小螢問號第二十二期(一種有助于確定RNA命運的蛋白質)-技術前沿-資訊-生物在線

小螢問號第二十二期(一種有助于確定RNA命運的蛋白質)

作者:西安百螢生物科技有限公司 2018-09-20T09:05 (訪問量:7312)

這一期我們講的是,一種有助于確定RNA命運的蛋白質。

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DNA轉錄后,RNA可以進入許多命運。雖然最熟悉的途徑可能直接導致蛋白質的產生,但RNA分子本身也可以變得能夠改變基因的表達。新研究有助于解釋如何實現RNA序列的命運。

在洛克菲勒大學8月27日發表的一項研究中,洛克菲勒大學的科學家和哥倫比亞大學的一位同事發現了一種蛋白質,它可以識別RNA序列上的化學指令標簽,這是決策過程中的重要一步。

“這種標記,稱為m6A,是四十多年前在RNA序列上發現的。從那以后,這個豐富的標簽已經涉及影響蛋白質生產的幾個重要過程,以及所謂的microRNAs,“研究作者Sohail Tavazoie,Leon Hess副教授,伊麗莎白和Vincent Meyer實驗室負責人說。系統癌癥生物學。(Micro-RNAs是一種小RNA分子,不會編碼蛋白質,反而會降低基因的活性。)

“然而,”Tavazoie說,“一個揮之不去的問題仍然存在:什么在細胞核內讀取這種化學標簽?我實驗室的研究員ClaudioAlarcón發現了一種這樣的“讀取”蛋白質。由于所涉及過程的基本性質,這一發現對細胞的正常功能和疾病都有影響。“

該標簽稱為m6A,是與腺苷的特定部分連接的甲基,腺苷是RNA序列的一個組成部分。在之前的工作中,Alarcón及其同事將m6A標簽鑒定為microRNA生成的重要調節因子。已經知道放置這種標簽的“作者”蛋白質標記需要在它們被翻譯成蛋白質之前進行剪接的RNA分子。許多基因含有必須切除的切片,RNA剪接過程對細胞的功能和特性至關重要。

最近的實驗表明,新發現的讀取器,一種稱為HNRNPA2B1的蛋白質,可以識別RNA上的m6A標記,這些標記注定了兩種不同的命運:修剪成為microRNA或剪接以正確生成蛋白質。在識別microRNA前體上的m6A標簽后,HNRNPA2B1然后募集切割機器,負責進一步修剪和處理這些RNA分子。未來的工作需要了解HNRNPA2B1如何與參與RNA剪接的蛋白質相互作用。

研究人員懷疑HNRNPA2B1蛋白是一種閱讀器,因為他們發現它經常與m6A標簽附著的RNA分子上的相同位點結合。為了確定所謂的讀者在那里做了什么,該團隊減少了它在細胞中的存在。

HNRNPA2B1水平降低的細胞中,他們發現microRNA的整體表達發生了變化,許多microRNA減少了。他們還研究了用于剪接的RNA的影響。在這里,他們也發現了不同RNA分子拼接的變化,這些變化依賴于m6A標簽。

HNRNPA2B1是第一個被鑒定的m6A核讀取器,來自實驗的證據表明在細胞核內還存在可識別該標簽的額外讀者。

“這種新型m6A閱讀器的發現對各種各樣的過程產生了影響,”Alarcón說。“RNA剪接確立了細胞中可用蛋白質的所有組成成分。同時,microRNA的異常與包括癌癥在內的多種疾病有關。這項工作也有助于越來越多的證據表明超出RNA序列的信息,如化學修飾,可以決定RNA分子的最終命運和功能?!?/span>

圖片:準備閱讀:新識別的蛋白質HNRNPA2B1(綠色)識別m6A標簽,位于細胞核(藍色)內。肌動蛋白絲是細胞結構的重要元素,呈紅色。圖片來源:Lisa Noble和Gloria Wu

科學新聞參考:

HNRNPA2B1是m6A依賴性核RNA加工事件的介質。ClaudioR.Alarcón,Hani Goodarzi,Hyeseung Lee,Xuhang Liu,Saeed Tavazoie和Sohail F. Tavazoie。Cell,2015。http ://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674 (15)01024-7 。

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