苦于多基因 or LncRNA敲除的同學,你的福音來啦!-技術前沿-資訊-生物在線

苦于多基因 or LncRNA敲除的同學,你的福音來啦!

作者:上海吉凱基因醫學科技股份有限公司 2021-02-26T10:55 (訪問量:12142)

我們都知道基因剪刀CRISPR/CAS9技術今年大火,之所以這個技術這么火和其對基因操作的方便性,高效性,準確性及高性價比是分不開的。CRISPR/Cas9是一種能夠對任何物種基因組的特定位點進行精確編輯的技術。其原理是核酸內切酶Cas9蛋白通過導向性RNA (guide RNA, gRNA) 識別特定基因組位點并對雙鏈DNA進行切割。一旦DNA鏈被切開后就能對特定基因引入敲除、敲入、突變等編輯。


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圖注:基于非同源末端修復和同源重組原理可進行基因敲除,敲入和突變等操作


然而基于傳統的sgRNA載體的CRISPR-CAS9技術,由于僅靶向一個位點,所以更適合單個編碼基因的敲除,對于多個編碼基因和非編碼基因則需要同時導入多個sgRNA載體/病毒,使操作難度上升不小。


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圖注:單sgRNA系統針對一個位點進行編輯


為解決多個編碼基因同時敲除和lncRNA敲除的需求,Multiplex sgRNA 技術應運而生


Multiplex sgRNA system
可同時插入不同的sgRNA,幫助解決同時敲除多基因或非編碼基因編輯的需求??梢酝瑫r插入2~5sgRNA符合不同的實驗需求。


針對多個編碼基因其敲除策略可以為:


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圖注:同時設計兩個或多個編碼基因的特異性sgRNA序列,插入載體中可在一次操作后敲除多個編碼基因


而針對非編碼基因或區域其策略可以是:


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圖注:針對想要敲除的非編碼基因或區域兩頭設計特異性sgRNA序列,靶向切除整段非編碼區域,以達到非編碼基因敲除的目的


對于通路研究的同學來說,有時需要同時抑制多個通路,而通路抑制劑還是蠻貴的,如果有了可靠的通路關鍵基因的sgRNA序列,那就可以像通路抑制劑一樣使用CRISPR/CAS9技術來同時抑制多個信號通路了,大大提高了性價比。對于Car-T研究的同學來說,編輯T細胞制作UCAR-T的時候需要同時敲除多個檢查點基因使得CAR-T細胞標準化和可量產化,這時同時導入多個sgRNA就可以方便的滿足這一要求。




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