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客戶文章集錦 | 轉錄-蛋白聯合分析碩果累累

作者：上海中科新生命生物科技有限公司 2021-12-25T18:31 (訪問量:4480)

生物學現象復雜多變，基因表達調控復雜，傳統單一層面的組學研究比如基因組，轉錄組，蛋白組，代謝組等研究手段能夠在一定程度上對特揭示遺傳信息、蛋白功能或代謝通路進行闡釋。但是，僅通過單一組學數據很難對復雜的生物網絡調控進行更加系統性更全面的解釋，不足以解釋遺傳信息表達調控的傳遞鏈條。

轉錄組學和蛋白質組學都是用來檢測基因在不同分子層面的表達水平，有越來越多的科研工作者選擇以轉錄組+蛋白質組聯合的方式去研究基因表達調控機制?！?strong>中科新生命】自發布轉錄-蛋白聯合分析產品以來，獲得廣大科研工作者的青睞，收獲頗豐。下面就分享幾篇轉錄-蛋白聯合分析的客戶文章，希望能幫助各位小伙伴們開啟新的科研思路，助力新的發現~


01 轉錄-蛋白聯合研究氧化鋅暴露造成神經毒性的分子機制

文章名稱：Intranasal exposure to ZnO nanoparticles induces alterations incholinergic neurotransmission in rat brain

發表期刊：《Nano Today》

合作單位：中國科學院生態環境研究中心

研究簡介：

納米技術的出現引發了從機器到藥物的新型商業產品浪潮，帶來了深遠的社會和經濟效益。與此同時，由于人類接觸納米粒子 (NPs) 的前所未有的途徑，潛在的人類健康風險越來越引起人們的關注。全面了解 NPs 的毒性可以帶來更安全的設計，并減少 NPs 的副作用或意外后果。研究表明吸入氧化鋅納米顆粒（NPs）會造成神經毒性，但其分子機制尚不清楚。本研究將大鼠分別暴露于氧化鋅及硫酸鋅，并通過影像學、轉錄-蛋白質多組學揭示了氧化鋅暴露造成神經毒性的分子機制，為安全設計氧化鋅納米顆粒提供了依據。

聯合分析展示：


轉錄-蛋白數據揭示膽堿能神經傳遞在氧化鋅暴露神經毒性中起到重要作用


02 轉錄-蛋白多組學聯合分析人參皂苷的抗癌活性

文章名稱：20(S)-protopanaxatriol promotes the binding of P53 and DNA to regulate the antitumor network via multiomic analysis

發表期刊：《Acta Pharmaceutica Sinica B》

合作單位：南開大學

研究簡介：

盡管已知腫瘤抑制因子 P53 可調節廣泛的信號通路網絡，但仍不清楚某些藥物如何影響這些 P53 信號通路網絡。人參皂苷是一種傳統中藥，人參的活性成分已被證明可有效治療多種癌癥疾病。然而，人參的傳統用法往往涉及多種草藥的多種成分，因此，人參的作用機制模糊不清，難以辨別。與宿主蛋白相互作用用于癌癥治療的特定人參皂苷成分仍然未知。在這項研究中，作者使用轉錄組和蛋白組等多組學分析揭示 P53 蛋白是影響人參皂苷抗腫瘤活性的潛在關鍵靶點。該結果不僅為驗證靶蛋白和篩選復雜混合物的活性成分提供了新的策略，而且發現了促進P53與DNA相互作用的有力成分，推動了P53相關疾病的治療。

聯合分析展示：


轉錄-蛋白聯合分析揭示人參皂苷的抗腫瘤活性與 P53 密切相關


03 轉錄組+蛋白質組聯合助力生理分子機制研究

文章名稱：Integrative transcriptome and proteome analyses provide new insights into different stages of Akebia trifoliata fruit cracking during ripening

發表期刊：《Biotechnol Biofuels》

合作單位：中國農業科學院麻類研究所

研究簡介：

三葉木通是一種重要的油料經濟作物。然而，在果實成熟的過程中往往會出現開裂的情況，從而更易造成病蟲害導致減產。為了研究果實開裂的分子機制，研究團隊采用了細胞器形態學觀察、轉錄組學+蛋白質組學聯合分析、靶向蛋白質組驗證（PRM）的研究手段，發現：(1) 在開裂的果實中，它們的細胞壁會在前期變薄及更松散；(2) 轉錄+蛋白質組聯合分析顯示：細胞壁代謝相關基因，例如果膠裂解酶、果膠酯酶、β-半乳糖苷酶等在開裂果實中顯著上調；本次研究成果為三葉木通的分子育種提供了有用的分子機制基礎。

聯合分析展示：


轉錄-蛋白鑒定參與果實破裂的潛在基因/蛋白質

04 轉錄組+蛋白組聯合揭秘枇杷花的發育機制

文章名稱：An Integrative Analysis of Transcriptome, Proteome and Hormones Reveals Key Dierentially Expressed Genes and Metabolic Pathways Involved in Flower Development in Loquat

發表期刊：《International Journal of Molecular Sciences》

合作單位：西南大學

研究簡介：

枇杷是薔薇科重要的熱帶和亞熱帶果樹樹種，其生殖發育是一個不受冬季休眠干擾的連續過程，幾乎所有生長在枇杷樹上的枝都是開花的枝，而圓錐花序的數量幾乎每年保持不變。因此，研究枇杷花發育的調控機制有助于更好地了解薔薇科植物的開花過程。本研究從花芽分化(FBD)、花芽伸長(FBE)和花開花(FA)三個方面，使用轉錄組和蛋白質組測序，通過對一些關鍵的DEGs、代謝途徑和內源激素的分析，揭示了關鍵的開花基因和代謝途徑。為進一步闡明枇杷和其他薔薇科植物的花發育機制提供了豐富的序列資源。

聯合分析展示：



轉錄-蛋白數據表明淀粉和蔗糖代謝相關基因在花發育過程中起著關鍵作用


05 轉錄-蛋白組學聯合揭示壇紫菜抗逆機制

文章名稱：Multi-omics responses of red algae Pyropia haitanensis to intertidal desiccation during low tides

發表期刊：《Algal Research》

合作單位：上海海洋大學

研究簡介：

紫菜，因其獨特的風味而在世界范圍內廣受歡迎。近年來，海水養殖場經常遇到被稱為“溫度回升”的異常天氣，期間急劇升高和持續的高溫（28～30℃）顯著抑制了壇紫菜生長，導致其產量下降。因此，迫切需要建立壇紫菜分子育種體系以加快育種進程和效率，其中抗逆分子機制分析和抗逆基因篩選是關鍵步驟。在本研究中，使用轉錄組和蛋白質組分析確定葉狀體對單重干燥脅迫 (SS) 和干燥、高溫和強光三重脅迫 (TS) 的多組學響應。該研究結果為提高對全球變暖引起的非生物脅迫的抗性的品種的育種策略提供了寶貴的見解。

聯合分析展示：


轉錄-蛋白數據揭示壇紫菜響應脅迫的分子機制

轉錄-蛋白強強聯合

◆ 兩組學數據信息互補，對生物體特定狀態下的生理機制進行全方位解析；

◆ 分析同一基因轉錄水平和翻譯水平的變化，全面挖掘關鍵基因表達調控機制；

◆ 轉錄組可以為蛋白組提供更完整的數據庫，提高蛋白鑒定數目和質量。

轉錄-蛋白聯合分析流程圖

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