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Carrier RNA常見類型、作用原理及優(yōu)缺點介紹

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2022-07-06T09:23 (訪問量:4429)

Carrier RNA常見類型、作用原理及優(yōu)缺點介紹

1. Carrier RNA概念及作用

熒光定量PCR是分子診斷主流技術(shù),包括核酸提取和PCR擴增兩個環(huán)節(jié),兩者共同決定了該檢測方法的評測參數(shù)。以最直觀最關(guān)鍵的檢測靈敏度指標來看,只有實現(xiàn)了提取環(huán)節(jié)最優(yōu)化和PCR擴增環(huán)節(jié)最優(yōu)化的情況下,檢測靈敏度的結(jié)果才更可信。檢測靈敏度顯示了檢測試劑的檢測下限,對于熒光定量PCR而言,即一定樣本濃度下的病毒核酸檢出率。

Carrier RNA,中文名載體RNA,又叫核酸助沉劑。在核酸提取環(huán)節(jié),提取使用到的離心管壁多是聚丙烯的材料,管壁上有靜電,會吸附核酸。在提取純化過程中采用Carrier RNA 可幫助核酸去除靜電效應,保證核酸能很好被吸附到純化柱上,提高洗脫效率,從而達到盡可能多的回收樣本中核酸!

2. Carrier RNA常見類型

作為核酸沉淀的輔助物質(zhì),Carrier RNA有多種類型。

類型

代表物質(zhì)

作用原理

多聚糖

糖原

RNA在高鹽、無水乙醇環(huán)境中溶解度很低,通過高速離心可發(fā)生沉淀。當RNA濃度很低時,微量RNA不足以形成沉淀。在上述環(huán)境條件下,糖原也不可溶并可與RNA共沉淀,形成可視化沉淀。

核酸混合物

PolyA鉀鹽、大腸桿菌總RNA、酵母總RNA、tRNA等

減少吸附損失,降低核酸酶攻擊待提取核酸的概率。

其他

線性化丙烯酰胺

減少吸附損失


3. 產(chǎn)品介紹——上海翌圣生物生產(chǎn)的Carrier RNA

翌圣生物Carrier RNA是酵母來源的RNA,無DNase、RNase酶殘留,蛋白和DNA殘留含量極低。可用于病毒核酸提取、微量DNA提取等實驗,提取的核酸可用于后續(xù)RT-PCR,RT-qPCR等實驗。產(chǎn)品分為液體和凍干型粉末制劑,便于直接使用和長距離運輸、保存。

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品編號

規(guī)格

保存條件

Carrier RNA, 6 μg/μL

19701ES03

1 mL

-20℃保存,可保存2年

Carrier RNA Powder, 216 μg/tube

19703ES01

1 tube

室溫保存,可保存1年

Carrier RNA Powder, 310 μg/tube

19704ES01

1 tube

室溫保存,可保存1年

本品為核酸混合物,產(chǎn)品使用非常簡單,在純化核酸過程中通過添加微克量(μg)的Carrier RNA,即可實現(xiàn)提升低至皮克級別(pg)微量核酸的沉淀效率,達到提升試劑檢測靈敏度的目的。

其作用原理主要是通過混入大量核酸(Carrier RNA),減少了目標核酸物質(zhì)的管壁吸附損失,進而提高微量的核酸純化柱上的結(jié)合和洗脫效率,同時降低了提取環(huán)境中的RNase降解微量RNA的概率。


4. 應用案例

● Carrier RNA的加入有助于低豐度SARS-CoV-2假病毒核酸檢測

使用磁珠法拭子樣本病毒DNA/RNA提取試劑盒,提取不同濃度的SARS-CoV-2假病毒樣本核酸,后續(xù)使用新冠檢測試劑盒進行檢測N基因。結(jié)果顯示,添加Carrier RNA后,具有更高的提取效率,使下游檢測更靈敏。

Ct值

0 copies/mL

125 copies/mL

250 copies/mL

500 copies/mL

1000 copies/mL

NTC

不加carrier RNA

N/A; N/A; N/A

N/A; N/A; N/A

N/A; 40.4; N/A

N/A; 40.16; 40.88

38.05; 38.02

N/A; N/A; N/A

加carrier RNA

N/A; N/A; N/A

N/A; 40.54; N/A

40.2; 40.29; 38.95

38.61; 39.03; 38.59

37.53; 36.34

圖片.png

見圖1-1

Carrier RNA放置于65℃不同時間(3d,6d,9d)后,與提取性能標準保存條件一致

Carrier RNA粉末分別放置于65℃ 3d,6d,9d進行加速試驗測試,測試方案為:使用磁珠法拭子樣本病毒DNA/RNA提取試劑盒,提取不同濃度的SARS-CoV-2假病毒樣本核酸,后續(xù)使用新冠檢測試劑盒進行檢測orf1abN基因。結(jié)果顯示,與標準保存條件(-20℃)相比,置于65℃保存9天的Carrier RNA,性能不發(fā)生變化。

VIC:

  • Ct值

    0 copies/mL

    250 copies/mL

    500 copies/mL

    1000 copies/mL

    2000 copies/mL

    NTC

    65℃ 3天

    36.32; 36.03; 36.26

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