純度高、活性強!GMP級別RNase R,助力環狀RNA研究與藥物開發-技術前沿-資訊-生物在線

純度高、活性強!GMP級別RNase R,助力環狀RNA研究與藥物開發

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2025-06-30T00:00 (訪問量:42562)

 

circRNA生產過程包括:模板制備、體外轉錄、DNA模板去除、環化和純化。在RNA環化后需要用核糖核酸酶R (Ribonuclease R, RNase R)對未環化的RNA進行消化,達到富集circRNA的目的。當前主流使用的RNase R主要為進口品牌,存在價格高、貨期久等問題,不適合用于大批量生產。

    

翌圣擁有ZymeEditor酶改造平臺和專門為GMP級別產品打造的分子酶生產基地,研發生產出純度高、消化活性強的GMP級別RNase R產品,為新一代RNA疫苗/藥物上市提供助力!

 

 

圖1.環狀RNA 生產流程圖

(來源:Front Immunol 2023 Jan 12:13:1091797. doi: 10.3389/fimmu.2022.1091797. eCollection 2022.)

   

RNase R(Ribonuclease R, RNase R)是一種來源于大腸桿菌的Mg2+依賴性3'→5'核糖核酸外切酶,它能消化所有的線性RNA,不易消化circRNA、套索RNA或3’端突出末端少于7 個核苷酸的雙鏈RNA分子。RNase R常用于去除線性RNA分子,實現富集circRNA和套索RNA等非線性RNA的目的。

   

主要應用場景為:

1)基因表達研究;

2)可變剪切研究;

3)從生物樣本中富集 circRNA;

4)識別內含子套索結構 RNA;

5)鑒定外顯子 circRNA。

  

產品特點

· 

蛋白純度(SDS-PAGE)≥95%;

· 

無核酸外切酶殘留;

· 

與競品相比,產品消化線性RNA能力相當;

· 

與競品相比,產品對circRNA富集作用相當。

應用案例

案例一

與A進口品牌RNase R產品消化線性RNA能力相當

圖.翌圣RNase R產品與A進口廠家RNase R產品消化線性RNA能力比較:將翌圣RNase R產品與A進口廠家RNase R產品分別投入含有線性RNA底物的反應體系中進行反應,結果顯示當RNase R產品的投入量達到2-4 U時,可觀察到RNA條帶變微弱甚至消失,表明RNase R對線性RNA分子具有消化作用,且翌圣RNase R產品與A進口廠家RNase R產品對線性RNA分子的消化能力相當。

 

與A進口品牌RNase R產品對circRNA富集作用相當

案例二

圖.翌圣RNase R產品與A進口廠家RNase R產品對circRNA的富集作用比較:將翌圣產品與A進口廠家RNase R產品分別投入含有circRNA底物的反應體系中進行反應,結果顯示經過翌圣RNase R產品與A進口廠家RNase R產品處理后的RNA條帶亮度基本無差別,表明circRNA能耐受RNase R的消化。以上結果證實翌圣產品與A進口廠家RNase R產品均能有效用于circRNA富集。

案例三

翌圣RNase R對線性RNA的切割效果優于其他品牌

圖.翌圣產品與廠家A和B的RNase R消化線性mRNA分子效果比較:將翌圣RNase R產品與廠家A和B的RNase R產品分別投入含有1 μg 線性mRNA底物的反應體系中進行反應,結果顯示翌圣RNase R產品對線性RNA的消化效果優于廠家A和B的RNase R。

 

產品性能

蛋白純度(SDS-PAGE)≥95%

圖.蛋白純度檢測:使用SDS-PAGE技術檢測產品的蛋白純度,從左到右依次為相同產品濃度下不同體積(1 μL,2 μL,3 μL)的結果,結果表明翌圣RNase R產品蛋白純度≥95%。

 

無核酸外切酶殘留

圖.核酸外切酶殘留檢測:將20 U 翌圣RNase R加入到 0.5 μg λDNA- Hind Ⅲ digest中,于37℃孵育4小時,之后進行瓊脂糖凝膠電泳 ,結果顯示DNA 條帶未發生變化,說明翌圣RNase R產品無核酸外切酶殘留。

  

翌圣環狀RNA 解決方案

 

  

產品信息

應用場景

產品名稱

產品貨號

模板制備

BspQI GMP-grade (10 U/μL)

10664ES

Bsa I GMP-grade (20 U/μL)

10661ES

體外轉錄

T7 High Yield RNA Synthesis Kit

10623ES

Hieff® T7 RNA Polymerase GMP-grade (low dsRNA, 250 U/μL)

10629ES

T7 RNA Polymerase GMP-grade (250 U/μL)

10625ES

Pyrophosphatase, Inorganic GMP-grade (1 U/μL)

10620ES

Murine RNase inhibitor GMP-grade (40 U/μL)

10621ES

10× Transcription Buffer 2 GMP-grade

10670ES

ATP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10652ES

CTP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10653ES

UTP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10654ES

GTP Tris Solution GMP-grade (100 mM)

10655ES

環化

T4 RNA Ligase 2

14652ES

T4 RNA Ligase 1

14651ES

純化

RNase R (20 U/μL)

14606ES

RNase R GMP-grade (20 U/μL)

14615ES

10×RNase R Reaction Buffer GMP-grade

14616ES

參考文獻:

1. Qu L, Yi Z, Shen Y, et al. Circular RNA vaccines against SARS-CoV-2 and emerging variants. Cell. 2022;185(10):1728-1744.e16. doi:10.1016/j.cell.2022.03.044

2. Chen L, Wang C, Sun H, et al. The bioinformatics toolbox for circRNA discovery and analysis. Brief Bioinform. 2021;22(2):1706-1728. doi:10.1093/bib/bbaa001

 

 

 

 

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