Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit ——文庫轉化率高達60%,極其適用FFPE、cfDNA樣本-其它資料-資訊-生物在線

Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit ——文庫轉化率高達60%,極其適用FFPE、cfDNA樣本

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2017-10-23T00:00 (訪問量:10515)

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Hieff NGSTM?MaxUP II DNA Library Prep Kit

——文庫轉化率高達60%,極其適用FFPE、cfDNA樣本

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DNA?文庫構建是NGS樣本制備的核心環節。文庫質量直接影響測序數據質量——如mapping rate、coverage、complexitybias。要想獲得好的文庫,必須選擇好的建庫試劑盒,而建庫試劑盒的關鍵,在于其文庫轉化率,即DNA片段雙端接頭連接效率,因為只有雙端連接成功的DNA,才能夠被有效擴增最終成為測序模板。

“DNA run”的圖片搜索結果

產品特點

Hieff NGSTM?MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina?采用高質量的酶學組成,改進型接頭連接技術以及具有強擴增效率的高保真酶,顯著提高文庫轉化率與擴增效率,助理完成更好。

*??適用500 pg-1 μg所有DNA樣本

*??業界**文庫轉化率,高達60%

*??產品優異性能已在基因組、FFPE、cfDNA等多種樣本中驗證

*??2.5小時內收獲優異文庫?,PCRPCR-free方式均可

*??全程控制原料、人員、工藝與質量,全力保障批次性能與穩定性

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1.?文庫轉化效率高達60%


文庫轉化率,即DNA片段雙端接頭連接效率。只有雙端連接成功的DNA,才能夠被有效擴增最終成為測序模板。

1?Agilent?2100?檢測350bp平末端DNA片段單端和雙端連接產物峰。

0350bpDNA片段峰、1:單端接頭連接產物峰、2:雙端接頭連接產物峰。測試基于各公司的標準protocol進行。

2?接頭連接效率百分比(%)。

對圖1峰面積進行積分后的定量結果顯示Hieff NGS? MaxUp II Kit?的雙端連接效率可達60%。

2.?不同GC樣本,擴增效率測試

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Hieff NGS? MaxUp II Kit中使用具有強擴增效率的Super CanaceTM?High-Fidelity Mix用于文庫擴增。以1 ng GC含量分別為38%50%、70%400 bp DNA片段為起始樣本,12 cycles擴增,Qubit檢測不同試劑盒所得產物濃度,Super Canace表現極佳。

1?擴增模塊效率比較。

產品名稱

GC 38% (ng)

GC 50% (ng)

GC 70% (ng)

Super CanaceTM?High-Fidelity Mix

25.6

18

17.1

K*-HiFi mix

15.8

16.7

21.1

3. FFPE、cfDNA樣本,?文庫產量測試

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Hieff NGS? MaxUp II KitFFPEcfDNA為起始樣本建庫,相對同類型試劑盒品牌?K*,在相同擴增循環數下,獲得更多文庫產量。

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樣本

100 ng FFPE

5 ng cfDNA

7 cycles (ng)

10 cycles (ng)

9 cycles (ng)

12 cycles (ng)

MaxUP II

400

2000

120

1200

K*?品牌

150

1100

100

1080

注:FFPE樣本來自小鼠肺蠟塊,固定時間6個月;cfDNA樣本來源于血漿。

4.?無偏好性的測序質量

在不同GC含量樣本中,使用Hieff NGS? MaxUP II Kit均能獲得堿基質量好且覆蓋度均一的測序數據。

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