深度空間代謝組學常見Q&A(四)| 空間分辨率-自主發布-資訊-生物在線

深度空間代謝組學常見Q&A(四)| 空間分辨率

作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2022-06-09T11:55 (訪問量:5183)


各位看官大家好!新一期空間代謝組Q&A又來了!在上一期中,我們介紹了空間代謝組學的數據分析和清洗策略(點擊閱讀)。這一期,我們將為大家介紹說明空間代謝組學中的空間分辨率。


Q1 什么是空間分辨率?

空間分辨率的定義是一張圖像上能進行詳細區分的最小像素單元的大小,通常來講空間分辨率越小,圖像包含的信息越多,識別能力也越強。通常一張空間分辨率為50μm圖片的信息量約是100μm圖片的4倍。


Q2 空間代謝組學中空間分辨率由什么決定?

基于質譜的空間代謝成像時,離子源檢測的單位離子化面積的大小,就是空間代謝的空間分辨率??臻g分辨率越小,成像譜圖越精細,同時單位時間內能檢測的樣本面積就越小,完成樣本檢測的整體耗時就越長。


Q3 空間分辨率大小在生物樣本分析中的意義是什么?

空間分辨率越小,更容易發現獨特代謝群體,揭示組織代謝的異質性。

舉例來說,如果一張組織切片全部由直徑10μm的細胞組成,50μm空間分辨率成像單個像素大小為50μm*50μm,即每個像素點約是25個細胞的平均代謝物信息,100μm空間分辨率的每個像素約是100個細胞的平均代謝物信息。顯而易見的是50μm成像相比100μm成像更容易檢測到具有獨特代謝模式的細胞亞型或者區域,并避免受到其它細胞群體覆蓋。


圖1 空間分辨率示意圖


Q4 高分辨率成像的挑戰是什么?

在傳統空間代謝分析平臺上,實現高分辨率空間代謝組學成像是一件十分具有挑戰性的工作。需要考慮兩點,第一是需要實現可精準控制的離子源,避免成像過程中離子化面積不可控,使圖像代謝物分布出現誤差。第二是因分辨率提高,每個像素點包含的細胞數減少,代謝物總量下降,導致檢測中代謝物整體豐度降低,致使最終檢測結果中的定性的謝物總數減少。


Q5 中科新生命深度空間代謝組如何實現高分辨率成像?

中科新生命引進Bruker推出的新一代Tims-TOF MALDI 2空間代謝分析平臺開發,針對高分辨率成像提出了特有的解決方案。該機型使用新一代獨家MALDI 2離子源,該離子源利用激光激發代謝物離子化,相對其它技術諸如帶電液滴和氣流離子束策略更便于控制,是高分辨率空間成像的不二選擇。MALDI 2同時還在原MALDI技術上進行迭代,通過兩次激發提升低豐度和中性代謝物信號強度,保證了在高分辨率成像下的代謝物檢測數量,實現“真”高分辨率空間代謝成像。


感興趣的老師可聯系當地銷售,或掃描下方二維碼添加“中科新生命企業微信助手咨詢



中科優品推薦

深度空間代謝組學:
· MALDI 2離子化策略—檢測更靈敏、覆蓋更全面;
· 離子淌度分離—離子利用更高效、鑒定更準確

上海中科新生命生物科技有限公司 商家主頁

地 址: 上海市園美路58號1號樓15-18樓

聯系人: 徐

電 話: 021-54665263

傳 真:

Email:marketing@aptbiotech.com

相關咨詢
ADVERTISEMENT