[J]. Infection Genetics and Evolution, 2020, 85:104502.
[2]. Pino P , Kint J , Kiseljak D , et al. Trimeric SARS-CoV-2 Spike Proteins Produced from CHO Cells in Bioreactors Are High-Quality Antigens[J]. Processes, 2020, 8(12).Pino P , Kint J , Kiseljak D , et al. Trimeric SARS-CoV-2 Spike Proteins Produced from CHO Cells in Bioreactors Are High-Quality Antigens[J]. Processes, 2020, 8(12).
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因此,認識和理解COVID-19感染途徑和發(fā)病機制對其防控和治療具有重要意義。作為新平臺,單細胞技術(shù)的成熟在整個生命科學領(lǐng)域的廣泛應用催生了許多重要的生物學發(fā)現(xiàn),也意味著在臨床研究上會有一批新的突破,所以單細胞分離篩選在SARS-CoV-2研究中起到尤為重要的作用。
新冠病毒的起源發(fā)展
自20世紀30年代末以來,人們就知道了動物冠狀病毒,最近的研究將Human coronaviruses (HCoVs)的進化與加速的城市化和家禽養(yǎng)殖聯(lián)系起來;這些做法允許頻繁的物種交換和簡化物種屏障的跨越,研究人員通過研究SARS-CoV-2和相關(guān)sarbecovirus (SARS-CoV-2屬于蝙蝠和穿山甲病毒的病毒群)的突變過程發(fā)現(xiàn)了相當顯著的變化,早在1983年,有證據(jù)強烈表明單峰駱駝是MERS CoV的重要宿主;據(jù)預測,這種祖?zhèn)鞑《緯尿鹕砩峡缭轿锓N屏障,進入單峰駱駝體內(nèi)。后來,穿山甲被認為是SARS-CoV-2的潛在中間宿主,因為它與穿山甲中的CoV具有99%的遺傳同源性;但它們都是在SARS-CoV-2出現(xiàn)在人類之前。這也說明,許多冠狀病毒具有“通才”的特性且在宿主之間跳躍能力明顯,而這一特性使得冠狀病毒可能在傳染給人類之前就已經(jīng)在蝙蝠中得到進化了[1]。

圖1. 冠狀病毒的起源和向人類的傳播途徑
大流行的人類冠狀病毒的棘突蛋白對于其進入人體細胞至關(guān)重要。事實上,大多數(shù)針對嚴重急性呼吸系統(tǒng)綜合冠狀病毒 2 (SARS-CoV-2) 的中和抗體是針對病毒表面暴露的棘突蛋白,使其成為疫苗和診斷測試的首選抗原。在當前大流行的背景下,全球?qū)坏鞍椎男枨笱杆僭黾樱磕昕赡艹^數(shù)百克至公斤。冠狀病毒棘突是高度糖基化的同源三聚體復合物,具有固有的結(jié)構(gòu)靈活性和不穩(wěn)定性。可制造性差現(xiàn)威脅到這些蛋白質(zhì)用于疫苗和診斷測試的可用性。所以尋求一種能夠穩(wěn)定生產(chǎn)三聚體棘突蛋白(Trimeric spike protein,S蛋白)的工藝尤為重要。
SARS-CoV-2 S蛋白的設(shè)計
SARS-CoV-2 S蛋白的編碼DNA的密碼子經(jīng)過優(yōu)化,一共設(shè)計了11個DNA結(jié)構(gòu)體(圖2),并由ATUM公司合成。添加了一個功能性IgG先導序列來介導有效的信號肽切割。添加編碼組氨酸(8-聚體)的DNA用于羧基末端表達。如前所述,furin裂解位點RRAR突變?yōu)榉枪δ苄浴T谌垠w設(shè)計中,將跨膜區(qū)和C端細胞內(nèi)的尾端去除,用一個T4折疊子序列取代。對于RBD片段(aa319-541),添加了IgG leader和His標簽序列。由于攜帶D614G氨基酸變化的SARS-CoV-2變異體的廣泛出現(xiàn),本研究中也包括了這種棘突蛋白變異 。
圖 2. Schematic representation of SARS-CoV-2 spike protein designs.
單克隆細胞株的篩選和三聚體棘突蛋白表達
采用CHO4Tx的轉(zhuǎn)染試劑,在無動物來源的培養(yǎng)基中,將包含SARS-CoV-2 棘突蛋白的DNA序列的pXLG-6載體轉(zhuǎn)染CHOExpressTM細胞。該載體包括用于嘌呤霉素抗性標記物的表達盒。轉(zhuǎn)染后的細胞用嘌呤霉素進行篩選,對于wuhan突變毒株,采用德國 cytena 的 f.sight 單細胞打印機篩選單克隆細胞株。將高水平表達的三聚體S蛋白和RDB單體的細胞株擴增并凍存。RBD棘突片段的重組細胞系和三聚體S蛋白的克隆細胞系在優(yōu)化的補料分批工藝中,以0.2-,10-和50-L的生物反應器中放大培養(yǎng)。
從300個單克隆衍生的細胞群中,挑選出三聚體棘突(trimeric spike)和受體結(jié)合域(RBD)表達水平最高的細胞群進行擴增,并開發(fā)了補料分批生產(chǎn)工藝。生產(chǎn)過程逐步擴大到200mL搖瓶、10L和40L攪拌槽生物反應體系。活細胞密度(VCD)和存活率可保持高達10天(圖3)。觀察到三聚體棘突蛋白和RDB單體在各種培養(yǎng)規(guī)格下最終收獲滴度均為數(shù)百毫克/升。
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